| 研究課題/領域番号 |
20K21281
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| 研究種目 |
挑戦的研究(萌芽)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
中区分38:農芸化学およびその関連分野
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| 研究機関 | 九州大学 |
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研究代表者 |
沼田 倫征 九州大学, 農学研究院, 准教授 (10401564)
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| 研究期間 (年度) |
2020-07-30 – 2023-03-31
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| キーワード | 非コードRNA / リボスイッチ / 遺伝子の発現調節 / 細菌 / PreQ1 / tRNA / RNA合成 |
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| 研究成果の概要 |
本研究では、ジベンゾフラン環化合物の化学構造を基盤にして誘導体を合成した。誘導体のin vitroにおける転写終結活性を、RNAポリメラーゼを用いた転写アッセイにより評価した。その結果、2種類の誘導体の活性が親化合物と比較して上昇していた。次に、これら誘導体とPreQ1リボスイッチとの複合体の結晶構造を分子置換法により決定した。その結果、PreQ1が結合する部位に合成化合物が結合していることが明らかになった。また、リボスイッチで保存された塩基とのスタッキングにより結合が安定化されていることが分かった。さらに、合成化合物とリボスイッチとの間に水素結合も形成されていることが明らかになった。
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| 自由記述の分野 |
応用生物化学
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
感染症に対する医薬品は低分子医薬が主流であるが、多剤耐性菌が出現し問題となっている。この克服には新規な抗生剤の開発が不可欠である。本研究では、細菌RNAを標的とした新規薬剤の創製を目指して実験を実施した。対象としたRNAは細菌に特有のPreQ1リボスイッチであり、PreQ1の生合成に関わる遺伝子の発現をPreQ1濃度に応じて調節する。PreQ1はtRNAのアンチコドン1字目に存在する修飾ヌクレオシドの一つであるキューオシンの前駆体であり、正確なタンパク質の合成に重要である。従って、PreQ1リボスイッチと結合する合成化合物を取得すれば、RNAを標的とした新規抗生剤の開発に繋がると考えられる。
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