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2023 年度 研究成果報告書

サクラクローン品種をモデルとした代謝エピゲノムによる樹齢推定

研究課題

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研究課題/領域番号 20K21344
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分40:森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野
研究機関国立研究開発法人森林研究・整備機構

研究代表者

松本 麻子  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (90353862)

研究分担者 草野 都  筑波大学, 生命環境系, 教授 (60415148)
福島 敦史  京都府立大学, 生命環境科学研究科, 教授 (80415281)
加藤 珠理  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (90467217)
研究期間 (年度) 2020-07-30 – 2024-03-31
キーワードエピゲノム / サクラ / クローン品種
研究成果の概要

サクラ栽培品種“染井吉野”を対象に、加齢によるDNA修飾とそれに伴うメタボロームの変化を捉えることを目的として、エピゲノム解析を行った。北海道、関東、中部、九州で育成された個体でゲノム全体のDNAメチル化レベルを把握し、異なる環境下でメチル化レベルが変化していた遺伝子群について遺伝子オントロジー解析を行ったところ、メチル化レベルやメチル化を受けた遺伝子の機能的特徴には南北でクラインがみられた。同じ環境下で生育した異なる樹齢の個体間では、メチル化レベルに大きな違いは検出されなかった。接木等で増殖した個体の樹齢については、エピゲノムのリプログラミングの有無を明らかにする必要が示唆された。

自由記述の分野

森林遺伝

研究成果の学術的意義や社会的意義

長命な樹木種におけるゲノムのメチル化については不明なことが多いが、ヒトなどではすでに塩基配列 の変異を伴わないエピジェネティックな DNA 修飾が遺伝子の転写に影響を与え、細胞全体の生態にも影響し得ることが知られている。この研究課題は樹木がなぜ長寿で、加齢とともに樹体内ではどのような変化が起きているのか、そこにゲノムのメチル化がどう影響するかを明らかにする端緒となり、樹齢を推定するだけでなく、個体の健全性などの簡便な評価手法の開発につながる成果である。また、長命という生命現象を探る上での重要な知見となった。

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公開日: 2025-01-30  

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