| 研究課題/領域番号 |
20K21386
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| 研究種目 |
挑戦的研究(萌芽)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
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| 研究機関 | 新潟大学 |
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研究代表者 |
松本 雅記 新潟大学, 医歯学系, 教授 (60380531)
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| 研究期間 (年度) |
2020-07-30 – 2023-03-31
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| キーワード | プロテオミクス / プロテオゲノミクス / 質量分析 |
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| 研究成果の概要 |
本研究では、既存のプロテオゲノミクス研究と逆向きの戦略である「情報／仮説駆動型プロテオゲノミクス」によって核酸情報とプロテオーム情報を繋ぐ技術の開発を行った。大腸菌を用いた同位体標識内部標準作製システムの作製、ならびに大規模な絶対定量を行うための超多重定量タグシステムであるQuantiCodeおよび内々標準として機能するQuantimerを開発した。さらに、DIAとPRMと呼ばれる二つの質量分析技術をシームレスに連動させる新たな超高感度質量分析技術であるSLiM法を開発し、これれを用いたプロテオゲノミクスの概念検証実験を行なった。
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| 自由記述の分野 |
機能ゲノミクス
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究によって、任意のペプチド配列の存在を確定的に検証することが可能となり、プロテオームに存在する多数の未確認タンパク質を同定あるいは定量が可能となった。これらの新規タンパク質の発見や機能解析は、ゲノム機能の注釈やタンパク質のミスセンス変異やスプライシング異常などがタンパク質発現への影響を知る手段となるため、学術的な意義はとても大きい。また、真のプロテオームの把握は、基礎生物学的な意義だけでなく、疾患研究や創薬における基盤的情報となるため、将来的に人類の健康等に貢献できると期待される。
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