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2021 年度 実施状況報告書

海洋メタゲノム解析により単離された新型キメラ光受容体PHYCRYの機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 20K21438
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

嶋田 勢津子  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (40432033)

研究分担者 蒔田 由布子  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員 (80443026)
鈴木 重勝  国立研究開発法人国立環境研究所, 生物・生態系環境研究センター, 特別研究員 (10785108) [辞退]
研究期間 (年度) 2020-07-30 – 2023-03-31
キーワード光受容体 / 藻類 / 海洋メタゲノム / フィトクロム / クリプトクロム
研究実績の概要

本研究では、海洋メタゲノムデータから発見された赤色光受容体フィトクロムと青色光受容体クリプトクロムの構造を併せ持つ新型キメラ光受容体PHYCRYの遺伝子について機能の解明を進めている。論文化にともない、新型キメラ光受容体PHYCRYをDualchorome1(DUC1)と命名した。
生物的機能解析については、シロイヌナズナの光受容体欠損変異体で相補解析を行うためにphyB、cry2欠損変異体へHA tagを付加したDUC1全長を導入した形質転換体を作製し、DUC1が発現していることを確認した。cry2変異体では胚軸徒長の形態が見られるが、cry2変異体のDUC1-HA形質転換体において胚軸徒長の抑制が観察され、DUC1により部分的相補されたことが示唆された。花成遅延の形態に関してはcry2変異体と有意差はみられなかった。phyB変異体へのDUC1-HA導入形質転換体は、胚軸徒長の抑制を示さず相補されないことが示唆された。これらのことからシロイヌナズナでDUC1はCRYの情報伝達経路を使い情報伝達している可能性が高いと予測している。
プラシノ藻のゲノム解析については、Pycnococcus provasolii のゲノム中に光情報伝達因子の相同遺伝子が存在しているのか探索を行い、ポジティブ因子の分解調節を行なっているCOP1, ハブ転写因子であるHY5の相同遺伝子は存在しているが、PIF, BIC, SPAなどの因子の相同遺伝子は存在しないことが明らかになった。
また、これらの結果をまとめ"Identification of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton"としてNature Communicationsに投稿し採択され出版された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

I. 分光学特性の解析については、当初の計画よりも解析が進み、2020年度に分光学的性質の解析を行うことができた。
II. 生物的機能の解析については、2021年度は植物の光受容体欠損変異体での機能相補解析を進めることができた。プラシノ藻のPHYCRY欠損変異体の解析については、プラシノ藻の欠損変異体作成が成功していないことから計画よりも遅れている。
III. プラシノ藻の全ゲノム配列の決定、光受容体遺伝子の系統解析については、2021年度に当初の計画より進んだことから、今年度は光情報伝達因子の相同遺伝子の探索を行なった。

今後の研究の推進方策

II. 生物的機能の解析については、プラシノ藻のPHYCRY欠損変異体の作成を目指す。欠損変異体作成後に発現解析を計画しているが、より機能を明らかにできるように光に関する形態や特性による検証方法を探索する。

次年度使用額が生じた理由

本年度に計画していた欠損変異体のRNA-seq解析を次年度に実施することにしたため、次年度に繰り越しを行った。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Identification of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton2021

    • 著者名/発表者名
      Makita Yuko、Suzuki Shigekatsu、Fushimi Keiji、Shimada Setsuko、Suehisa Aya、Hirata Manami、Kuriyama Tomoko、Kurihara Yukio、Hamasaki Hidefumi、Okubo-Kurihara Emiko、Yoshitake Kazutoshi、Watanabe Tsuyoshi、Sakuta Masaaki、Gojobori Takashi、Sakami Tomoko、Narikawa Rei、Yamaguchi Haruyo、Kawachi Masanobu、Matsui Minami
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 ページ: 3593

    • DOI

      10.1038/s41467-021-23741-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Characterization of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton2021

    • 著者名/発表者名
      Minami Matsui, Yuko Makita, Shigekatsu Suzuki, Keiji Fushimi, Setsuko Shimada, Haruyo Yamaguchi, Tomoko Sakami, Rei Narikawa, Masanobu Kawachi
    • 学会等名
      International Symposium on Plant Photobiology (ISPP 2021)
    • 国際学会
  • [学会発表] 新規光受容体・Dualchromeは橙色光/遠赤色光と青色光を感知する2021

    • 著者名/発表者名
      成川礼、伏見圭司、蒔田由布子、鈴木重勝、嶋田勢津子、陶久あや、平田愛美、 栗山朋子、栗原志夫、濱崎英史、栗原(大窪) 恵美子、吉武和敏、渡辺剛、作田正明、五条堀孝、山口晴代、河地正伸、松井南
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
  • [学会発表] 海洋メタゲノムデータからの新規光受容体の発見2021

    • 著者名/発表者名
      蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 嶋田勢津子, 陶久あや, 平田愛実, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛,坂見知子, 作田正明, 五條堀孝, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
  • [学会発表] 新規光受容体・Dualchromeの生物的機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      嶋田勢津子, 蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 陶久あや, 平田愛実, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛, 作田正明, 五條堀 孝, 成川 礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会

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公開日: 2022-12-28  

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