研究課題
前立腺癌での前立腺特異抗原(PSA)のように、簡便で有用なマーカーが存在する一方、多くの癌腫では今なお早期発見や再発の早期検知に有効な診断法が存在せず、その技術開発が強く求められている。本研究では、自覚症状に乏しく、実臨床において有益な腫瘍マーカーが無い早期診断が困難な淡明細胞型腎細胞癌(以下「腎癌」)と浸潤性膵管腺癌(以下「膵癌」)を取り上げ、その二次予防に向けた診断技術の開発を目的とする。我々は、これらの癌患者の手術検体組織と末梢血検体を用いて、包括的高感度転写産物プロファイリング(High Coverage Expression Profiling: HiCEP)法と次世代シークエンサー(Next Generation Sequencer: NGS)を組み合わせた新規高感度解析法を行うことにより、腎癌や膵癌に特異的な分子探索を行った。HiCEP法は日本で発明された網羅的な遺伝子発現解析手法であり、高感度かつ網羅的、定量的な発現解析を行うことができ実験の再現性が高いといった特徴がある。目的とするピークの塩基配列決定が煩雑だという欠点はあるが、我々はNGSを用いて癌発現データベースを作成することで、その欠点を克服した方法がNGS-HiCEP法である。腎癌及び膵癌の腫瘍組織を用いてNGS-HiCEP法を実施したところ、腫瘍特異的なマーカー候補をそれぞれ12個及び26個を同定した。そのうち4個及び12個は新規であった。これらの候補については、腎癌34例、膵管癌28例でreal-time qPCRを用いた再現解析を行い、高い再現性を確認した（学会発表済）。以上の成果より、NGS-HiCEP法は、異なる癌腫においても新規腫瘍マーカー候補を効率よく網羅的に検出できることが示唆された。現在、組織検体におけるsingle cell発現解析による検証中であり、今後その成果を論文報告する。
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