| 研究課題/領域番号 |
20KK0166
|
|---|
| 研究機関 | 東京大学 |
|---|
研究代表者 |
太田 博樹 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (40401228)
|
|---|
| 研究分担者 |
海部 陽介 東京大学, 総合研究博物館, 教授 (20280521)
澤藤 りかい 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 日本学術振興会特別研究員(CPD) (50814612)
澤藤 匠 (蔦谷匠) 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 助教 (80758813)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2020-10-27 – 2023-03-31
|
| キーワード | 古代プロテオミクス / 人類進化 / 海底遺跡 / 台湾 / プロテオミクス / 古人骨 / 化石 / 古環境 |
|---|
| 研究実績の概要 |
本研究の目的は、日本国内に古代プロテオミクス技術を移転し、日本が古代プロテオミクスの研究分野で国際的な存在感を発揮する土台を作ることである。若手研究者（澤藤りかい、蔦谷匠）の2名が2021年9月に古代プロテオミクス解析の開発者であるコペンハーゲン大学のエンリコ・カペリニ准教授とこの分野の第1人者であるフリド・ウエルカーがラボを構えるデンマークのコペンハーゲン大学へ渡航した。蔦谷匠はウエルカー博士化石試料からのタンパク質抽出とその解析法、アミノ酸配列の再構築と、そのデータにもとづく系統解析の基礎の研修を受けた。澤藤りかいは、プロテオミクスのデータ解析、化石から得られたタンパク質のアミノ酸配列の再構築、そのデータにもとづく系統解析について研修を受けた。分析対象とする試料としては、澎湖水道の海底遺跡から出土した動物化石をもちいる。この遺跡からは、多様な分類群の化石が出土しているが、まず最初にハイエナ科および長鼻目の化石（計8サンプル）を用いてテストを開始した。
|
| 現在までの達成度 |
現在までの達成度
3: やや遅れている
理由
COVID-19の影響により、2名の若手研究者のデンマークへの渡航が半年以上、遅れた。このため、両名により一定の進捗を得られた段階で、代表者・太田が渡航する予定であったが、これが未だかなっていない。こうした、不測の事態にも関わらず、2名の若手研究者は確実に古代プロテオミクス技術を修得し、試料の分析も進んでいる。
|
| 今後の研究の推進方策 |
澎湖水道の海底遺跡からは、多様な生物の化石が発見されている。これらのうち、分析する分類群の選定は、参照アミノ酸配列あるいは参照ゲノム配列の有無により、優先順位を付けて進める。化石試料は初め5-100mgと幅をもたせた重量で実施する。おそらく10-50mgあれば十分である。2022年7月には、少なくとも研究分担者の海部陽介が欧州を訪問し、澤藤りかいと蔦谷匠から研究の進捗状況の報告を受け、今後の研究の進め方について打ち合わせをする予定である。
|
| 次年度使用額が生じた理由 |
新型コロナ感染症による世界的なパンデミックの影響により、2名の若手研究者のデンマークへの渡航が半年以上、遅れた。これに伴い代表者が渡航する予定であったが、これも未だかなっていない。こうした理由で、次年度使用額が生じた。遅れたプロテオーム解析を進めるにあたり、これらの予算を使用する。
|
