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2020 年度 実施状況報告書

新たな創薬資源の採集調査と新奇天然物生合成マシナリーの探索と解明

研究課題

研究課題/領域番号 20KK0173
研究機関東京大学

研究代表者

阿部 郁朗  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (40305496)

研究分担者 淡川 孝義  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 准教授 (80609834)
森 貴裕  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (60734564)
牛丸 理一郎  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (10873648)
研究期間 (年度) 2020-10-27 – 2024-03-31
キーワード創薬資源採集調査 / 天然物生合成 / 生合成マシナリー / 生物多様性 / 中国南西部
研究実績の概要

以下の4つの項目を2020年度から4年間の計画で開始した。
1.植物内生菌、土壌微生物の採集単離(中国側が主導)調査対象地域として、未開拓薬用資源の宝庫、生物多様性ホットスポットとされる、中国南西部(広東、広西、雲南、海南省)を選択する。
2.低分子化合物の単離構造決定、生物活性評価(中国側が主導)上述したカルチャー・コレクションについて、異なる培養条件下で二次代謝産物生産能を詳細に検討し、微生物が生産する二次代謝産物とその生物活性を網羅的に解析する。
3.生合成マシナリーの解明と物質生産系の構築(日本側と中国側で同時進行)上述したカルチャー・コレクションについて、有用な生物活性物質生産能を示した微生物、あるいは、特異な分子骨格を生産する微生物については、全ゲノム配列を決定し、バイオインフォマティクスの技術を駆使したゲノムマイニングにより、テルペン、ポリケタイド、ペプチドなど、生物間相互作用に重要な役割を演ずる可能性が予想される創薬シード合物の新奇生合成酵素遺伝子を網羅的に探索し、その生合成マシナリーの詳細を解明する。大腸菌や酵母、麹菌などを宿主として、これら遺伝子の異種発現による物質生産系を構築する。有機化学を基盤として、生合成反応機構の詳細を酵素遺伝子レベルで明らかにする。
4.酵素結晶構造解析、機能改変と生合成リデザイン(日本側が主導) X線結晶構造解析により、酵素反応の立体構造基盤を明らかにするとともに、結晶構造に基づく酵素触媒機能の拡張と最適化をめざす。さらなる構造多様性の拡大と物質生産系の構築を実現し、所望の構造を有する、天然物を凌ぐ新規有用活性物質の大量安定供給をめざす。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

新型コロナウイルス感染拡大により互いの往来はならなかったが、共同研究成果が着実に多くの優れた共著論文に実りつつある。

今後の研究の推進方策

昨年度に引き続き、上述した4つの項目を年間の計画で同時進行させる。本年度こそは、研究代表者を含め、若手研究者を戦略的に当該地域に派遣し、国際共同研究を強力に推進することで、独創的、先駆的な研究を格段に発展させる。

次年度使用額が生じた理由

新型コロナウイルス感染拡大により、海外派遣、受け入れは残念ながら中止とせざるを得なかった。今年度こそは、研究代表者を含め、若手研究者を戦略的に当該地域に派遣し、国際共同研究を強力に推進することで、独創的、先駆的な研究を格段に発展させる。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 11件、 査読あり 12件、 オープンアクセス 6件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] 曁南大学/武漢大学/中国科学院(中国)

    • 国名
      中国
    • 外国機関名
      曁南大学/武漢大学/中国科学院
  • [雑誌論文] One Polyketide Synthase, Two Distinct Products: Trans‐Acting Enzyme‐Controlled Product Divergence in Calbistrin Biosynthesis2021

    • 著者名/発表者名
      Tao Hui、Mori Takahiro、Wei Xingxing、Matsuda Yudai、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 60 ページ: 8851~8858

    • DOI

      10.1002/anie.202016525

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Biosynthesis of alkyne-containing natural products2021

    • 著者名/発表者名
      Li Xinyang、Lv Jian-Ming、Hu Dan、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      RSC Chemical Biology

      巻: 2 ページ: 166~180

    • DOI

      10.1039/D0CB00190B

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Enzymology and biosynthesis of the orsellinic acid derived medicinal meroterpenoids2021

    • 著者名/発表者名
      Tao Hui、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Current Opinion in Biotechnology

      巻: 69 ページ: 52~59

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2020.11.016

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Microbial soluble aromatic prenyltransferases for engineered biosynthesis2021

    • 著者名/発表者名
      Chen He-Ping、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Synthetic and Systems Biotechnology

      巻: 6 ページ: 51~62

    • DOI

      10.1016/j.synbio.2021.02.001

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Extensive expanding the chemical diversity of fusidane-type antibiotics using a stochastic combinational strategy2020

    • 著者名/発表者名
      Song Xiaojun、Lv Jianming、Cao Zhiqin、Huang Huiyun、Chen Guodong、Awakawa Takayoshi、Hu Dan、Gao Hao、Abe Ikuro、Yao Xinsheng
    • 雑誌名

      Acta Pharmaceutica Sinica B

      巻: 10 ページ: in press

    • DOI

      10.1016/j.apsb.2020.12.007

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Biosynthesis of Biscognienyne?B Involving a Cytochrome P450‐Dependent Alkynylation2020

    • 著者名/発表者名
      Lv Jian‐Ming、Gao Yao‐Hui、Zhao Huan、Awakawa Takayoshi、Liu Ling、Chen Guo‐Dong、Yao Xin‐Sheng、Hu Dan、Abe Ikuro、Gao Hao
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 59 ページ: 13531~13536

    • DOI

      10.1002/anie.202004364

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Discovery of the cryptic function of terpene cyclases as aromatic prenyltransferases2020

    • 著者名/発表者名
      He Haibing、Bian Guangkai、Herbst-Gervasoni Corey J.、Mori Takahiro、Shinsky Stephen A.、Hou Anwei、Mu Xin、Huang Minjian、Cheng Shu、Deng Zixin、Christianson David W.、Abe Ikuro、Liu Tiangang
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 3958-3958

    • DOI

      10.1038/s41467-020-17642-2

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural Diversification of Andiconin-Derived Natural Products by α-Ketoglutarate-Dependent Dioxygenases2020

    • 著者名/発表者名
      Bai Tongxuan、Matsuda Yudai、Tao Hui、Mori Takahiro、Zhang Yonghui、Abe Ikuro
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 22 ページ: 4311~4315

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c01358

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Sporormielones A?E, bioactive novel C?C coupled orsellinic acid derivative dimers, and their biosynthetic origin2020

    • 著者名/発表者名
      Chen Guo-Dong、Hu Dan、Huang Mei-Juan、Tang Jia、Wang Xiao-Xia、Zou Jian、Xie Jun、Zhang Wei-Guang、Guo Liang-Dong、Yao Xin-Sheng、Abe Ikuro、Gao Hao
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 56 ページ: 4607~4610

    • DOI

      10.1039/D0CC00855A

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Deciphering the Biosynthetic Mechanism of Pelletierine in Lycopodium Alkaloid Biosynthesis2020

    • 著者名/発表者名
      Wang Juan、Zhang Ze-Kun、Jiang Fang-Fang、Qi Bo-Wen、Ding Ning、Hnin Saw Yu Yu、Liu Xiao、Li Jun、Wang Xiao-hui、Tu Peng-Fei、Abe Ikuro、Morita Hiroyuki、Shi She-Po
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 22 ページ: 8725~8729

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c03339

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular Basis for Sesterterpene Diversity Produced by Plant Terpene Synthases2020

    • 著者名/発表者名
      Chen Qingwen、Li Jianxu、Liu Zhixi、Mitsuhashi Takaaki、Zhang Yuting、Liu Haili、Ma Yihua、He Juan、Shinada Tetsuro、Sato Tsutomu、Wang Yong、Liu Hongwei、Abe Ikuro、Zhang Peng、Wang Guodong
    • 雑誌名

      Plant Communications

      巻: 1 ページ: 100051~100051

    • DOI

      10.1016/j.xplc.2020.100051

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification and characterization of N9-methyltransferase involved in converting caffeine into non-stimulatory theacrine in tea2020

    • 著者名/発表者名
      Zhang Yue-Hong、Li Yi-Fang、Wang Yongjin、Tan Li、Cao Zhi-Qin、Xie Chao、Xie Guo、Gong Hai-Biao、Sun Wan-Yang、Ouyang Shu-Hua、Duan Wen-Jun、Lu Xiaoyun、Ding Ke、Kurihara Hiroshi、Hu Dan、Zhang Zhi-Min、Abe Ikuro、He Rong-Rong
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 1473-1473

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15324-7

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [備考] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~tennen/head.htm

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公開日: 2021-12-27  

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