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2021 年度 実施状況報告書

新興感染症パンデミック予防に向けたタイ国における未知病原体の潜在的蔓延状況調査

研究課題

研究課題/領域番号 20KK0199
研究機関京都府立医科大学

研究代表者

大道寺 智  京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (80432433)

研究分担者 西岡 敬介  京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50790713)
村越 ふみ  京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20759906)
萩原 克郎  酪農学園大学, 獣医学群, 教授 (50295896)
研究期間 (年度) 2020-10-27 – 2024-03-31
キーワード新興感染症 / 国際感染症
研究実績の概要

本研究の目的は、タイ山間部において蔓延している病原体をヒト、野生動物、媒介節足動物から網羅的に同定することで、今後流行を起こす可能性がある未知病原体を検出することである。国際研究グループ(タイ)との連携により実施する。新型コロナウイルスの影響で予定していた渡航ができなくなったため国内での活動を余儀なくされた。そのため本年度はタイの病原体の検出に先立ち、前年度までに改良を続けてきた病原体検出技術を用いて、国内で採取した節足動物を用いた解析を行うこととした。
京都府下で採取した野外マダニより核酸抽出し、16S rRNA遺伝子をPCR にて増幅し、次世代シーケンサーにて、マダニの保有する細菌叢について解析を行った。その結果、今回捕獲した野外マダニの細菌叢として、腸内細菌科細菌の他、リケッチア属、コクシエラ属、ミクロコッカス属、エーリキア属、スフィンゴモナス属などの細菌が検出された。中でもリケッチア属、コクシエラ属といった病原細菌も比較的高率に検出され、更なる解析の必要性が示唆された。一方で、同様に京都府下で採取した野外蚊より核酸抽出し、これまでに改良してきたフラビウイルス属をターゲットとしたユニバーサルプライマーを用いたPCR法にてフラビウイルス遺伝子を複数検出した。現在、塩基配列解析を含めさらなる解析を進めている一方で、ウイルス分離を試みている。
また上記のような実際の実験を推し進める一方で、共同研究者どうしでリモート会議を行い(国内)、今後の研究の進め方などについて協議を行った。タイ側共同研究者とも同様にリモート会議を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

国内外の新型コロナウイルスの感染状況からして、現時点においてすぐに渡航できる状況になく、タイ訪問が実現していないことが主たる理由である。

今後の研究の推進方策

新型コロナウイルスの感染状況をみながら、渡航可能となった時点でタイ訪問を予定しているが、それまでの期間は国内で実施可能な実験を行うこととする。具体的には、これまで行ってきた検体からの効率的な核酸抽出法、病原体検出法の改良に加え、国内で得られる節足動物(蚊、ダニ)を中心に解析をすることとする。

次年度使用額が生じた理由

(理由)新型コロナウイルスの影響で予定していた海外渡航ができなくなったために渡航費が消費できず、次年度使用額が生じた。
(使用計画)
上記で生じた額は次年度の研究遂行のための費用として使用予定である。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 1件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (3件)

  • [国際共同研究] マヒドン大学(タイ)

    • 国名
      タイ
    • 外国機関名
      マヒドン大学
  • [雑誌論文] Higher Viral Stability and Ethanol Resistance of Avian Influenza A(H5N1) Virus on Human Skin2022

    • 著者名/発表者名
      Bandou Risa、Hirose Ryohei、Nakaya Takaaki、Miyazaki Hajime、Watanabe Naoto、Yoshida Takuma、Daidoji Tomo、Itoh Yoshito、Ikegaya Hiroshi
    • 雑誌名

      Emerging Infectious Diseases

      巻: 28 ページ: 639~649

    • DOI

      10.3201/eid2803.211752

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Downregulation of calcium-regulated heat stable protein 1 expression by low-temperature stimulation causes reduction of interferon-β expression and sensitivity to influenza viral infection2022

    • 著者名/発表者名
      Nishioka Keisuke、Daidoji Tomo、Nakaya Takaaki
    • 雑誌名

      Virus Research

      巻: 309 ページ: 198659~198659

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2021.198659

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stability of SARS-CoV-2 and influenza virus varies across different paper types2022

    • 著者名/発表者名
      Hirose Ryohei、Miyazaki Hajime、Bandou Risa、Watanabe Naoto、Yoshida Takuma、Daidoji Tomo、Itoh Yoshito、Nakaya Takaaki
    • 雑誌名

      Journal of Infection and Chemotherapy

      巻: 28 ページ: 252~256

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2021.11.006

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of the Residual Disinfection Effects of Commonly Used Skin Disinfectants against Viruses: An Innovative Contact Transmission Control Method2021

    • 著者名/発表者名
      Hirose Ryohei、Itoh Yoshito、Ikegaya Hiroshi、Miyazaki Hajime、Watanabe Naoto、Yoshida Takuma、Bandou Risa、Daidoji Tomo、Nakaya Takaaki
    • 雑誌名

      Environmental Science & Technology

      巻: 55 ページ: 16044~16055

    • DOI

      10.1021/acs.est.1c05296

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of genus-specific universal primers for the detection of flaviviruses2021

    • 著者名/発表者名
      Daidoji Tomo、Morales Vargas Ronald Enrique、Hagiwara Katsuro、Arai Yasuha、Watanabe Yohei、Nishioka Keisuke、Murakoshi Fumi、Garan Kotaro、Sadakane Hiroki、Nakaya Takaaki
    • 雑誌名

      Virology Journal

      巻: 18 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1186/s12985-021-01646-5

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Comparison of sodium alginate-based and sodium hyaluronate-based submucosal injection materials based on rheological analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Hirose Ryohei、Watanabe Naoto、Naito Yuji、Hashimoto Hikaru、Sugino Satoshi、Yoshida Takuma、Bandou Risa、Daidoji Tomo、Inoue Ken、Dohi Osamu、Yoshida Naohisa、Nakaya Takaaki、Itoh Yoshito
    • 雑誌名

      Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials

      巻: 124 ページ: 104816~104816

    • DOI

      10.1016/j.jmbbm.2021.104816

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Double mutations in the H9N2 avian influenza virus PB2 gene act cooperatively to increase viral host adaptation and replication for human infections2021

    • 著者名/発表者名
      Elgendy Emad Mohamed、Arai Yasuha、Kawashita Norihito、Isobe Ayana、Daidoji Tomo、Ibrahim Madiha Salah、Ono Takao、Takagi Tatsuya、Nakaya Takaaki、Matsumoto Kazuhiko、Watanabe Yohei
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 102 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1099/jgv.0.001612

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Cytopathic Effect-Based Tissue Culture Method for HCoV-OC43 Titration Using TMPRSS2-Expressing VeroE6 Cells2021

    • 著者名/発表者名
      Hirose Ryohei、Watanabe Naoto、Bandou Risa、Yoshida Takuma、Daidoji Tomo、Naito Yuji、Itoh Yoshito、Nakaya Takaaki
    • 雑誌名

      mSphere

      巻: 6 ページ: e00159-21

    • DOI

      10.1128/mSphere.00159-21

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Disinfectant effectiveness against SARS-CoV-2 and influenza viruses present on human skin: model-based evaluation2021

    • 著者名/発表者名
      Hirose Ryohei、Bandou Risa、Ikegaya Hiroshi、Watanabe Naoto、Yoshida Takuma、Daidoji Tomo、Naito Yuji、Itoh Yoshito、Nakaya Takaaki
    • 雑誌名

      Clinical Microbiology and Infection

      巻: 27 ページ: 1042.e1~1042.e4

    • DOI

      10.1016/j.cmi.2021.04.009

    • 査読あり
  • [学会発表] Hemagglutinin acid stability and infectivity of H5N6/H5N8 avian influenza viruses2021

    • 著者名/発表者名
      Tomo Daidoji, Hiroki Sadakane, Kotaro Garan, Yasuha Arai, Yohei Watanabe, Tatsufumi Usui, and Takaaki Nakaya
    • 学会等名
      第69回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] 近年中国で優勢に流行するH9N2亜型鳥インフルエンザウイルスのPB2遺伝子に選択された同時変異群はヒト適応性を高く変化させている2021

    • 著者名/発表者名
      荒井 泰葉、Elgendy Emad、川下理日人、磯邉 綾菜、大道寺 智、中屋 隆明、渡邊 洋平
    • 学会等名
      第69回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] ヒト呼吸器上皮細胞を用いたH5N6/H5N8ウイルスの感染動態の解析2021

    • 著者名/発表者名
      大道寺 智、定金 広樹、加覧 浩太郎、荒井 泰葉、渡邊 洋平、笛吹 達史、中屋 隆明
    • 学会等名
      第164回日本獣医学会学術集会

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公開日: 2022-12-28  

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