特殊ペプチド創薬

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21000005
• 研究種目: 特別推進研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 理工系; 化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 菅 裕明 東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (00361668)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2013
• キーワード: 天然物有機化学 / 生理活性物質 / 生体高分子 / 生化学 / ケミカルバイオロジー

研究概要

本研究では、申請者が10年に渡り研究を推進してきたフレキシザイムを用いた遺伝暗号リプログラミングの基盤技術をさらに飛躍発展させ、mRNA鋳型依存的に天然物ライクな特殊ペプチドライブラリーを自在に合成する技術とその網羅的探索技術、RaPIDシステムを開発する。さらに、その創薬応用を展開する事で特殊ペプチドによるケミカルバイオテクノロジーの新時代を築く

研究成果

• [雑誌論文] One-pot synthesis of azoline-containing peptides in a cell-free translation system integrated with a posttranslational cyclodehydratase SIRT2 (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Goto, Y. Ito, Y. Kato, S. Tsunoda, H. Suga
  • 雑誌名: Chemistry and Biology 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] An orthogonal ribosome-tRNAs pair via the engineering of peptidyl transferase center (2014)
  • 著者名/発表者名: N. Terasaka, G. Hayashi1, T. Katoh, and H. Suga
  • 雑誌名: Nature Chemical Biology 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selection-based discovery of druglike macrocyclic peptides (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Passioura, T. Katoh, Y. Goto, H. Suga
  • 雑誌名: Selection-based discovery of druglike macrocyclic peptides 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein cocrystallization molecules originating from in vitro selected macrocyclic peptides (2014)
  • 著者名/発表者名: C.J. Hipolito, N.K. Bashiruddin, H. Suga
  • 雑誌名: Current Opinion in Structural Biology 巻: 26 ページ: 24-31
  • DOI: DOI:10.1016/j.sbi.2014.03.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for gating mechanisms of a eukaryotic P-glycoprotein homolog (2014)
  • 著者名/発表者名: A. Kodan, T. Yamaguchi, T. Nakatsu, K. Sakiyama, C.J. Hipolito, A. Fujioka, R. Hirokane, K. Ikeguchi, B. Watanabe,J. Hiratake, Y. Kimura, H. Suga, K. Ueda, H. Kato
  • 雑誌名: Pro. Nat. Acad. Sci 巻: 111 ページ: 4049-4054
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Basis for Potent Inhibition of SIRT2 Deacetylase by a Macrocyclic Peptide Inducing Dynamic Structural Change (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Yamagata, Y. Goto, H. Nishimasu, J. Morimoto, R. Ishitani, N. Dohmae, N. Takeda, R. Nagai, I. Komuro, H. Suga, O. Nureki
  • 雑誌名: Structure 巻: 22 ページ: 345-352
  • 査読あり
• [雑誌論文] Flexizymes-facilitated genetic code reprogramming leading to the discovery of drug-like peptides (2014)
  • 著者名/発表者名: N. Terasaka, H. Suga
  • 雑誌名: Chemistry Letters 巻: 43 ページ: 11-19
  • 査読あり
• [雑誌論文] Non-standard peptide expression under the genetic code consisting of reprogrammed dual sense codons (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Goto, M. Iseki, A. Hitomi, H. Murakami, and H. Suga
  • 雑誌名: ACS Chemical Biology 巻: 8 ページ: 266, 719
  • DOI: DOI:10.1021/cb400549p
  • 査読あり
• [雑誌論文] A macrocyclic peptide that serves as a cocrystallization ligand and inhibits the function of a MATE family transporter (2013)
  • 著者名/発表者名: C.J. Hipolito, Y. Tanaka, T. Katoh, O. Nureki, H. Suga
  • 雑誌名: Molecules 巻: 18 ページ: 10514-10530
  • DOI: DOI:10.3390/molecules180910514
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for the drug extrusion mechanism by a MATE multidrug transporter (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Tanaka, C.J. Hipolito, A.D. Maturana, K. Ito, T. Kuroda, T. Higuchi, T. Katoh, H.E. Kato, M. Hattori, K. Kumazaki, T. Tsukazaki, R. Ishitani, H. Suga, O. Nureki
  • 雑誌名: Nature 巻: 496 ページ: 247-251
  • DOI: DOI:10.1002/chem.201300247
  • 査読あり
• [雑誌論文] Flexizyme-mediated genetic reprogramming as a tool for noncanonical Peptide synthesis and drug discovery (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Passioura, H. Suga
  • 雑誌名: Chemistry European Journal 巻: 19 ページ: 6530-6536
  • DOI: DOI:10.1002/chem.201300247
  • 査読あり
• [雑誌論文] In Vitro Selection of Multiple Libraries Created by Genetic Code Reprogramming To Discover Macrocyclic Peptides That Antagonize VEGFR2 Activity in Living Cells (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Kawakami, T. Ishizawa, T. Fujino, P.C. Reid, H. Suga, H. Murakami
  • 雑誌名: ACS Chemical Biology 巻: 8 ページ: 1205-1514
  • DOI: DOI:10.1021/cb300697h
  • 査読あり
• [雑誌論文] Technologies for the synthesis of mRNA-encoding libraries and discovery of bioactive natural product-inspired non-traditional macrocyclic peptides (2013)
  • 著者名/発表者名: K. Ito, T. Passioura, H. Suga
  • 雑誌名: Molecules 巻: 18 ページ: 3502-3528
  • DOI: DOI:10.3390/molecules18033502
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reevaluation of the D-amino acid compatibility with the elongation event in translation (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Fujino, Y. Goto, H. Suga, H. Murakami
  • 雑誌名: Journal of American Chemical Society 巻: 135 ページ: 1830-1837
  • DOI: DOI:10.1021/ja309570x
  • 査読あり
• [学会発表] 擬天然物の新機能創出分子技術 (2014)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: 日本化学会第94春期年会「社会持続的発展のための分子技術」
  • 発表場所: 名古屋大学東山キャンパス(名古屋市)(招待講演)
  • 年月日: 2014-03-29
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2014)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: AsiaTIDES, 2.Plenary Lecture
  • 発表場所: シェラトン都ホテル東京(東京都港区)(招待講演)
  • 年月日: 2014-02-25
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Solvay Conference of "New Chemistry and New Opportunities from the Expanding Protein Universe"
  • 発表場所: International Solvay Institute (Brussels, Belgium)(招待講演)
  • 年月日: 20131015-19
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: "Jokichi Takamine" 130 years of Glasgow-Japan Collaboration
  • 発表場所: University of Glasgow (Glasgow, UK)(招待講演)
  • 年月日: 20130905-06
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Current Strategy for Development of Biopharmaceuticals and Small Molecule Drugs
  • 発表場所: 北海道大学(北海道札幌)(招待講演)
  • 年月日: 20130801-02
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: International Conference on Structural Genomics2013, Structural Life Science
  • 発表場所: 京王プラザホテル(北海道札幌)(招待講演)
  • 年月日: 20130729-0801
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Keynote Lecture Symposium on Chemoselective Reactions for the Synthesis and Application
  • 発表場所: Max Planc Institute (Dortmund, Germany)(招待講演)
  • 年月日: 20130702-05
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Symposium on Foldamers
  • 発表場所: Les Cordeliers Conference Centre(Paris, France)(招待講演)
  • 年月日: 20130409-12
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Korean Peptide Protein Society Meeting
  • 発表場所: Seoul National University (Seoul, Korea)(招待講演)
  • 年月日: 2013-11-29
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Basel Chemical Society Lectureship
  • 発表場所: Medicinal Chemistry Navartis Institute (Basel, Switzerland)(招待講演)
  • 年月日: 2013-10-24
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: RiboClub
  • 発表場所: Hotel Cheribourg (Quebec,Canada)(招待講演)
  • 年月日: 2013-09-22
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Biochemistry Seminar of University of Colorado BioFrontier Institute
  • 発表場所: Univerity of Colorado (Boulder, USA)(招待講演)
  • 年月日: 2013-09-11
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Lilly Distinguished Lecturer at Colorado State University
  • 発表場所: Colorado State University (Fort Collins, US)(招待講演)
  • 年月日: 2013-09-10
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: ACS National Meeting
  • 発表場所: Indiana Convention Center (Indianapolis, USA)(招待講演)
  • 年月日: 2013-09-09
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: American Peptide Symposium 2013
  • 発表場所: Hilton Waikoloa Village (Hawaii, USA)(招待講演)
  • 年月日: 2013-06-23
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: Gordon Research Conference, Bioorganic Chemistry
  • 発表場所: Proctor Academy (New Hampshire, USA)(招待講演)
  • 年月日: 2013-06-13
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: 5th Gratama Workshop
  • 発表場所: 東京工業大学大岡山キャンパス(東京都目黒区)(招待講演)
  • 年月日: 2013-05-30
• [学会発表] Discovery of natural product-like petides accerelated by RaPID system (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅 裕明
  • 学会等名: RIKEN-Max Planc Joint Symposium
  • 発表場所: 理化学研究所和光研究所(埼玉県和光市)(招待講演)
  • 年月日: 2013-04-16
• [備考]
  • URL: http://www.chem.s.u-tokyo.ac.jp/users/biorig/index.html
• [産業財産権] MATE 活性阻害ペプチド (2013)
  • 発明者名: 菅裕明、濡木理、ヒポリト クリストファー、田中良樹
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権番号: PCT/JP2013, 070779
  • 出願年月日: 2013-07-28
  • 外国
• [産業財産権] 大環状ペプチド、その製造方法、及び大環状ペプチドライブラリを用いるスクリーニング方法 (2013)
  • 発明者名: 菅裕明
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権番号: 特願2013, 174906
  • 出願年月日: 2013-08-26
• [産業財産権] C-Metタンパク質アゴニスト (2013)
  • 発明者名: 菅裕明、伊藤健一郎
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権番号: 特願-2013, 214771
  • 出願年月日: 2013-10-15
• [産業財産権] 安定化された二次構造を有するペプチド、及びペプチドライブラリー、それらの製造方法 (2011)
  • 発明者名: 菅裕明、樋口岳
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権番号: 特願2012, 546968(JP),13/990123(US), 11845198.8(EP),201180058284.4(CN)
  • 取得年月日: 2011-12-05
  • 外国