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2011 年度 実績報告書

抗がん剤感受性に関わるゲノム異常の同定

研究課題

研究課題/領域番号 21200001
研究機関大分大学

研究代表者

守山 正胤  大分大学, 医学部, 教授 (90239707)

研究分担者 白尾 國明  大分大学, 医学部, 教授 (10467996)
竹内 一郎  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (40335146)
キーワードアレイCGH / トランスクリプトーム / microRNA / バイオインフォマティクス
研究概要

我々は昨年度までに、網羅的遺伝情報と臨床情報を統合するためのバイオインフォマティクスの手法を確立してきた。23年度はこの手法をもとに順調に研究をすすめた。まず、粘膜下浸潤胃がんのゲノム異常を網羅的に解析し、早期のリンパ節転移に関わるゲノム異常を同定した(PLoS One 6e 22313)。大腸癌のリンパ節転移予測マーカーとしてVSNL1の発現亢進が有効であることを報告した(Int J Can 2011)。また、消化管間葉系腫瘍のメチル化を網羅的に解析し、予後と相関するメチル化異常を明らかにした(GUT 61(3), 392)。確立したバイオインフォマティクス手法を用いて腎細胞癌についての解析にも着手し、腎細胞癌の癌関連マイクロRNAを同定した(J Pathol, 224,280-8)。High-grade腎細胞がんにおけるSAV1異常発現の意義を明らかにした(BMC cancer, 11, 523)。ほとんど解明が進んでいない透析腎癌の亜型分類をゲノムプロファイルをもとに行った(Cancer Sci, 103, 5659)。さらに、臨床試験を行うことで様々な組み合わせの抗がん剤の効果を解析した(J Oncol Pract, 7(3), 148-154 ; Cancer Chemother Pharmacol, 64(3), 557-64 ; Gastric Cancer, 14(3), 226-33 ; Int J Cancer, 15 ; 130(10) ; 2359-65)。
本研究において我々は網羅的遺伝情報と臨床情報を統合するため、バイオインフォマティクス手法を開発し、その成果を報告した。今後は同定された分子標的の臨床応用へ向けた研究を進めるとともに、開発したバイオインフォマティクス手法を用いて他の癌腫における分子標的のスクリーニングに着手したいと考えている。

  • 研究成果

    (28件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (18件) (うち査読あり 18件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] Genomic profiling of renal cell carcinoma in patients with end-stage renal disease2012

    • 著者名/発表者名
      Inoue T, et al
    • 雑誌名

      Cancer science

      巻: 103 ページ: 569-576

    • DOI

      doi:10.1111/j.1349-7006.2011.02176.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aberrant DNA methylation associated with aggressiveness of gastrointestinal stromal tumor2012

    • 著者名/発表者名
      Y Okamoto, et al
    • 雑誌名

      GUT

      巻: Vol.61, no.3 ページ: 392-401

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Epigenetic subclassification of meningiomas based on genome-wide DNA methylation analyses2012

    • 著者名/発表者名
      Kishida Y, et al
    • 雑誌名

      Carcinogenesis

      巻: vol.32, no.2 ページ: 436-441

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pharmacokinetic parameters from 3-Tesla DCE-MRI as surrogate biomarkers of antitumor effects of bevacizumab plus FOLFIRI in colorectal cancer with liver metastasis2012

    • 著者名/発表者名
      Hirashima Y, et al
    • 雑誌名

      International Journal of Cancer

      巻: 130(10) ページ: 2359-2365

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of safety, pharmacokinetics, and efficacy of vorinostat, a histone deacetylase inhibitor, in the treatment of gastrointestinal (GI) cancer in a phase I clinical trial2012

    • 著者名/発表者名
      Doi T, et al
    • 雑誌名

      Int J Clin Oncol

      巻: (in Press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Overexpression of miR-210, a downstream target of HIF1α, causes centrosome amplification in renal carcinoma cells2011

    • 著者名/発表者名
      Nakada C, et al
    • 雑誌名

      J Pathol

      巻: 224 ページ: 280-8

    • DOI

      doi:10.1002/path.2860

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genomic profiling of submucosal-invasive gastric cancer by array-based comparative genomic hybridization2011

    • 著者名/発表者名
      Kuroda A, et al
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 6 ページ: e22313

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Visinin-like protein-1 overexpression is an indicator of lymph node metastasis and poor prognosis in colorectal cancer patients2011

    • 著者名/発表者名
      Akagi T, et al
    • 雑誌名

      Int J Cancer

      巻: (published on line)

    • DOI

      doi:10.1002/ijc.27341.[Epub ahead of print]

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Downregulation of sav1 plays a role in pathogenesis of high-grade clear cell renal cell carcinoma2011

    • 著者名/発表者名
      Matsuura K, et al
    • 雑誌名

      BMC cancer

      巻: 11 ページ: 523

    • DOI

      doi:10.1186/1471-2407-11-523

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nonlinear Regularization Path for Quadratic Loss Support Vector Machines2011

    • 著者名/発表者名
      M Karasuyama, I Takeuchi
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Neural Networks

      巻: vol.22, no.10 ページ: 1613-1625

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of FOXO3 and PRDM1 as tumor suppressor gene candidates in NK cell neoplasms by genomic and functional analyses2011

    • 著者名/発表者名
      K Karube, et al
    • 雑誌名

      Blood

      巻: vol.118, no.12 ページ: 3195-3204

    • 査読あり
  • [雑誌論文] NeuroD1 Downregulates Slit2 Expression and Promotes Cell Motility and Tumor Formation of Neuroblastoma2011

    • 著者名/発表者名
      P Huang, et al
    • 雑誌名

      Cancer Research

      巻: vol.71, no.8 ページ: 2938-2948

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characteristics and Outcomes of Patients With Advanced Gastric Cancer Who Declined to Participate in a Randomized Clinical Chemotherapy Trial2011

    • 著者名/発表者名
      Tanai C, et al
    • 雑誌名

      JOURNAL OF ONCOLOGY PRACTICE

      巻: 7(3) ページ: 148-154

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Feasibility study of adjuvant chemotherapy with S-1 plus cisplatin for gastric cancer2011

    • 著者名/発表者名
      Takahari D, et al
    • 雑誌名

      Cancer Chemother Pharmacol

      巻: 67(6) ページ: 1423-1428

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ectopic Hapatocellular Carcinoma at Left Sub-Diaphragm with Lung Metastasis2011

    • 著者名/発表者名
      NishikawaK, et al
    • 雑誌名

      Internal Medicine

      巻: 50(14) ページ: 1505-1506

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Neuroendocrine tumors of the stomach : chemotherapy with cisplatin plus irinotecan is effective for gastric poorly-differentiated neuroendocrine carcinoma2011

    • 著者名/発表者名
      Okita NT, et al
    • 雑誌名

      Gastric Cancer

      巻: 14(2) ページ: 161-165

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A phase II study of biweekly mitomycin C and irinotecan combination therapy in patients with fluoropyrimidine-resistant advanced gastric cancer : a report from the Gastrointestinal Oncology Group of the Japan Clinical Oncology Group (JCOG0109-DI Trial)2011

    • 著者名/発表者名
      Hamaguchi T, et al
    • 雑誌名

      Gastric Cancer

      巻: 14 ページ: 226-233

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characteristics and Outcomes of Patients With Advanced Gastric Cancer Who Declined to Participate in a Randomized Clinical Chemotherapy Trial2011

    • 著者名/発表者名
      Tanai T, et al
    • 雑誌名

      JOURNAL OF ONCOLOGY PRACTICE

      巻: 7(3) ページ: 148-153

    • 査読あり
  • [学会発表] GENOMIC COPY NUMBER LOSS AT 9P IS ASSOCIATED WITH METASTASIS OF RENAL CELL CARCINOMA2011

    • 著者名/発表者名
      成松隆弘, ほか
    • 学会等名
      AUA 2011
    • 発表場所
      ワシントンD.C.
    • 年月日
      20110514-20110519
  • [学会発表] Target neighbor consistent feature weighting for nearest neighbor classification2011

    • 著者名/発表者名
      I Takeuchi, M Sugiyama
    • 学会等名
      25th Annual Conference on Neural Information Processing Systems (NIPS2011)
    • 発表場所
      グラナダ、スペイン
    • 年月日
      2011-12-13
  • [学会発表] 腎淡明細胞癌におけるmiR-210過剰発現の意義2011

    • 著者名/発表者名
      中田知里, ほか
    • 学会等名
      第70回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 年月日
      2011-10-04
  • [学会発表] high gradeの淡明腎細胞癌ではHippoシグナルの異常がみられる2011

    • 著者名/発表者名
      松浦恵子, ほか
    • 学会等名
      第70回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 年月日
      2011-10-03
  • [学会発表] 胃癌におけるマイクロRNA発現2011

    • 著者名/発表者名
      成松隆弘, ほか
    • 学会等名
      第70回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 年月日
      2011-10-03
  • [学会発表] Multi-parametric solution path algorithm for instance-weighted support vector machine2011

    • 著者名/発表者名
      M Karasuyama, N Harada, M Sugiyama, I Takeuchi
    • 学会等名
      2011 IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing (MLSP2011)
    • 発表場所
      北京、中国
    • 年月日
      2011-09-21
  • [学会発表] Suboptimal solution path algorithm for support vector machine2011

    • 著者名/発表者名
      M Karasuyama, I Takeuchi
    • 学会等名
      The 28th International Conference on Machine Learning (ICML2011)
    • 発表場所
      Bellevue Washington, USA
    • 年月日
      2011-07-01
  • [学会発表] 胃癌におけるマイクロRNA発現2011

    • 著者名/発表者名
      塚本善之、守山正胤
    • 学会等名
      第100回日本病理学会総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(招待講演)
    • 年月日
      2011-04-28
  • [学会発表] Genomic profiling of gastric carcinoma in situ and adenomas by array-based comparative genomic hybridization2011

    • 著者名/発表者名
      塚本善之, ほか
    • 学会等名
      102th AACR
    • 発表場所
      オーランド、フロリダ
    • 年月日
      2011-04-05
  • [学会発表] Biological effect of miR-210 overexpression on renal carcinoma cells2011

    • 著者名/発表者名
      中田知里, ほか
    • 学会等名
      102th AACR
    • 発表場所
      オーランド、フロリダ
    • 年月日
      2011-04-03

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公開日: 2013-06-26  

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