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2009 年度 実績報告書

標的ゲノム領域上の蛋白-RNA機能複合体解析に向けた人工染色体の活用

研究課題

研究課題/領域番号 21200038
研究機関鳥取大学

研究代表者

久郷 裕之  鳥取大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (40225131)

研究分担者 中山 祐二  鳥取大学, 生命機能研究支援センター, 助教 (40432603)
キーワードHAC / RNA結合タンパク質 / LIT1 / Xist / ゲノム / ゲノムネットワーク / 染色体 / 免疫沈降
研究概要

HACベクターを標識し標的ゲノムローカスを搭載するための第一段階として,HAC回収用のタグ配列(LacO配列)をFRTサイトに導入することを試みた.しかし,Flp酵素を用いた部位特異的組み換えの反応が進まずにタグ配列を挿入できなかった.このような結果から,HACに導入したFRTサイトが機能していない可能性が示唆された.我々は,このシステムが機能しなかったときのバツクアップシステムとして,Multiple Gatewayシステムを搭載したHACベクターを開発し,それを出発資材にシフトすることにした.Multiple Gatewayシステムとは,組み換え酵素であるインテグラーゼにより,attB配列とattP配列で特異的に組み換えを起こし,ベクターに遺伝子を導入するシステムである.これは,複数の遺伝子をHACへ容易に搭載できるためにプロジェクト推進の効率化に寄与する重要なシステムになるものと考えられる.
一方,HACレベルの染色体DNAをHACに搭載したタグ配列から安定に回収できるどうかを検討するために,メソトレキセート(MTX)遺伝子増幅システムを利用した.このシステムは,ジヒドロ葉酸還元酵素(dhfr)の近傍に存在する他の遺伝子も同時に増幅する特徴を生かしてLacO配列を増幅させる.そこで,dhfr欠損細胞であるCHO細胞へdhfrおよびLacO配列を導入し,MTX処理により遺伝子増幅を試み,25個の細胞クローンを同定した.HA抗体による染色体の回収率は,物理的にサイズが小さい程上がることが予想され,CHO細胞の中で最も小さな染色体にLacO配列が組み込まれた細胞クローンを選択するためにFISH解析を行った.その結果,最も小さな染色体にLacO配列が組み込まれた細胞クローンを同定した.この細胞クローンは,本研究の実用化の有無を検証するための有効な資材になることが期待される.

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Identification of the chromatin regions coated by non-coding Xist RNA.2009

    • 著者名/発表者名
      Murakami, K, et al
    • 雑誌名

      Cytogenetic and Genome Research 125

      ページ: 1-25

    • 査読あり
  • [学会発表] 形質転換過程における染色体異数化の役割2010

    • 著者名/発表者名
      縄田寿克
    • 学会等名
      第44回京都大学原子炉実験所学術講演会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      20100128-20100129
  • [学会発表] 機能性RNAによる染色体機能制御機構の解明2009

    • 著者名/発表者名
      久郷裕之
    • 学会等名
      第60回染色体学会
    • 発表場所
      島根
    • 年月日
      20091113-20091114
  • [学会発表] 発がん過程における染色体異数化の役割2009

    • 著者名/発表者名
      縄田寿克
    • 学会等名
      第52回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      20091111-20091113
  • [学会発表] Further investigation of IMMP2L, LRRN3 and DOCK4 as potential candidate genes for autism susceptibility.2009

    • 著者名/発表者名
      N.H.Sykes
    • 学会等名
      ASHG
    • 発表場所
      Hawaii
    • 年月日
      20091020-20091024

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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