標的ゲノム領域上の蛋白-RNA機能複合体解析に向けた人工染色体の活用

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21200038
• 研究種目: 新学術領域研究(研究課題提案型)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用ゲノム科学; 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 鳥取大学
• 研究代表者: 久郷 裕之 鳥取大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (40225131)
• 研究分担者: 中山 祐二 鳥取大学, 生命機能研究支援センター, 助教 (40432603)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 染色体工学

研究概要

本研究では、選定したタグシステム(LacO/LacI-GFPシステム)を用いて一定サイズのDNA(3.5kb)を安定的に回収することに成功した。LacO/LacI-GFPシステムを用いて巨大なCHO染色体の回収に成功した。これらの研究よりLacO/LacI-GFPのタグシステムの実用性を明らかにした。さらに、複数個の遺伝子を搭載可能な人工染色体上へタグ配列(LacO配列)および本研究において着目したXISTゲノム領域、LIT1/ KCNQ1OT1ゲノム領域、疾患関連反復配列(CGG:100リピート)をそれぞれ搭載した。

研究成果

• [雑誌論文] Electrophysiological properties of prion-positive cardiac progenitors derived from murine embryonic stem cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujii H, Ikeuchi Y, Kurata Y, Ikeda N, Bahrudin U, Li P, Nakayama Y, Endo R, Hasegawa A, Morikawa K, Miake J, Yoshida A, Hidaka K, Morisaki T, Ninomiya H, Shirayoshi Y, Yamamoto K, Hisatome I
  • 雑誌名: Circ J 巻: 76(12) ページ: 2875-83
  • 査読あり
• [雑誌論文] Down-regulation of MutS homolog 3 by hypoxia in human colorectal cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Li J, Koike J, Kugoh H, Arita M, Ohhira T, Kikuchi Y, Funahashi K, Takamatsu K, Boland CR, Koi M, Hemmi H
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta -Molecular Cell Research 巻: 1823(4) ページ: 889-899
  • DOI: doi:10.1016/ j.bbamcr.2012.01.017
  • 査読あり
• [雑誌論文] A method for producing transgenic cells using a multi-integrase system on a human artificial chromosome vector (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi S, Kazuki Y, Nakayama Y, Nanba E, Oshimura M, Ohbayashi T
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6 ページ: e17267
  • 査読あり
• [雑誌論文] SIRT2 downregulation in HeLa can induce p53 accumulation via p38 MAPK activation-dependent p300 decrease, eventually leading to apoptosis (2011)
  • 著者名/発表者名: Li YC, Matsumori H, Nakayama Y, Osaki M, Kojima H, Kurimasa A, Ito H, Mori S, Katoh M, Oshimura M, and Inoue T
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 16 ページ: 34-45
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dysregulation of Gene Expression in the Artificial Human Trisomy Cells of Chromosome 8 Associated with Transformed Cell Phenotypes (2011)
  • 著者名/発表者名: Nawata H, Genro Kashino G, Tano K, Daino K, Shimada Y, H Kugoh H, Oshimura M, Watanabe M
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6(9) ページ: e25319
  • DOI: doi:10.1371/ journal.pone.0025319
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of PITX1 as a TERT suppressor gene located on human chromosome 5 (2011)
  • 著者名/発表者名: Qi DL, Ohhira T, Fujisaki C, Inoue T, Ohta T, Osaki M, Ohshiro E, Seko T, Aoki S, Oshimura M & Kugoh H
  • 雑誌名: Mol. Cell Biol 巻: 31(8) ページ: 1624-1636
  • DOI: doi:10.1128/ MCB.00470-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human chromosome 5 carries a transcriptional regulator of human telomerase reverse transcriptase (hTERT) (2010)
  • 著者名/発表者名: Qi DL, Ohhira T, Oshimura M, Kugoh H
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 398(4) ページ: 695-701
  • DOI: doi:10.1016/ j.bbrc.2010.07.003
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exploitation of the interaction of measles virus fusogenic envelope proteins with the surface receptor CD46 on human cells for microcell-mediated chromosome transfer (2010)
  • 著者名/発表者名: Katoh M, Kazuki Y, Kazuki K, Kajitani N, Takiguchi M, Nakayama Y, Nakamura T, Oshimura M
  • 雑誌名: BMC Biotechnology 巻: 10 ページ: 37
  • 査読あり
• [雑誌論文] Localization of an hTERT repressor region on human chromosome 3p21.3 using chromosome engineering (2010)
  • 著者名/発表者名: Abe S., Tanaka H., Notsu T., Horike S., Fujisaki C., Qi DL., Ohhira T., Gilley D., Oshimura M., Kugoh H
  • 雑誌名: Genome Integrity 巻: 1(1) ページ: 6
  • DOI: doi:10.1186/ 2041-9414-1-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] SIRT2 downregulation confers resistance to microtubule inhibitors by prolonging chronic mitotic arrest (2009)
  • 著者名/発表者名: Inoue T, Nakayama Y, Yamada H, Li YC, Yamaguchi S, Osaki M, Kurimasa A, Hiratsuka M, Katoh M, Oshimura M
  • 雑誌名: Cell Cycle 巻: 8(8) ページ: 1279-91
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification, isolation and characterization of HCN4-positive pacemaking cells derived from murine embryonic stem cells during cardiac differentiation (2009)
  • 著者名/発表者名: Morikawa K, Bahrudin U, Miake J, Igawa O, Kurata Y, Nakayama Y, Shirayoshi Y, Hisatome I
  • 雑誌名: PACE 巻: PACE-09-0353 ページ: R1
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the chromatin regions coated by non-coding Xist RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Murakami, K., Ohhira, T., Oshiro, E., Qi, D., Oshimura, M., Kugoh, H
  • 雑誌名: Cytogenetic and Genome Research 巻: 125(1) ページ: 19-25
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decreased PITX1 gene expression in human cutaneous malignant melanoma and its clinicopathological significance European
  • 著者名/発表者名: Osaki M, Chinen H, Yoshida Y, Ohhira T, Sunamura N, Yamamoto O, Ito H, Oshimura M, Kugoh H
  • 雑誌名: Journal of Dematology 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] hTERT発現を抑制するPitX1から解き明かすhTERT発現制御ネットワーク (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉川なつこ, 末松知久, 大平崇人, 押村光雄, 久郷裕之, 井上敏昭
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] 染色体免疫沈降法(ChrIP)を用いた疾患関連リピート配列に結合する因子の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 砂村直洋, 中山祐二, 荻野由加利, 難波栄二, 押村光雄, 久郷裕之
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] 新規テロメレース抑制遺伝子PITX1は悪性黒色腫の増殖を抑制する (2012)
  • 著者名/発表者名: 大平崇人, 尾崎充彦, 砂村直洋, 吉田雄一, 山元 修, 押村光雄, 久郷裕之
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] PITX1発現低下は、ヒトメラノーマの進展に関与する (2012)
  • 著者名/発表者名: 久郷裕之, 大平崇人, 砂村直洋, 井藤久雄, 押村光雄, 尾崎充彦
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌, ホテルロイトン札幌, さっぽろ芸文館, 札幌市教育文化会館
  • 年月日: 20120919-21
• [学会発表] 低酸素によるhMSH3の発現抑制と大腸がんにおけるゲノム不安定性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 逸見 仁道, 有田 通恒, 小池 淳一, 菊池 由宣, 船橋 公彦, 大平 崇人, 久郷 裕之, 近藤 元就
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌, ホテルロイトン札幌, さっぽろ芸文館
  • 年月日: 20120919-21
• [学会発表] Human artificial chromosomes for gene delivery and stable expression (2012)
  • 著者名/発表者名: M. Oshimura, Y. Kazuki, M. Hiratsuka, T. Ohbayashi, Y. Iida, N. Uno, E. Ueno, K. Ueda, T. Ohhira, H. Kurosaki, S. Abe, H. Kugoh
  • 発表場所: PepTalk, Coronado, CA, USA, HotelDel Coronado
  • 年月日: 20120109-13
• [学会発表] Characterization of a novel telomerase associated protein using microcell-mediated chromosome transfer (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Kugoh
  • 学会等名: Interdisciplinary approaches for the study of senescence (UK/Japan Collaborative Symposium in association with The Japan Society for the Promotion of Science)
  • 発表場所: Cambridge, UK, Cancer Research UK, Cambridge Research Institute
  • 年月日: 2012-02-09
• [学会発表] 特定染色体領域に集積する機能分子複合体の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 瀬古朋美, 山口繁幸, 吉村祐貴,中山祐二, 加藤基伸, 大林徹也, 押村光雄, 久郷裕之
  • 学会等名: 第56回日本人類遺伝学会
  • 発表場所: 幕張, 幕張メッセ
  • 年月日: 20111109-12
• [学会発表] 染色体導入による新規テロメラーゼ抑制遺伝子の同定 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久郷裕之, Dong-Lai Qi, 大平崇人, 太田力, 井上敏昭, 押村光雄
  • 学会等名: 第56回日本人類遺伝学会
  • 発表場所: 幕張, 幕張メッセ
  • 年月日: 20111109-12
• [学会発表] Identification of the chromatin regions coated by non-coding Xist RNA (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Kugoh, K. Murakami, E. Ohshiro, T. Ohhira and M. Oshimura
  • 学会等名: 61^<th> American Society of Human Genetics (ASHG)
  • 発表場所: Montreal, Canada, MontrealConvention Centre
  • 年月日: 20111011-15
• [学会発表] Evidence for a hTERT repressor gene on human chromosome 3p21.3 by using chromosome engineering (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Ohhira, S. Abe, H. Tanaka, T. Notsu, S. Horike, D.L. Qi, C. Fujisaki, D. Gilly, M. Oshimura, H. Kugoh
  • 学会等名: 61^<th> American Society of Human Genetics (ASHG)
  • 発表場所: Montreal, Canada, Montreal Convention Centre
  • 年月日: 20111011-15
• [学会発表] Construction of in vitro model system to understand molecular mechanism of CGG repeat expansion in Fragile X syndrome (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Nakayama, T. Seko, N. Sunamura, Y. Ogino, M. Kato, E. Nanba, M. Oshimura, H. Kugoh
  • 学会等名: 61^<th> American Society of Human Genetics (ASHG)
  • 発表場所: Montreal, Montreal Convention Centre, Canada
  • 年月日: 20111011-15
• [学会発表] A novel proteomics approach for identification of protein-RNA complex associated with specific gene loci using a human artificial chromosome (HAC) (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Seko, S. Yamaguchi, Y. Yoshimura, Y. Nakayama, M. Kato, T. Obayashi, M. Oshimura, H. Kugoh
  • 学会等名: 61^<th> American Society of Human Genetics (ASHG)
  • 発表場所: Montreal, Canada, Montreal Convention Centre
  • 年月日: 20111011-15
• [学会発表] 染色体改変技術を応用したテロメレース抑制遺伝子領域 3p21.3の同定 (2011)
  • 著者名/発表者名: 大平崇人,阿部智志,押村光雄,久郷裕之
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋, 名古屋国際会議場
  • 年月日: 20111003-05
• [学会発表] 標的ゲノム領域上の蛋白-RNA機能複合体解析(ChrIP法)に向けたヒト人工染色体(HAC)の活用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 瀬古朋美, 山口繁幸, 吉村祐貴, 青木慎介, 中山祐二, 加藤基伸, 大林徹也, 押村光雄, 久郷裕之
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] 染色体改変技術を用いたヒト3p21.3領域内のTERT抑制遺伝子の同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平崇人, 阿部智志, 田中宏美, 野津智美, 堀家慎一, 藤崎央子, Dong-Lai Qi, 押村光雄, 久郷裕之
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] ヒト15番染色体を保持したトランスクロモソミックマウスの作出 (2010)
  • 著者名/発表者名: 目黒-堀家牧子,宮野勝,杉原一司,成瀬智恵,久郷裕之,押村光雄,浅野雅秀,堀家慎一
  • 学会等名: 第4回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 米子
  • 年月日: 20100528-29
• [学会発表] Localization of an hTERT repressor region on human chromosome 3p21.3 using chromosome engineering (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平崇人, 阿部智志, 田中宏美, 野津智美, 堀家慎一, 藤崎央子, Qi Dong-Lai, David Gilley, 押村光雄,久郷裕之
  • 学会等名: がん若手研究者ワークショップ長野
  • 発表場所: アートランドホテル蓼科
  • 年月日: 2010-09-03
• [学会発表] 機能性RNAによる染色体機能制御機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 久郷裕之
  • 学会等名: 第60回染色体学会
  • 発表場所: 松江
  • 年月日: 20091100
• [学会発表] Further investigation of IMMP2L (2009)
  • 著者名/発表者名: N. H. Sykes, A. T. Pagnamenta, G. Lunter, H. Kugoh, M. Oshimura, Elena Bacchelli, Elena Maestrini, A. J. Bailey, A. P. Monaco
  • 学会等名: LRRN3 and DOCK4 as potential candidate genes for autism susceptibility
  • 発表場所: ASHG, Hawaii
  • 年月日: 20091020-24
• [備考] Nature日本語版FOCUS:長鎖ncRNAが操る「生命現象の裏社会」に.研究が紹介された。2011年12月
  • URL: http://www.natureasia.com/japan/nature/ad-focus/111201.php