光応答性RNA結合リガンドを用いたRNA機能の制御

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21200042
• 研究種目: 新学術領域研究(研究課題提案型)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物分子科学; 生体関連化学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 堂野 主税 大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (60420395)
• 連携研究者: 中谷 和彦 大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (70237303)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 分子認識 / ケミカルバイオロジー / バイオテクノロジー / RNA / DNA / ミスマッチ / 分子糊 / 光スイッチ

研究概要

非翻訳RNAが多様な生体反応に直接関与することが知られるようになったが、RNAの多様かつ複雑な高次構造がさまざまなRNA機能を創出している。これら広範なRNA機能を小分子結合にともなう構造変化により制御することを指向して、RNAの特異構造に選択的に結合する人工小分子リガンドを創製した。小分子結合に伴うRNA構造変化を制御機構に組み込んだ人工的なリボスイッチ型翻訳制御を実証した。

研究成果

• [雑誌論文] Naphthyridine tetramer with a preorganized structure for 1:1 binding to a CGG/CGG sequence (2011)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C.; Kohyama, I.; Hong, C.; Nakatani, K.
  • 雑誌名: Nucleic. Acids. Res. 巻: 40 ページ: 2771-2781
  • 査読あり
• [雑誌論文] Control of DNA hybridization by photoswitchable molecular glue (2011)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C.; Nakatani, K.
  • 雑誌名: Chem. Soc. Rev. 巻: 40 ページ: 5718-5729
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular-Glue-Triggered DNA Assembly To Form a Robust and Photoresponsive Nano-Network (2011)
  • 著者名/発表者名: Wang, C.; Pu, F.; Lin, Y.; Ren, J.; Dohno, C.; Nakatani K.; Qu, X.
  • 雑誌名: Chem. Eur. J. 巻: 17 ページ: 8189-8197
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ligand Inducible Assembly of a DNA Tetrahedron (2011)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C.; Atsumi, H.; Nakatani, K.
  • 雑誌名: Chem. Commun. 巻: 47 ページ: 3499-3501
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Light-Driven, Supramolecular Optical Switch (2009)
  • 著者名/発表者名: Uno, S.; Dohno, C.; Bittermann, H.; Malinovskii, V. L.; Haner, R.; Nakatani, K.
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. 巻: 48 ページ: 7362-7365
  • 査読あり
• [雑誌論文] Photoswitchable Unsymmetrical Ligand for DNA Hetero-Mismatches (2009)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C.; Yamamoto, T.; Nakatani, K.
  • 雑誌名: Eur. J. Org. Chem. ページ: 4051-4058
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Effect of Linker Length on Binding Affinity of a Photoswitchable Molecular Glue for DNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C.; Uno, S.; Sakai, S.; Oku, M.; Nakatani, K.
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem. 巻: 17 ページ: 2536-2543
  • 査読あり
• [学会発表] Design and synthesis of RNA binding ligand for regulating gene expression (2012)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C. (代表)
  • 学会等名: 243rd American Chemical Society National Meeting
  • 発表場所: サンディエゴ(米国)
  • 年月日: 2012-03-27
• [学会発表] Naphthyridine tetramer functions as a molecular glue for DNA and RNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C. (代表)
  • 学会等名: 第38回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
  • 年月日: 2011-11-09
• [学会発表] Photoswitchable molecular glue for hybridization of nucleic acids (2011)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C. (代表)
  • 学会等名: XVth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components
  • 発表場所: チェスキークルムロフ(チェコ)
  • 年月日: 2011-06-07
• [学会発表] Photoswitchable molecular glue for DNA Nanotechnology (2011)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C. (代表)
  • 学会等名: International Symposium: Advanced Science and Technology for Single Molecular Analysis of DNA and Related Molecules (ISSMA2011)
  • 発表場所: 京都国際会議場(京都)(招待講演)
  • 年月日: 2011-01-25
• [学会発表] Photoswitching of DNA hybridization by a small synthetic ligand (2010)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C. (代表)
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2010)
  • 発表場所: ホノルル(米国)
  • 年月日: 2010-12-17
• [学会発表] Recognition of nucleic acids by tetrameric naphthyridine derivatives (2010)
  • 著者名/発表者名: Kohyama, I
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2010)
  • 発表場所: ホノルル(米国)
  • 年月日: 2010-12-17
• [学会発表] Binding of tetrameric naphthyridine derivatives to DNA containing a GG-mismatch (2010)
  • 著者名/発表者名: Dohno, C. (代表)
  • 学会等名: 第37回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: はまぎんホール(横浜)
  • 年月日: 2010-11-11
• [学会発表] 光応答性分子糊を用いたDNA光スイッチングデバイス (2010)
  • 著者名/発表者名: 堂野主税(代表)
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会
  • 発表場所: 近畿大学(大阪府)
  • 年月日: 2010-03-27
• [学会発表] 核酸二次構造安定性を大きく変化させる新規光応答性小分子リガンド (2009)
  • 著者名/発表者名: 堂野主税(代表)
  • 学会等名: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学(福岡県)(招待講演)
  • 年月日: 2009-09-13