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2010 年度 実績報告書

性差のエピゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 21221008
研究機関東京大学

研究代表者

塩田 邦郎  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80196352)

研究分担者 八木 慎太郎  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 特任教授 (10420225)
大鐘 潤  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (50313078)
中山 裕之  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (40155891)
種村 健太郎  東京大学, 国立医薬品食品衛生研究所・毒性部, 主任研究官 (20332322)
キーワードDNAメチル化プロフィール / T-DMR / 発生分化 / 性依存性 / 常染色体 / 性染色体
研究概要

平成21年度のゲノム全域のDNAメチル化解析(D-REAM法)の結果を基とし、同定したT-DMRの解析および新たに精子・精原細胞を含む複数の組織・細胞のD-REAM法による解析を進めた。
性ホルモン依存性T-DMRの同定と発生・分化のDNAメチル化ダイナミクス:21年度に同定したT-DMRのうち複数領域について、性腺切除・性ホルモン付加手術を施した成熟雌・雄マウスの主要な組織(肝臓・大脳等)でのメチル化状況を調べた。その結果雄性ホルモン依存的にメチル化が変化する領域を見いだした。この領域のメチル化状況は発生時期依存的に変化することも確認した。
性染色体の染色体全域のメチル化変化:未分化ES細胞と成体組織とを比較すると、常染色体、性染色体ともに、雌雄共通したT-DMRを同定することができ、ESで脱メチル化している遺伝子の周辺にはSINE、メチル化されている遺伝子周辺にはLINEが多いという特徴を示した。しかしX染色体に着目すると、雄では成体で高メチル化を示すのに対し、雌では成体で低メチル化と雌雄で異なる傾向を示した。興味あることにX染色体はLINEが多くSINEがほとんど無いという特徴を持つことから、X不活化とDNAメチル化プロフィールの形成との関連について新たな切り口を与えている。さらに雌雄で異なるメチル化変動を示す遺伝子には、複数の疾患関連遺伝子が含まれることが判明した。
少量サンプルの解析技術の確立:T-DMRの多領域・少量サンプルメチル化解析技術確立を目的とし、T-DMRを持つ遺伝子の多領域・少量サンプルでの発現解析法の検討を行い、系を確立した。
卵特有ピストン(Hlfoo)のDNAメチル化プロフィール形成への関与:Hlfooは、卵でのみ発現し、受精後速やかに消失する。またHlfoo遺伝子はT-DMRを有し、雄や雌組織で高度にメチル化される。雄のES細胞にHlfooを強制発現させたところ、一部の卵子形成に重要な遺伝子領域のメチル化が変化することを確認し、卵子のDNAメチル化プロフィール形成に関与することが示唆された。

  • 研究成果

    (18件)

すべて 2010 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (10件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Enrichment of short interspersed transposable elements to embryonic stem cell-specific hypomethylated gene regions.2010

    • 著者名/発表者名
      H.Muramoto, et al.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 15 ページ: 855-865

    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNA methylation status of nuclear-encoded mitochondrial genes underliesthe tissue-dependent mitochondrial functions.2010

    • 著者名/発表者名
      M.Takasugi, et al.
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 11 ページ: 481

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide DNA methylation profile of tissue-dependent and differentially methylated regions (T-DMRs) residing in mouse pluripotent stem cells.2010

    • 著者名/発表者名
      S.Sato, et al.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 15 ページ: 607-618

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide analysis of epigenetic signatures for kidney-specific transporters.2010

    • 著者名/発表者名
      R.Kikuchi, et al.
    • 雑誌名

      Kidney Int

      巻: 78 ページ: 569-577

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 細胞・組織特異的DNAメチル化領域-ES細胞、ips細胞及び組織のDNA2010

    • 著者名/発表者名
      村本玄紀, 他
    • 雑誌名

      実験医学(増刊)

      巻: 28 ページ: 81-86

  • [雑誌論文] エイジングおよびアンチエイジングのためのエピジェネティクス2010

    • 著者名/発表者名
      早川晃司, 他
    • 雑誌名

      アンチエイジング医学-日本抗加齢医学会雑誌

      巻: 6(1) ページ: 50-57

  • [雑誌論文] 肥満・肥満症の成因と発症機序 エピジェネティック調節2010

    • 著者名/発表者名
      高杉征樹, 他
    • 雑誌名

      日本臨林

      巻: 68(2) ページ: 307-312

  • [学会発表] 細胞・組織特異転写因子ネットワークのエピジェネティクス2010

    • 著者名/発表者名
      塩田邦郎
    • 学会等名
      第51回日本組織細胞化学会総会
    • 発表場所
      秋葉原コンベンションホール(東京)
    • 年月日
      20100904-20100905
  • [学会発表] Transposable elements are genomic landmarks for DNA hypomethy lation specific to embryonic stem cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Muramoto, et al.
    • 学会等名
      75th Cold Spring Harbor Symposium : Nuclear Organization & Function
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor, NY, U.S.A
    • 年月日
      20100602-20100607
  • [学会発表] ES細胞特異的低メチル化遺伝子領域は特徴的な反復配列分布を示す/Enrichment of short interspersed transposable elements(SINEs)to embryonic stem cell(ESCs)-specific hypomethylated gene regions.2010

    • 著者名/発表者名
      村本玄紀, 他
    • 学会等名
      第4回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      米子市文化ホール(鳥取県)
    • 年月日
      20100528-20100529
  • [学会発表] Genome-wide DNA methylation profile of pluripotent stem Cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Shinya Sato, et al.
    • 学会等名
      Experimental Biology2010
    • 発表場所
      Anaheim, CA, U.S.A
    • 年月日
      20100424-20100428
  • [学会発表] Epigenetic marks of nuclear-encoded mitochondrial genesby DNA methylation.2010

    • 著者名/発表者名
      Masaki Takasugi, et al.
    • 学会等名
      Experimental Biology2010
    • 発表場所
      Anaheim, CA, U.S.A
    • 年月日
      20100424-20100428
  • [学会発表] Gene-orientation-dependent DNA methylation patterns in the mouse prolactin(Prl)family gene cluster locus.2010

    • 著者名/発表者名
      Koji Hayakawa, et al.
    • 学会等名
      Experimental Biology2010
    • 発表場所
      Anaheim, CA, U.S.A
    • 年月日
      20100424-20100428
  • [学会発表] Enrichment of Short interspersed transposable elements(SINEs) in hypomethy lated genic regions in embryonic stem cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Muramoto, et al.
    • 学会等名
      Experimental Biology2010
    • 発表場所
      Anaheim, CA, U.S.A
    • 年月日
      20100424-20100428
  • [学会発表] Epigenetic marks of nuclear-encoded mitochondoria genes by DNA.2010

    • 著者名/発表者名
      Masaki Takasugi, et al.
    • 学会等名
      Experimental Biology2010
    • 発表場所
      Anaheim, CA, U.S.A
    • 年月日
      20100424-20100428
  • [学会発表] 環境リスクのエピジェネティクスとエピゲノム研究2010

    • 著者名/発表者名
      塩田邦郎
    • 学会等名
      日本薬学会環境衛生部会主催フォーラム2010:衛生薬学・環境トキシコロジーにおけるフォーラム
    • 発表場所
      星薬科大学(東京)
    • 年月日
      2010-09-09
  • [学会発表] Epigenomic Profiling 0f Mouse Intostinal Mucosa2010

    • 著者名/発表者名
      八木慎太郎
    • 学会等名
      JST-食の安全研究センター共催ワークショップThe ROLE OF NUTRITION AND MICROBIOTAIN EARLY LIFE
    • 発表場所
      東京大学農学部食の安全研究センター(東京)
    • 年月日
      2010-03-08
  • [備考]

    • URL

      http://www.vm.a.u-tokyo.ac.jp/seika/

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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