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平成25年度は前年度に引き続き予備調査の臨床データの詳細なデータ（呼気皮膚ガス分析，静脈血採決結果，皮膚特性，生活習慣に関するアンケート，心理テスト，臨床診断）の解析を行い，代表的な疾患における生体ガスパターンを検討した．さらに生体ガス成分と各種健康情報との相関関係を検討した．生体ガス診断の基礎となる診断アルゴリズムも検討した．これに基づいた診断プログラムを試作する一方，国立循環器病センター予防検診部コホート調査（吹田スタディ）参加の被験者を対象とした呼気ガス分析を継続した．吹田市住民登録票から無作為抽出された年間検診者（成人）2000名が2年間に一度の検診を受けるシステムとなっており，その中から同意の得られる1000名（年間見込み）を目標例数とし，呼気分析のベースラインデータの収集を開始した．平成25年度末には新規400人のコホート初期断面調査データを集積した．2年ごとに追跡調査を行い，約2/3の追跡データも追加できた．このコホート調査の初期断面調査から仮説「生体ガス中の代表的な低分子化合物により鑑別診断が可能である」ならびに仮説「生体ガススペクトラムにより種々の生活習慣が推定できる」の妥当性を裏付ける結果が得られた．さらに予備データをもとにしたプログラムに毎年得られる臨床データを追加し，累計1700名のガスデータを蓄積し，解析アルゴリズムの修正とプログラム作成のための基礎データの充実をはかることができた．主たる疾患は循環器疾患，消化器・代謝疾患であった．他方，生体ガス分析から生体内活性酸素生成量の推定法を考案した．また，レーザー誘起蛍光法により皮膚ガス中にも活性酸素が存在し，定量的評価が可能であることを実証した．さらに呼気分析の有用性を実証する目的で，肺高血圧症動物モデルを作成し，呼気と生体内各臓器における水素分子，一酸化炭素などの低分子ガス分子の相関，生体内ガス分布も検討した．
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