新時代の要求に対応できる革新的RNA合成法の開拓

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21241053
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 関根 光雄 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (40111679)
• 研究分担者: 大窪 章寛 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (60376960)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 生体高分子

研究概要

塩基部を全く保護しないで選択的にリボヌクレオシドの2'-水酸基にシアノエチル基や2-(N-メチルカルバモイル)エチル(MCE)基を導入する新規マイケル付加反応を開拓した。この反応を用いて固相合成用モノマーユニットを合成し、2'-O-修飾RNAの合成し、筋ジストロフィー治療薬の活性の目安になるエキソン.スキッピング活性を調べたところ従来の核酸医薬より優れた活性をもつことを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Synthesis and Properties of Cationic 2'-O-[ N-(4-aminobutyl) carbamoyl] modified Oligonucleotides. (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Seio, M. Tokugawa, T. Kanamori, H. Tsunoda, A. Ohkubo, and M. Sekine
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem. Lett 巻: 22巻 ページ: 2470-2473
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA Duplexes and Triplex-Forming Oligodeoxynucleotides Incorporating Modified Nucleosides Forming Stable and Selective Triplexes (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Kanamori, Y. Masaki, M. Mizuta, H. Tsunoda, A. Ohkubo, M. Sekine, and K. Seio
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem 巻: 10巻 ページ: 1007-1013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Formation of New Base Pairs between Inosine and 5-Methyl-2-thiocytidine Derivatives (2012)
  • 著者名/発表者名: A. Ohkubo, Y. Nishino, Y. Ito, H. Tsunoda, K. Seio, and M. Sekine
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem 巻: 10巻 ページ: 10-13
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis of 2'-O-[ 2-(N-Methylcarbamoyl) ethyl] ribonucl eosides Using Oxa-Michael Reaction and Chemical and Biological Properties of Oligonucleotide Derivatives Incorporating These Modified Ribonucleosides (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Yamada, N. Okaniwa, H. Saneyoshi, A. Ohkubo, K. Seio, T. Nagata, Y. Aoki, S. Takeda, and M. Sekine
  • 雑誌名: J. Org. Chem 巻: 76巻 ページ: 3042-3053
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and Hybridization Properties of 2'-O-Methylated Oligoribonucleotides Incorporating 2'-O-Naphthyluridines (2011)
  • 著者名/発表者名: M. Sekine, Y. Oeda, Y. Iijima, H. Taguchi, A. Ohkubo, and K. Seio
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem 巻: 9巻 ページ: 210-218
  • 査読あり
• [雑誌論文] Linear Relationship between Deformability and Thermal Stability of 2'-O-Modified RNA Hetero Duplexes (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Masaki, R. Miyasaka, A. Ohkubo, K. Seio, and M. Sekine
  • 雑誌名: J. Phys. Chem.(B) 巻: 114巻 ページ: 2517-2524
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis of 6-N-(Benzothiazol-2-yl) deoxyadenosine and Its Exciton-coupled Circular Dichroism (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Masaki, A. Ohkubo, K. Seio, and M. Sekine
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem 巻: 18巻 ページ: 567-572
  • 査読あり
• [雑誌論文] icrowave-Assisted Synthesis of 2'-O-Aryluridine Derivatives (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Oeda, Y. Iijima, H. Taguchi, A. Ohkubo, K. Seio, and M. Sekine
  • 雑誌名: Org. Lett 巻: 11巻 ページ: 5582-5585
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and hybridization of 2'-O-methyl-RNAs incorporating 2'-O-carbamoyluridine and unique participation of the carbamoyl group in U. G base pair (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Seio, R. Tawarada, T. Sasami, M. Serizawa, M. Ise, A. Ohkubo, and M. Sekine
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem 巻: 17巻 ページ: 7275-7280
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient solid-phase synthesis of oligodeoxynucleotides having a 5'-terminal 2, 2, 7-trimethylguanosine pyrophosphate linkage (2009)
  • 著者名/発表者名: A. Ohkubo, K. Sasaki, Y. Noma, H. Tsunoda, K. Seio, and M. Sekine
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem 巻: 17巻 ページ: 4819-4824
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and Properties of Nucleoside Derivatives Masked by the Chemically Stable 2-(Trimethylsilyl) benzoyl Group (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Yamada, H. Taguchi, A. Ohkubo, K. Seio, and M. Sekine
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem 巻: 17巻 ページ: 5928-5932
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis of terminally modifiedoligonucleotides and their hybridization dependence on the size of the target RNAs (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Seio, Y. Takaku, K. Miyazaki, Y. Masaki, A. Ohkubo, and M. Sekine
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem 巻: 7巻 ページ: 2440-2451
  • 査読あり
• [雑誌論文] 3'-Terminal Nucleosides Having a SilylLinker into Polymer Supports without Base Protection (2009)
  • 著者名/発表者名: A. Ohkubo, Y. Noma, K. Aoki, H. Tsunoda, K. Seio and M. Sekine
  • 雑誌名: J. Org. Chem 巻: 74巻 ページ: 2817-2823
  • 査読あり
• [学会発表] 6-チオプリンおよび4-チオピリミジン誘導体を含むオリゴヌクレオチドの合成とその三重鎖形成能 (2012)
  • 著者名/発表者名: 服部勇作・印出健志・山田健司・伊藤優・角田浩佑・大窪章寛・清尾康志・関根光雄
  • 学会等名: 第92春季年会
  • 発表場所: 慶應大学
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] DNA二重鎖および三重鎖に導入したデオキシシュードイソシチジンの塩基対形成能の評価 (2012)
  • 著者名/発表者名: 金森功吏・山口慧・角田浩佑・大窪章寛・関根光雄・清尾康志
  • 学会等名: 第92春季年会
  • 発表場所: 慶應大学
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] 4-O-(アミノエチル)ウリジン誘導体を含む新規三重鎖形成核酸の合成とその性質 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤優・山田健司・角田浩佑・大窪章寛・清尾康志・関根光雄
  • 学会等名: 第92春季年会
  • 発表場所: 慶應大学
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] TMGキャップアナロクを有するモルフォリノ核酸の合成 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田研・横内瑛・鈴木真・角田浩佑・大窪章寛・清尾康志・関根光雄
  • 学会等名: 第21回アンチセンスシンポジウムおよび第11回遺伝子・デリバリー研究会シンポジウム
  • 発表場所: 大阪大学コンベンションセンター
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] 新規人工核酸の創成研究 (2011)
  • 著者名/発表者名: 関根光雄
  • 学会等名: 日本化学会関東支部主催群馬地区講演会
  • 発表場所: 群馬大学
  • 年月日: 2011-07-08
• [学会発表] Synthesis and Biological Properties of Synthesis and Biological Properties of 2'-O-Modified Oligoribonucleotide Derivatives (2011)
  • 著者名/発表者名: M. Sekine
  • 学会等名: XVth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components SCNAC 2011
  • 発表場所: Cechy, eska republika
  • 年月日: 2011-06-09
• [学会発表] Synthesis and Properties of Modified Oligonucleotides Capable Triplex Formation with DNA Duplexes under Neutral Conditions (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Sekine
  • 学会等名: 2010環太平洋国際化学会議
  • 発表場所: Hawaii, Convention Center, USA
  • 年月日: 2010-12-15
• [学会発表] 2'-O-MCEオリゴヌクレオチドの合成と性質 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田剛史、岡庭夏己、武田伸一、永田哲也、實吉尚郎、大窪章寛、関根光雄
  • 学会等名: 第20回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 甲南大学
  • 年月日: 2010-12-02
• [学会発表] Synergetic effects of 2-thiolation and 5-propynylation of the uracil base on the stability of RNA duplexes (2010)
  • 著者名/発表者名: R. Miyasaka, Y. Masaki, H. Tsunoda, A. Ohkubo, K. Seio, and M. Sekine
  • 学会等名: 第37回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: よこはま・はまぎんホール
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] Synthesis and Properties of 2'-O-[ 2-(N-methyl) carbamoyl] ethyl-RNAs (2010)
  • 著者名/発表者名: T. Yamada, N. Okaniwa, H. Saneyoshi, A. Ohkubo, K. Seio, T. Nagata, S. Takeda, and M. Sekine
  • 学会等名: 第37回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: よこはま・はまぎんホール
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] 新規核酸医薬の創成を指向した合成研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 関根光雄
  • 学会等名: 第54回日本薬学会関東支部大会
  • 発表場所: 東京薬科大学
  • 年月日: 2010-10-02
• [学会発表] Relationship Between Thermal Stability and Deformability of Modified RNA, XIX International Round Table on Nucleosides (2010)
  • 著者名/発表者名: 正木慶昭・宮坂隆太・角田浩佑・大窪章寛・清尾康志・関根光雄
  • 学会等名: Nucleotides and Nucleic Acids
  • 発表場所: クロードベルナールリヨン第一大学
  • 年月日: 2010-09-01
• [学会発表] New Triplex Forming Oligonucleotides Capable of Binding to DNA Duplexes under Neutral Conditions (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Sekine
  • 学会等名: Heidelberg University-Tokyo Institute of Technology Joint Symposium on
  • 発表場所: Wroclaw University, Poland
  • 年月日: 2010-07-16
• [学会発表] Triplex Forming ligonucleotides Containing Thiolated Nucleobases (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Sekine
  • 学会等名: ICPC2010-Symposium on Biophosphates
  • 発表場所: Wroclaw University, Poland
  • 年月日: 2010-07-16
• [備考]
  • URL: http://www.skn.bio.titech.ac.jp/Home.ht