藻類・プロティスト複合系の多様性研究の基盤構築

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21247010
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 井上 勲 筑波大学, 生命環境系, 教授 (70168433)
• 研究分担者: 渡辺 信 筑波大学, 生命環境系, 教授 (10132870) ; 橋本 哲男 筑波大学, 生命環境系, 教授 (50208451) ; 石田 健一郎 筑波大学, 生命環境系, 教授 (30282198) ; 稲垣 祐司 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (50387958) ; 中山 剛 筑波大学, 生命環境系, 講師 (40302369) ; 菊地 淳 独立行政法人理化学研究所, 植物科学研究センター, チームリーダー (00321753) ; 守屋 繁春 独立行政法人理化学研究所, 基幹研究所, 専任研究員 (00321828)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2012
• キーワード: 環境 / 進化 / 分類学 / 生態学 / 原生生物

研究概要

水圏生態系における真核微生物と環境物質の多様性の形成・維持・崩壊に関わる要因や関係性を包括的に理解するための手法開発を目的とし,環境サンプルの顕微鏡観察,メタボローム解析,クロロフィル代謝物分析,メタゲノム解析を実施した。総合解析の結果,生物相の時空間変動に伴って変動する有機成分の存在や,プロティストの捕食活性指標となりうる代謝物質を特定した。また調査地から単離した培養株を用いて,未記載種や再考が必要な分類群の系統分類学的研究を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Physicochemical characterization of complex biochemical mixtures from diversed seaweeds (2012)
  • 著者名/発表者名: Date Y, Sakata K and Kikuchi J.
  • 雑誌名: Polymer J. 巻: 44 ページ: 888-894
  • DOI: DOI:10.1038/pj.2012.105
  • 査読あり
• [雑誌論文] Esquamula lacrimiformis n. g., n. sp., a New Member of Thaumatomonads that Lacks Siliceous Scales (2012)
  • 著者名/発表者名: Shiratori T, Yabuki A, Ishida K.
  • 雑誌名: The Journal of Eukaryotic Microbiology. 巻: 59 ページ: 527-536
  • DOI: DOI:The Journal of Eukaryotic Microbiology.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ubiquity and quantitative significance of detoxification catabolism of chlorophyll associated with protistan herbivory. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y, Yokoyama A, Kinoshita Y, Shoji S, Miyashiya H, Shiratori T, Suga H, Ishikawa K, Ishikawa A, Inouye I, Ishida K,Fujinuma D, Aoki K, Kobayashi M, Nomoto S, Mizoguchi T and Tamiaki H
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 巻: 109(43) ページ: 1728-1735
  • URL: http://www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.1207347109
  • 査読あり
• [雑誌論文] ECOMICS: A web-based toolkit for investigating the biomolecular web in ecosystems using a transomics Approach. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogata Y, Chikayama E, Morioka Y, Everroad RC, Shino A, Matsushima A, Haruna H, Moriya S, Toyoda T, and Kikuchi J
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 7 ページ: e30263.
  • DOI: DOI:10.1371/journal.pone.0030263
  • 査読あり
• [雑誌論文] ECOMICS: Ecosystem Trans-OMICS Tools and Methods for Complex Environmental Samples and Datasets. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi J, Ogata Y and Shinozaki K
  • 雑誌名: J. Ecosys. Ecogr. 巻: S2 ページ: 1
  • DOI: DOI:10.4172/2157-7625.S2-001.
  • 査読あり
• [学会発表] 沿岸域におけるクロロフィル誘導体と真核微生物相の時空間変動解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子, 柏山祐一郎, 守屋繁春, 民秋均, 井上勲
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2013年大会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2013-05-19
• [学会発表] Seasonal succession of eukaryotic community detected by environmental sequences in Tokyo Bay (2012)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama A, Kikuchi J, Tsuboi Y, Moriya S, Inagaki Y, Hashimoto T and Inouye I.
  • 学会等名: Japan. Protist 2012
  • 発表場所: Oslo
  • 年月日: 2012-08-02
• [学会発表] Morphology and phylogeny of a new imbricatean flagellate (phylum Cercozoa). (2012)
  • 著者名/発表者名: Shiratori T, Yokoyama A and Ishida K
  • 学会等名: Japan. Protist 2012
  • 発表場所: Oslo
  • 年月日: 2012-08-02
• [学会発表] メタゲノミクスで探る東京湾沿岸の藻類・プロティスト相 (2012)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子, 守屋繁春, 稲垣佑司, 橋本哲男, 白鳥峻志, 中山 剛, 石田健一郎,井上勲
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2012年大会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2012-05-20
• [学会発表] 単離操作を経ない生体分子群および微生物叢複合系解析がもたらすインパクト (2012)
  • 著者名/発表者名: 菊地淳
  • 学会等名: 日本農芸化学会2012年度京都大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] オミクス情報に基づく藻類・プロティスト複合系の多様性解明へのアプローチ (2011)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子,守屋繁春,菊地淳,兪一〓,Evarroad C,Ogawa D,皿井千裕,稲垣祐司,中山剛,石田健一郎,橋本哲男,渡辺信,井上勲
  • 学会等名: 日本藻類学会35回大会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2011-03-28
• [学会発表] Complehensive understanding of eco-system by omics science. (2010)
  • 著者名/発表者名: Moriya S
  • 学会等名: Memorial Symposium for the 26th International Prize for Biology. Biology of Symbiosis.
  • 発表場所: Tsukuba
  • 年月日: 20101207-08
• [図書] 藻類ハンドブック (2012)
  • 著者名/発表者名: 井上勲
  • 総ページ数: 4-10
  • 出版者: NT出版