研究課題
マウスの大脳皮質形成をモデルとして、エクソンの網羅的発現解析により、神経分化・成熟過程で起こる遺伝子の発現様式の変化をスプライシングパターンおよびRNA結合蛋白発現量に注目してプロファイリング解析を行った。1)エクソンの網羅的発現解析:大脳皮質形成時の神経分化に特異的スプライシングパターンを示す遺伝子を同定するため、マウスの胎児期の大脳皮質形成過程において、未分化神経幹細胞の存在する脳質周囲領域と、分化した神経細胞の存在する形成途上の神経層を、脳のスライスを作成した後に分離し、それぞれからmRNAを抽出した。このmRNAをexonごとの発現解析を行い、大脳皮質形成時の神経細胞分化・成熟過程で、スプライシングによるアイソフォーム変化を起こす遺伝子および、層ごとに発現レベルの異なるスプライシング調節因子(RNA結合タンパク)を同定した。2)発現プロファイリング解析:エクソンアレイのデーターから大脳皮質形成時にスプライシングが変化する遺伝子リストを作成した後に、NCBI Gene database,Gene Ontology Termおよびこれまでの機能解析の文献報告により、それらを機能により分類し、さらに遺伝性神経疾患データーベース(OMIM;Online Mendelian Inheritance in Man)と照らし合わせることにより、スプライシングのパターン変化が、大脳皮質形成・成熟に必須であると推定される候補遺伝子を絞りこんだ。
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