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2009 年度 実績報告書

脊椎動物共通DOP-PCRプライマーを用いた大規模遺伝子発現解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21310044
研究機関酪農学園大学

研究代表者

寺岡 宏樹  酪農学園大学, 獣医学部, 教授 (50222146)

研究分担者 遠藤 大二  酪農学園大学, 獣医学部, 教授 (40168828)
岩田 久人  愛媛大学, 学内共同利用施設, 教授 (10271652)
キーワードオミックス / エコトキシコロジー / ダイオキシン / ゼブラフィッシュ / ニワトリ / カワウ
研究概要

Unigeneが公開されている8種(カニクイザル、イヌ、ウシ、マウス、ニワトリ、ニシツメガエル、トラフグ、ゼブラフィッシュ)において8merの場合11, 143の共通反復倒置配列が存在した。この中から8merにおいて各動物毎の標的遺伝子数が50~500、GC含有数が5または6という条件から275種を選定し、特異配列としたモノプライマーを設計した。このプライマーセットは各動物種で全トランスクリプトームのうち約20~43%を標的としている。これら275種の脊椎動物共通DOPモノプライマーを用いてdifferential display (DD)法を実施した結果、2, 3, 7, 8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD)暴露によりゼブラフィッシュ全身およびニワトリ胚の肝臓で発現量を著変させる既知および未知の遺伝子群を検出することができた。また、前述の8種以外であり遺伝的背景が知られていない野生動物であるカワウ胚の肝臓に対して本法を実施したところ、同様に対照群と比べてTCDD暴露群において発現量が変化したバンドが得られた。従って、本脊椎動物共通DOP-PCRモノプライマーを用いたDD法は遺伝子情報が明らかでない多様な動物種を対象とした新しい半網羅的な遺伝子発現解析法として有用であることが示唆された。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2009

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] M3 muscarinic receptors mediate positive inotropic responses…2009

    • 著者名/発表者名
      Kitazawa-T., et al.
    • 雑誌名

      J.Pharmacol.Exp.Ther. 330

      ページ: 487-493

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A helminthological survey in the waterfowls including Ardeidae,…2009

    • 著者名/発表者名
      Yoshino-T., et al.
    • 雑誌名

      J.Yamashina.Inst.Ornithol. 41

      ページ: 42-54.

    • 査読あり
  • [雑誌論文]2009

    • 著者名/発表者名
      藤田正一, ら
    • 雑誌名

      魚類のP450酵素系(P450の分子生物学 第2版)(講談社)

      ページ: 195-208

  • [学会発表] Role of cytochrome P450 1C genes in the reduced mesencephalic…2009

    • 著者名/発表者名
      Kubota-A., et al.
    • 学会等名
      15th International Symposium on Pollutants Responses in Marine Organisms
    • 発表場所
      ボルドー(フランス)(●)
    • 年月日
      20090518-20090520
  • [学会発表] 半網羅的ディファレンシャル・ディスプレイ法システムの構築2009

    • 著者名/発表者名
      寺岡宏樹, ら
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2009-12-10
  • [学会発表] ダイオキシンによる発達中ゼブラフィッシュの頭部循環障害における…2009

    • 著者名/発表者名
      寺岡宏樹, ら
    • 学会等名
      第36回日本トキシコロジー学会学術年会
    • 発表場所
      岩手県盛岡市
    • 年月日
      2009-07-07

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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