脊椎動物共通DOP-PCRプライマーを用いた大規模遺伝子発現解析法の開発

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21310044
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 放射線・化学物質影響科学
• 研究機関: 酪農学園大学
• 研究代表者: 寺岡 宏樹 酪農学園大学, 獣医学部, 教授 (50222146)
• 研究分担者: 遠藤 大二 酪農学園大学, 獣医学群, 教授 (40168828) ; 岩田 久人 愛媛大学, 学内共同利用施設, 教授 (10271652)
• 連携研究者: 古川 龍彦 鹿児島大学, 医歯学総合研究科, 教授 (40219100) ; 寳來 佐和子 鳥取大学, 地域学部, 准教授 (60512689)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: オミックス / エコトキシコロジー / カワウ / ゼブラフィッシュ / ダイオキシン / ニワトリ

研究概要

マイクロアレイ法はあらかじめ明確なトランスクリプトームを必要とするため、環境中の多様な動物種には必ずしも適当でない。本研究では魚類から高等哺乳類までの7種の動物に共通した8mer程度の反復倒置配列がトランスクリプトームの約30%に存在することを明らかにした。Degenerate oligonucleotide-primed PCR(DOP-PCR)法に基づき、誤増幅率を考慮すれば40-70%を増幅する可能性がある275種の共通プライマーを選定した。このシステムを用いて、ダイオキシン感受性遺伝子をニワトリの他、遺伝的背景に乏しいカワウ胚の肝臓でも見いだすことが出来た。

研究成果

• [雑誌論文] Differential display system with vertebrate-common degenerate oligonucleotide primers : uncovering genes responsive to dioxin in avian embryonic liver (2012)
  • 著者名/発表者名: Teraoka H, Ito S, Ikeda H, Kubota A, Elmagd M M A, Kitazawa T, Kim EY, Iwata H, Endoh D.
  • 雑誌名: Environ Sci Technol 巻: 46 ページ: 27-33
• [雑誌論文] Role of zebrafish cytochrome P450 CYP1C genes in the reduced mesencephalic vein blood flow caused by activation of AHR2 (2011)
  • 著者名/発表者名: Kubota A, Stegeman JJ, Woodin BR, Iwanaga T, Harano R, Peterson RE, Hiraga T, Teraoka H.
  • 雑誌名: Toxicol Appl Pharmacol 巻: 253 ページ: 244-252
• [雑誌論文] Expression of two novel cytochrome P450 3A131 and 3A132 in liver and small intestine of domestic cats (2011)
  • 著者名/発表者名: Honda K, Komatsu T, Koyama F, Kubota A, Kawakami K, Asakura H, Uno Y, Kitazawa T, Hiraga T, Teraoka H.
  • 雑誌名: J Vet Med Sci 巻: 73 ページ: 1489-1492
• [雑誌論文] Malformation of certain brain blood vessels caused by TCDD activation of Ahr2/Arnt1 signaling in developing zebrafish (2010)
  • 著者名/発表者名: Teraoka H, Ogawa A, Kubota A, Stegeman JJ, Peterson RE, Hiraga T.
  • 雑誌名: Aquat Toxicol 巻: 99 ページ: 241-247
• [雑誌論文] Molecular cloning and expression of cytochrome P450 2D6 in the livers of domestic cats (2010)
  • 著者名/発表者名: Komatsu T, Honda K, Kubota A, Kitazawa T, Hiraga T, Teraoka H.
  • 雑誌名: J Vet Med Sci 巻: 72 ページ: 1633-1636
• [雑誌論文] Large-scale survey of mitochondrial D-loop of the Red-crowned Crane Grus japonensis in Hokkaido, Japan by convenient genotyping method
  • 著者名/発表者名: Miura Y, Shiomi A, Shiraishi J, Makita K, Asakawa M, Kitazawa T, Hiraga T, Momose Y, Momose K, Masatomi H, Teraoka H.
  • 雑誌名: J Vet Med Sci 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Changes of Mercury Contamination in Red-Crowned Cranes, Grus japonensis, in East Hokkaido, Japan
  • 著者名/発表者名: Teraoka H, Tagami Y, Kudo M, Miura Y, Okamoto E, Matsumoto F, Koga K, Uebayashi A, Shimura R, Inoue M, Momose K, Masatomi H, Kitazawa T, Hiraga T, Subramanian A.
  • 雑誌名: Arch Environ Contam Toxicol 巻: (in press)
• [学会発表] Quantification of pericardial edema using high-speed camera : Involvement of prostanoid signaling in pericardial edema in early larvae of zebrafish exposed to 2, 3, 7, 8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (2012)
  • 著者名/発表者名: Teraoka H, Yamakoshi A, Okuno A, Kitazawa T.
  • 学会等名: 51th Society of Toxicology Annual Meeting
  • 発表場所: Moscone Center(San Francisco, CA, USA)
  • 年月日: 2012-03-14
• [学会発表] 北海道におけるタンチョウの水銀汚染の原因についての検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岡本絵梨佳, 久道萌, 北澤多喜雄, 寺岡宏樹, 水野直治, 古賀公也, 志村良治, 井上雅子, 百瀬邦和, 正富宏之, 中山翔太, 池中良徳, 石塚真由美
  • 学会等名: 日本鳥学会2011年度大会
  • 発表場所: 大阪市立大学杉本キャンパス(大阪市)
  • 年月日: 2011-09-18
• [学会発表] ダイオキシンによるAhR/Arnt経路を介した発達中ゼブラフィッシュ脳血管走行の異常 (2011)
  • 著者名/発表者名: 寺岡宏樹, 小川輝, 久保田彰, 北澤多喜雄, 平賀武夫
  • 学会等名: 第50回日本先天異常学会
  • 発表場所: シェーンバッハサボー(東京都千代田区)
  • 年月日: 2011-07-22
• [学会発表] ダイオキシンによる発達中ゼブラフィッシュの鰓弓動脈循環障害と心臓周囲浮腫との関係 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山越あゆ美, 奥野悠樹, 平賀武夫, 北澤多喜雄, 寺岡宏樹
  • 学会等名: 第38回日本トキシコロジー学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜市)
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] 2, 3, 7, 8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin responsive transcripts in avian embryonic liver, identified by large-scale differential display system with vertebrate-common degenerate oligonucleotide primers (2011)
  • 著者名/発表者名: Teraoka H, Ito S, Ukai N, Kim E-Y, Iwata H, Kitazawa T, Hiraga T and Endoh D.
  • 学会等名: 50th Society of Toxicology Annual Meeting
  • 発表場所: Washington Convention Center(Washington, D. C., USA)
  • 年月日: 2011-03-08
• [学会発表] 脊椎動物共通プライマーを用いた大規模ディファレンシャル・ディスプレイ法によるダイオキシン応答遺伝子の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鵜飼典佳, 遠藤大二, 池田晴喜, 伊藤知子, 伊東志野, 金恩英, 岩田久人, 北澤多喜雄、平賀武夫、寺岡宏樹
  • 学会等名: 第150回日本獣医学会学術集会
  • 発表場所: 帯広畜産大学(北海道帯広市)
  • 年月日: 2010-09-16
• [学会発表] 発達期ゼブラフィッシュにおける早期浮腫評価系を用いたダイオキシンによる浮腫発生機構の検討 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺岡宏樹, 河村幸浩, 大井啓希, 白石順也, 笹野憲吾, 北澤多喜雄, 平賀武夫
  • 学会等名: 第37回日本中毒学会学術年会
  • 発表場所: 沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] エコトキシコゲノミクスへの応用を目的とした半網羅的ディファレンシャル・ディスプレイ法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 伊東志野, 遠藤大二, 池田晴喜, 伊藤知子, 鵜飼典佳, 金恩英, 岩田久人, 北澤多喜雄, 平賀武夫, 寺岡宏樹
  • 学会等名: 第37回日本中毒学会学術年会
  • 発表場所: 沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
  • 年月日: 2010-06-17
• [学会発表] 半網羅的ディファレンシャル・ディスプレイ法システムの構築 (2009)
  • 著者名/発表者名: 寺岡宏樹, 池田晴喜, 伊藤知子1, 鵜飼典佳, 白石順也, 金恩英, 岩田久人, 平賀武夫、遠藤大二
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜市)
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] AHR2-ARNT1 signalling-dependent deformities of vascular structures in prosencephalic artery in the zebrafish embryo exposed to TCDD (2009)
  • 著者名/発表者名: Kubota A, Ogawa A, Stegeman JJ, Hiraga T and Teraoka H.
  • 学会等名: SETAC North America 30th Annual Meeting
  • 発表場所: New Orleans Hilton Riverside(New Orleans, LA, USA)
  • 年月日: 2009-11-20
• [学会発表] Role of CYP1C genes in the reduced mesencephalic vein blood flow caused by 2, 3, 7, 8-tetrachlorodibenzo-pdioxin in the zebrafish embryo (2009)
  • 著者名/発表者名: Kubota A, Harano R, Iwanaga T, Woodin BR, Stegeman JJ, Hiraga T and Teraoka H.
  • 学会等名: 27th New England Membrane Enzyme Group(NUTMEG) Conference
  • 発表場所: Woods Hole Oceanographic Institution(Woods Hole, MA, USA)
  • 年月日: 2009-10-05
• [学会発表] 発達期ゼブラフィッシュにおける早期浮腫評価系を用いたダイオキシンによる浮腫発生機構の検討 (2009)
  • 著者名/発表者名: 河村幸浩, 笹野憲吾, 久保田彰, 平賀武夫, 寺岡宏樹
  • 学会等名: 第15回小型魚類研究会
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館(名古屋市)
  • 年月日: 2009-09-12
• [学会発表] 新規differential display法の開発: 8種の脊椎動物における共通反復倒置配列を用いたdegenerate oligonucleotide-primed PCRモノプライマーの設計 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池田晴喜, 伊藤知子, 鵜飼典佳, 白石順也, 遠藤大二, 平賀武夫, 寺岡宏樹
  • 学会等名: 第15回小型魚類研究会
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館(名古屋市)
  • 年月日: 2009-09-12
• [図書] 魚類のP450酵素系.「P450の分子生物学第2版」 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤田正一, 板倉隆夫, 石塚真由美, 寺岡宏樹
  • 総ページ数: 195-208
  • 出版者: 講談社
• [備考]
  • URL: http://dop.ver2.asia/login