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2011 年度 実績報告書

マイクロRNAの発現・成熟に関わる分子の網羅的探索とその機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 21310123
研究機関東京大学

研究代表者

程 久美子  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (50213327)

キーワードmiRNA / 遺伝子 / noncoding RNA / 発現調節 / プロセシング / RNA結合タンパク質
研究概要

本研究では、マイクロRNA(microRNA)の発現・成熟を制御する機構を明らかにすることを目的としている。miRNAは、タンパク質をコードしないnoncoding RNAの一種で、メッセンジャーRNA (mRNA)の3’タンパク質非翻訳領域(3’UTR)に部分的に対合して、標的mRNAの翻訳を抑制する。これまでは、microRNAがどのような標的mRNAに対合して、その翻訳を抑制するのかという研究に焦点が当てられていたため、microRNAの発現・成熟過程についてはよくわかっていない。しかし、microRNAの発現および成熟過程の解析は、未知の多様な高次生命現象の解明には重要である。本研究では、この点に焦点を絞り、microRNAの発現・成熟に関わる機構について明らかにすることを目的とした。
平成23年度は、RNA結合タンパク質であり、let-7 family microRNAの成熟過程を制御することがわかっているLIN28AおよびLIN28BによるmicroRNAの成熟を制御する機構の網羅的解析を行った。タグ付きのLIN28AおよびLIN28Bをヒト培養細胞で過剰発現させ、タグを利用して免疫沈降を行った。免疫沈降物中に含まれるRNAを抽出して、次世代シーケンサーで解析し、LIN28AおよびLIN28Bが結合することによって、成熟過程におけるプロセシングが抑制されていると考えられるmicroRNAを網羅した。それらについて、個別にノザンブロットを行い、LIN28AおよびLIN28Bのノックダウンで発現量が変動するprecursor-microRNAとmature microRNAを選択し、LIN28による成熟過程制御機構の解析を行っている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究では、microRNAの発現・成熟過程を制御する機構を明らかにすることを目的としている。既知の分子によって成熟過程が制御されるmicroRNAを網羅的に特定することは可能となったが、microRNAの成熟過程を制御する新規RNA結合タンパク質の特定には至っていないため、スクリーニングを継続する予定である。

今後の研究の推進方策

microRNAの発現および成熟に関わるRNA結合タンパク質に焦点を絞り、いくつかの細胞種におけるprimary microRNA, precursor microRNA, およびmature microRNAの網羅的発現解析をRNAシーケンスによって行い、成熟過程がブロックされているmicroRNAを選択する。そのようなmicroRNAを用いて、結合するタンパク質を特定するという方法を併用することによって、効率的にmicroRNAの発現および成熟過程を制御するタンパク質を特定し、その機能を明らかにしていく。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2011 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (9件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] E-cadherin is transcriptionally activated via suppression of ZEB1 transcriptional repressor by small RNA-mediated gene silencing.2011

    • 著者名/発表者名
      Mazda M.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 6 ページ: e28688

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0028688

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhanced specificity of HPV16 E6E7 siRNA by RNA-DNA chimera modification.2011

    • 著者名/発表者名
      Yamato K.
    • 雑誌名

      Cancer Gene Ther.

      巻: 18 ページ: 587-597

    • DOI

      10.1038/cgt.2011.28

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lacdinac (Galnacβ1-4glcnac) Contributes to Self-Renewal of Mouse Embryonic Stem Cells by Regulating LIF/STAT3 Signaling.2011

    • 著者名/発表者名
      Sasaki N.
    • 雑誌名

      Stem Cells

      巻: 29 ページ: 641-650

    • DOI

      10.1002/stem.615

    • 査読あり
  • [学会発表] Identification of small interfering RNA binding domains of the TAR RNA binding protein (TRBP) and their molecular implication in RNA interference2011

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Takahashi
    • 学会等名
      Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      Kyoto International Conference Center(京都)
    • 年月日
      20110614-20110618
  • [学会発表] 核内RNAサイレンシングはヒトTNRC6A/GW182によるArgonauteの核内移行により引き起こされる

    • 著者名/発表者名
      西 賢二
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
  • [学会発表] Comparative analysis of siRNA binding patterns of dsRNA binding proteins, TRBP and PACT

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Takahashi
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
  • [学会発表] miRNAによるサイレンシング効率を決定する要因の同定

    • 著者名/発表者名
      日比生 直樹
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
  • [学会発表] 2本鎖RNA特異的アデノシンデアミネースと相互作用するmiRNAの同定

    • 著者名/発表者名
      石井 倫太郎
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
  • [学会発表] RNAサイレンシング関連分子のヒトshRNAライブラリを用いたスクリーニング

    • 著者名/発表者名
      長沢 達矢
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
  • [学会発表] 外来性miRNAのトランスフェクションによる内在性miRNAサイレンシング効果抑制のマイクロアレイ解析

    • 著者名/発表者名
      清水 英悟
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
  • [学会発表] 高感度アレイを利用した小分子 RNA の作用機序の解明

    • 著者名/発表者名
      程 久美子
    • 学会等名
      2011アジレント ゲノミクスフォーラム
    • 発表場所
      KFCビル(東京)
  • [学会発表] microRNAサイレンシング活性の定量的解析

    • 著者名/発表者名
      日比生 直樹
    • 学会等名
      第11回 東京大学生命科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学・工学部2号館(東京)
  • [備考] 東京大学 程研究室ホームページ

    • URL

      http://ui-tei.rnai.jp/publications.html

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公開日: 2014-07-24  

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