ダイズ共生窒素固定系に関わる遺伝因子解明に向けた根粒菌多様性の比較ゲノム研究

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21310130
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 京都産業大学
• 研究代表者: 金子 貴一 京都産業大学, 総合生命科学部, 准教授 (80370922)
• 研究分担者: 佐藤 修正 公益財団法人かずさDNA研究所, 植物ゲノム研究部, 室長 (70370921)
• 連携研究者: 南澤 究 東北大学, 生命科学研究科, 教授 (70167667)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2012
• キーワード: ゲノム / 植物 / 微生物 / 窒素固定 / 共生

研究概要

ダイズ根粒菌ゲノムと共生形質・共生効率の関連性に関する情報を得ることを目的とし、ダイズ根粒菌4菌株について遺伝子構成の多様性に関する基盤情報と研究リソースを整備した。基盤情報に基づき、ゲノム構造、特に外来性 DNA 挿入因子に着目した比較をおこない、異系統間での挿入因子の塩基配列レベルでの高度な一致と、因子の多様性の存在を示した。

研究成果

• [雑誌論文] The type III Secretion System of Bradyrhizobium japonicum USDA122 mediates symbiotic incompatibility with Rj2 soybean plants (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsukui T, Eda S, Kaneko T, Sato S,Okazaki S, Kakizaki-Chiba K, Itakura M,Mitsui H, Yamashita A, Terasawa K,Minamisawa K
  • 雑誌名: Appl Environ Microbiol 巻: 79 ページ: 1048-1051
  • DOI: doi:10.1128/AEM.03297-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of the soybean symbiont Bradyrhizobium japonicum strain USDA6T (2011)
  • 著者名/発表者名: Kaneko T, Maita H, Hirakawa H, Uchiike N, Minamisawa K, Watanabe A, Sato S
  • 雑誌名: Genes 巻: 2 ページ: 763-787
  • DOI: doi:10.3390/genes2040763
  • 査読あり
• [雑誌論文] Community- and genome-based views of plant-associated bacteria:plant-bacterial interactions in soybean and rice (2010)
  • 著者名/発表者名: keda S, Okubo T, Anda M, Nakashita H,Yasuda M, Sato S, Kaneko T, Tabata S, Eda S, Momiyama A, Terasawa K, Mitsui H,Minamisawa K
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 巻: 51 ページ: 1398-1410
  • DOI: doi:10.1093/pcp/pcq119
  • 査読あり
• [学会発表] ダイズ根粒菌TypeIII分泌系によるRj2ダイズ共生不和合性の誘導 (2012)
  • 著者名/発表者名: 津久井隆裕、江田志磨、金子貴一、佐藤修正、岡崎伸、柿崎(千葉)芳里、板倉学、三井久幸、南澤究
  • 学会等名: 第22回植物微生物研究交流会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 20120925-27
• [学会発表] ダイズ根粒菌Bradyrhizobium elkanii USDA61のゲノム構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮澤幸樹、飛彈英伸、太田公平、佐藤修正、平川英樹、田畑哲之、岡崎伸、佐伯和彦、金子貴一
  • 学会等名: 第22回植物微生物研究交流会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 20120925-27
• [学会発表] Bradyrhizobium japonicum Character Predicted from Genomic Comparison of Two Strains (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaneko T, Uchiike N, Maita H, Hirakawa H, Minamisawa K, Watanabe A, Sato S
  • 学会等名: The XV Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 20120730-0802
• [学会発表] Activation of the host symbiosis signaling by rhizobial type III secretion system (2012)
  • 著者名/発表者名: Okazaki S, Kaneko T, Sato S, Saeki K
  • 学会等名: The XV Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 20120730-0802
• [学会発表] Comparative genome analysis of Mesorhizobium loti strains (2012)
  • 著者名/発表者名: Maita H, Hirakawa H, Nakamura Y, Kaneko T, Tabata S., Saeki K, Sato S
  • 学会等名: The XV Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 20120730-0802
• [学会発表] ダイズ根粒菌Bradyrhizobiumelkaniiのゲノム構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 金子貴一,宮澤幸樹,飛彈英伸,平川英樹,渡辺安希子,田畑哲之,佐藤修正
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 豊島区
  • 年月日: 20120310-12
• [学会発表] ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum strain USDA6のゲノム構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 金子貴一、眞板寛子、内池伸和、南澤究、渡辺安希子、山田学、佐藤修正
  • 学会等名: 植物微生物研究会
  • 発表場所: 岡山市
  • 年月日: 20110920-22
• [学会発表] 宿主遺伝子特異的な共生不和合性をもつダイズ根粒菌のゲノム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 津久井隆裕、金子貴一、佐藤修正、山田学、板倉学、山下明史、三井久幸、江田志磨、南澤究
  • 学会等名: 第5回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 仙台市
  • 年月日: 20110314-16
• [学会発表] ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum strain USDA6のゲノム構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 金子貴一、内池伸和、南澤究、渡辺安希子、山田学、佐藤修正
  • 学会等名: 第5回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 仙台市
  • 年月日: 20110314-16
• [学会発表] ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiにおける共生アイランドの比較解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 眞板寛子、平川英樹、中村保一、金子貴一、佐伯和彦、田畑哲之、佐藤修正
  • 学会等名: 第5回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 仙台市
  • 年月日: 20110314-16
• [学会発表] 根粒菌Mesorhizobium lotiの共生アイランドにおける比較解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 眞板寛子、平川英樹、中村保一、金子貴一、佐伯和彦、田畑哲之、佐藤修正
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] Community shifts of soybean-associated microbes by host nodulation phenotypes and nitrogen applications (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikeda S, Okubo T, Kaneko T, Inaba S,Sasaki K, Anda M, Eda S, Sato S, Tabata S, Sato T, Mitsui H, Minamisawa K
  • 学会等名: 1st Asian Conference on Plant Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation
  • 発表場所: Miyazaki
  • 年月日: 20100920-24
• [学会発表] Comparative sequence analysis of the symbiosis island of Bradyrhizobium japonicum strain USDA6 (2010)
  • 著者名/発表者名: Kaneko T, Minamisawa K, Watanabe A,Kawashima K, Minami C, Katoh M, Nakazaki N, Yamada M, and Sato S
  • 学会等名: 1st Asian Conference on Plant Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation
  • 発表場所: Miyazaki
  • 年月日: 20100920-24
• [学会発表] ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA122株とUSDA110株のゲノム比較 (2010)
  • 著者名/発表者名: 津久井隆裕、金子貴一、佐藤修正、山田学、板倉学、山下明史、三井久幸、江田志磨、南澤究
  • 学会等名: 環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
  • 発表場所: 仙台市
  • 年月日: 20100621-22
• [学会発表] ダイズ根粒菌Bradyrhizobium japonicum USDA122株とUSDA110株のゲノム比較:USDA122株特異的遺伝子の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 津久井隆裕、金子貴一、佐藤修正、山田学、板倉学、三井久幸、江田志磨、南澤究
  • 学会等名: 日本土壌微生物学会2010年度大会
  • 発表場所: 文京区
  • 年月日: 20100521-22
• [備考] ゲノム解析成果の公開:RhizoBase
  • URL: http://genome.microbedb.jp/rhizobase
• [備考] ゲノムクローン配布:LegumeBase
  • URL: http://www.legumebase.brc.miyazaki-u.ac.jp