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2011 年度 実績報告書

ニトリルヒドラターゼファミリー酵素の触媒中心形成と触媒機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21350089
研究機関東京農工大学

研究代表者

尾高 雅文  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 准教授 (20224248)

キーワード酵素反応 / 構造生物学 / 中性子 / 生物・生体工学 / バイオリアクター / X線結晶構造解析 / 翻訳後修飾 / タンパク質成熟化
研究概要

ニトリルヒドラターゼ(NHase)はアクリルアミドの工業生産に利用される重要な酵素であるが、その触媒反応機構は未解明である。本研究では、NHaseと類縁酵素であるチオシアネート加水分解酵素(SCNase)を材料に、その触媒反応機構と翻訳後修飾を含む金属触媒中心形成機構を明らかにすることを研究目的とする。今年度は以下の研究を行った。(1)NHaseとSCNaseの触媒活性の差異を基質ポケットの変異体を用いて解析した。SCNase基質ポケット内部に突出している二つのアルギニン残基をNHaseの相当する部位に存在する疎水性アミノ酸に置換した変異体はSCNase活性を消失し、NHase活性を示す。NHase活性の反応動力学的パラメータを求めたところ、Km値は野生型のSCNase活性に比べて数倍にとどまるが、kcatも野生型酵素のSCNase活性の数倍まで増大することがわかった。そこで、それらの残基をリジン、アスパラギン、ヒスチジンに置換した変異体を作製したところ、いずれの変異体もSCNase活性、NHase活性ともに著しく低い値を示した。これらの結果から、両酵素は基本的に共通の触媒機構を有し、基質ポケットの電荷と大きさによって基質特異性が制御されることが示唆された。(2)SCNase活性化タンパク質であるP15Kによる成熟化機能の解析を行った。これまでの研究で未解明であった金属結合サブユニットであるγとP15Kの複合体へのコバルトイオンの取込と、それに続くγ-P15K複合体の解離過程を解析した。その結果、γ-P15K複合体が1モルあたり1モルのコバルトイオンを結合すること、コバルトを結合したγ-P15K複合体に新生γサブユニットを作用させると、複合体の解離がおこることを明らかにした。これにより、P15KによるSCNase成熟化機構の概要を明らかにすることができた。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2011

すべて 学会発表 (16件)

  • [学会発表] Bacillus pallidus RAPc8由来コバルト型ニトリルヒドラターゼの大量発現系構築とキャラクタリゼーション2011

    • 著者名/発表者名
      相原敬之、佐藤雅、山中保明、清水敏史、大滝証、野口恵一、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市、パシフィコ横浜
    • 年月日
      2011-12-13
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素活性中心近傍アルギニン残基が基質特異性与える影響2011

    • 著者名/発表者名
      渡邉俊則、山中保明、荒川孝俊、浪間聡志、中山洋、片山葉子、堂前直、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市、パシフィコ横浜
    • 年月日
      2011-12-13
  • [学会発表] Bacillus pallidus RAPc8由来コバルト型ニトリルヒドラターゼ大量発現系構築とキャラクタリゼーション2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤雅、山中保明、清水敏史、大滝証、野口恵一、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      酵素工学研究会第66回講演会
    • 発表場所
      文京区本郷・東京大学山上会館
    • 年月日
      2011-09-29
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素の成熟化機構の解明2011

    • 著者名/発表者名
      中西拓也、堀祥太、荒川孝俊、浪間聡志、中山洋、片山葉子、堂前直、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      酵素工学研究会第66回講演会
    • 発表場所
      文京区本郷・東京大学山上会館
    • 年月日
      2011-09-29
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素の成熟化過程の解明2011

    • 著者名/発表者名
      中西拓也、堀祥太、荒川孝俊、中山洋、片山葉子、堂前直、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第63回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      小金井市・東京農工大学
    • 年月日
      2011-09-27
  • [学会発表] Bacillus pallidus RAPc8由来コバルト型ニトリルヒドラターゼの大量発現系構築とキャラクタリゼーション2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤雅、山中保明、清水敏史、大滝証、野口恵一、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第63回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      小金井市・東京農工大学
    • 年月日
      2011-09-27
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素の基質特異性に対する活性中心近傍アルギニン残基の影響2011

    • 著者名/発表者名
      渡邉俊則、荒川孝俊、山中保明、浪間聡志、中山洋、片山葉子、堂前直、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第63回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      小金井市・東京農工大学
    • 年月日
      2011-09-27
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素の成熟化過程の解明2011

    • 著者名/発表者名
      中西拓也、堀祥太、荒川孝俊、浪間聡志、中山洋、片山葉子、堂前直、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      筑波市・つくば国際会議場「エポカルつくば」
    • 年月日
      2011-09-12
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素成熟化における活性化タンパク質の役割~触媒サブユニットとの相互作用解析~2011

    • 著者名/発表者名
      渡邉俊則、中西拓也、堀祥太、荒川孝俊、浪間聡志、中山洋、片山葉子、堂前 直、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      筑波市・つくば国際会議場「エポカルつくば」
    • 年月日
      2011-09-12
  • [学会発表] Bacillus pallidus RAPc8由来コバルト型ニトリルヒデドラターゼの大量発現系構築とキャラクタリゼーション2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤雅、山中保明、清水敏史、大滝証、野口恵一、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      筑波市・つくば国際会議場「エポカルつくば」
    • 年月日
      2011-09-12
  • [学会発表] Effect of arginine residues around the substrate binding pocket on the ubstrate specificity of thiocyanate hydrolase2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Yamanaka, T.Arakawa, S.Namima, S.Hori, A.Ohtaki, K.Noguchi, Y.Katayama, M.Yohda, M.Odaka
    • 学会等名
      ICBIC15
    • 発表場所
      Vancouver, CANADA
    • 年月日
      2011-08-10
  • [学会発表] Catalytic Mechanism of Nitrile Hydratase Proposed by Time-Resolved X-Ray Crystallography2011

    • 著者名/発表者名
      Yohda M., Hashimoto K., and Odaka M.
    • 学会等名
      The 12th International Conference on QiR(Quality in Resarch)
    • 発表場所
      Bali, Indonesia
    • 年月日
      2011-07-05
  • [学会発表] ニトリルヒドラターゼファミリー酵素の基質特異性の解析2011

    • 著者名/発表者名
      山中保明、荒川孝俊、浪間聡志、堀祥太、野口恵一、大滝証、片山葉子、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第38回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      筑波市・筑波大学大学会館国際会議室
    • 年月日
      2011-06-23
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素基質特異性に対する基質ポケット近傍アルギニン残基の影響2011

    • 著者名/発表者名
      山中保明、荒川孝俊、浪間聡志、堀祥太、大滝証、野口恵一、片山葉子、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第11回蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪市・ホテル阪急エキスポパーク
    • 年月日
      2011-06-07
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素の成熟化過程の解明2011

    • 著者名/発表者名
      中西拓也、堀祥太、荒川孝俊、浪間聡志、中山洋、片山葉子、堂前直、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第11回蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪市・ホテル阪急エキスポパーク
    • 年月日
      2011-06-07
  • [学会発表] チオシアネート加水分解酵素成熟化における活性化タンパク質の役割~触媒サブユニットとの相互作用解析~2011

    • 著者名/発表者名
      渡邉俊則、中西拓也、堀祥太、荒川孝俊、浪間聡志、中山洋、片山葉子、堂前直、養王田正文、尾高雅文
    • 学会等名
      第11回蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪市・ホテル阪急エキスポパーク
    • 年月日
      2011-06-07

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公開日: 2013-06-26  

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