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2009 年度 実績報告書

超好熱菌における全regulonの確定と機能解明

研究課題

研究課題/領域番号 21350092
研究機関京都大学

研究代表者

跡見 晴幸  京都大学, 工学研究科, 教授 (90243047)

キーワード転写制御因子 / 遺伝子破壊 / regulon / 超好熱菌 / 始原菌 / Thermococcus kodakaraensis / 機能未知遺伝子 / ゲノム
研究概要

今年度の研究成果は以下の通りである。
まずTK2291遺伝子を破壊し、そのregulonを確定した。本regulonにはprefoldin, AAA ATPase, small heat shock proteinなど熱ショック応答に関与する遺伝子が多数含まれていた。破壊株と宿主株の転写量比の上位8遺伝子に対して破壊株を作製し、それらの熱ショックに対する感受性を検討した。その結果、6種の破壊株(TK1121, TK1590, TK1157, TK1097, TKO750, TK1591)が熱ショック条件下で宿主株と比較して顕著な増殖遅延を示し、これらの遺伝子が熱ショック応答に寄与することが示された。これらの生化学的機能解析を進めたところ、TK1590はsingle strand DNAと相互作用を示すATPaseであることが分かった。またTK1591は転写制御因子をコードし、それが制御するregulonも確定した。DtxR homologであるTK0107を破壊したところ、鉄トランスポーターであるFeoAB system (TK0714-TK0716)および重金属カチオントランスポーターをコードすると推定されているTK0652の転写量が宿主株と比較して大幅に上昇したことからTK0107は金属の輸送を制御する転写因子であることが示唆された。さらにLrp/AsnC familyのTK0168, MarR familyのTK0169を破壊し、そのtranscriptome解析を進めている。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文]2010

    • 著者名/発表者名
      跡見晴幸, 小宮山眞 監修
    • 雑誌名

      酵素利用技術大系―基礎・解析から改変・高機能化・産業利用まで―(株式会社エヌ・ティー・エス)

      ページ: 510-517

  • [雑誌論文] Identification of the Phr-dependent heat shock regulon in the hyperther mophilic archaeon, Thermococcus kodakaraensis2009

    • 著者名/発表者名
      Kanai T, Takedomi S, Fujiwara S, Atomi H, Imanaka T
    • 雑誌名

      J.Biochem. 147(3)

      ページ: 361-370

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Fur iron regulator-like protein is cryptic in the hyperthermophilic archaeaon Thermococcus kodakaraensis2009

    • 著者名/発表者名
      Louvel H, Kanai T, Atomi H, Reeve JN
    • 雑誌名

      FEMS Microbiol.Lett. 295

      ページ: 117-128

    • 査読あり
  • [学会発表] 超好熱始原菌の環境応答機構 (転写制御、熱ショック蛋白質)2009

    • 著者名/発表者名
      跡見晴幸
    • 学会等名
      GCOE第4回国際シンポジウム
    • 発表場所
      奈良先端科学技術大学院大学
    • 年月日
      2009-11-13
  • [学会発表] Novel enzymes of the archaea involved in coenzyme biosynthesis2009

    • 著者名/発表者名
      跡見晴幸
    • 学会等名
      Gordon Research Conference 2009
    • 発表場所
      New Hampshire, U. S. A.
    • 年月日
      2009-07-29

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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