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2011 年度 研究成果報告書

光環境を受容するフィトクロム遺伝子群のゲノム進化がもたらす多様性形成機構の解析

研究課題

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研究課題/領域番号 21370036
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関京都大学

研究代表者

瀬戸口 浩彰  京都大学, 大学院・人間・環境学研究科, 准教授 (70206647)

研究分担者 長谷 あきら  京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (40183082)
藤井 紀行  熊本大学, 大学院・自然科学研究科, 准教授 (40305412)
池田 啓  東京大学, 国立科学博物館, 研究員 (70580405)
研究期間 (年度) 2009 – 2011
キーワード進化 / 適応 / フィトクロム / 光環境
研究概要

(1)アブラナ科ミヤマタネツケバナにおけるPHYE遺伝子の南北間分化を比較した。PHYE遺伝子を単離して、クローニングを進め、高機能高変異性を示すN末端側をクローニングすることができた。この構築されたプラスミドは、大腸菌に形質転換することでタンパク質を合成する機能を持つ。
(2)緯度に応じて開花応答性が大きく異なるマメ科ミヤコグサで、光受容遺伝子群の分化を検証した。PHYA, PHYB, PHYEにおいて多数の非同義的置換が産地間にあり、そのアミノ酸置換の多くはGAFドメインなどの機能中枢に偏在していた。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2012 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (8件) 学会発表 (7件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Evolution of an alpine endemic plant at the arctic-alpine range periphery following Pleistocene climatic oscillations2012

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Carlsen, T., Fujii, N., Brochmann, C, Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 194 ページ: 583-594

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1469-8137.2012.04061.x

  • [雑誌論文] Polymorphismof DNA sequences of crypto chrome genes is not associated with the photoperiodic flowering of wild soybean along a latitudinal cline2012

    • 著者名/発表者名
      Ishibashi, N., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

    • DOI

      DOI:10.1007/s10265-011-0470-6

  • [雑誌論文] Molecular evolution of crypto chrome genes and the evolutionary manner of photoreceptor genes in Card amine nipponica2011

    • 著者名/発表者名
      Ikeda H., Fujii N., Setoguchi H
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 124 ページ: 85-92

    • DOI

      DOI:10.1007/s10265-010-0361-2

  • [雑誌論文] Molecular evolution of crypto chrome genes and the evolutionary manner of photoreceptor genes in Cardamine nipponica2011

    • 著者名/発表者名
      Ikeda H., Fujii N., Setoguchi H.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 124 ページ: 85-92

    • DOI

      DOI:10.1007/s10265-010-0361-2

  • [雑誌論文] Natural selection on PHYE by latitude in the Japanese archipelago : insight from locus specificphylogeographic structure in Arcterica nana2010

    • 著者名/発表者名
      Ikeda H., Setoguchi H
    • 雑誌名

      Molecular Ecology

      巻: 19 ページ: 2779-2791

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-294X.2010.04700.x

  • [雑誌論文] Molecular phylogeny and habitat diversification of the genus Farfugium(Asteraceae) based on nuclear rDNA and plastid DNA2010

    • 著者名/発表者名
      Nomura, N., Takaso, T., et al
    • 雑誌名

      Annals of Botany

      巻: 106 ページ: 467-482

    • DOI

      DOI:10.1093/aob/mcq139

  • [雑誌論文] Application of the isolation with migration model demonstrated the intraspecific vicariancehistory within Japanese endemic alpine plant2009

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Fujii, N., Setoguchi, H
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 26 ページ: 2207-2216

    • DOI

      DOI:10.1093/molbev/msp128

  • [雑誌論文] Molelular evolution of phytochromes in Cardamine nipponica(Brassicaceae) suggests the involvement of PHYE in local adaptation2009

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Fujii, N., Setoguchi, H
    • 雑誌名

      Genetics

      巻: 182 ページ: 615-622

    • DOI

      DOI:10.1534/genetics.109.102152

  • [学会発表] ミヤコグサの開花時期変異とこれを制御する遺伝子群の多型:種内の進化をもたらす機構2012

    • 著者名/発表者名
      呉ハナ・川口正代司・原田久也・瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物分類学会第11回大会
    • 発表場所
      大阪学院大学
    • 年月日
      20120322-25
  • [学会発表] 日本におけるダイズ野生種ツルマメのクリプトクロム遺伝子の分子進化2011

    • 著者名/発表者名
      石橋宣史・瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第75回大会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      20110917-19
  • [学会発表] 日本産ミヤコグサにおける開花特性と光受容体遺伝子群の多型.2011

    • 著者名/発表者名
      呉ハナ, 立石庸一, 長谷あきら, 瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第75回大会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      20110917-19
  • [学会発表] コメバツガザクラ(ツツジ科)の系統地理とPHYE遺伝子における自然選択2011

    • 著者名/発表者名
      池田啓, 瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物分類学会第9回大会
    • 発表場所
      愛知教育大学
    • 年月日
      20110326-29
  • [学会発表] 進化を続ける植物たち:環境適応と植物の種内分化2011

    • 著者名/発表者名
      瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      首都大学東京バイオコンフェレンス
    • 発表場所
      首都大学東京国際交流会館大ホール
    • 年月日
      2011-11-11
  • [学会発表] ミヤマタネツケバナ(Card amine nipponica)における青色光受容体CRY遺伝子の系統地理2009

    • 著者名/発表者名
      池田啓, 藤井紀行, 瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第73回大会
    • 発表場所
      山形大学
    • 年月日
      20090917-20
  • [学会発表] Molecular evolution of phytochromes in Cardaminenipponica(Brassicaceae) suggests the involvement of PHYE in local adaptation2009

    • 著者名/発表者名
      池田啓, 藤井紀行, 瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      12th Congress European Society for Evolutionary Biology
    • 発表場所
      Turin, Italy
    • 年月日
      20090824-29
  • [図書] 高山植物学.高山環境と植物の総合科学-2009

    • 著者名/発表者名
      藤井紀行, 池田啓, 瀬戸口浩彰
    • 総ページ数
      445
    • 出版者
      共立出版
  • [備考]

    • URL

      http://web.mac.com/setoguchi_labo/iWeb/Site/Welcome.html

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公開日: 2013-07-31  

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