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2009 年度 実績報告書

解釈指向マイニングによる診療情報からの医学的知見の発見

研究課題

研究課題/領域番号 21500135
研究機関北陸先端科学技術大学院大学

研究代表者

河崎 さおり  北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 助教 (40377437)

研究分担者 TU Bao HO  北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 教授 (60301199)
キーワード医療データ / データマイニング / 専門知識 / 解釈モデル / 後処理
研究概要

21年度は、データマイニング結果に関する医学的解釈モデルのプロトタイプ構築を中心課題と設定し、主に(1)診療データからのマイニング結果への専門医の評価に基づき、評価過程での議論や専門医の指摘事項をもとに結果の解釈に必要な要素等として収集・整理を実施したほか、(2)医学的背景知識の収集の一環として、医学文献、特にMedlineからのテキストマイニングを行った。(1)に関しては、千葉大学病院とJAIST、また合同の国際学会発表の機会に、研究分担者および連携研究者との計5回の会合を実施し、(a)診療データのうち肝炎患者に着目してデータ提供を受けることの確認、(b)マイニング手法と疾病に関する相互説明と課題の設定、(c)診療データに対する前処理・時系列抽象化等のマイニング手法の適用、(d)マイニング結果の専門医の評価会を実施することで、評価過程での議論や専門医の指摘事項を収集し、専門家が結果を解釈するうえで必要な要素の洗い出しを実施した。また、この過程で、肝炎の専門医の観点から医学的新知識を考える場合、診療記録のみに関する規則やパターンの発見とは別に、HCVのRNAの変異などomics情報も考慮したマイニングの可能性について提案があり、議論を進めている。(2)に関しては、診療記録上の主要検査項目に着目し、これらを関心辞書とし、各項目とそれに関する記述を抽出・収集・標準化し、文脈リストを作成した。また、項目間の関係・規則間の関係付けのための将来的な文脈情報を狙い、レランス・ラフ集合モデルに基づく代替表現を利用して強い関係を持つ項目の組合せパターンの獲得を試みた。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Detecting Disease Genes Based on Semi-Supervised Learning and Protein-Protein Interaction Networks (cond. accepted)2010

    • 著者名/発表者名
      Nguyen, T.P., Ho, T.B.
    • 雑誌名

      Artificial Intelligence in Medicine (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterizing nucleosome dynamics from genomic and epigenetic information using rule induction learning2009

    • 著者名/発表者名
      Le, N.T., Ho, T.B., Tran, D.H.
    • 雑誌名

      BMC Genomics 10 (Suppl. 3)

      ページ: S27 (1-10)

    • 査読あり
  • [学会発表] Towards service-oriented knowledge discovery in biomedicine Research2009

    • 著者名/発表者名
      Ho, T.B., Takabayashi, K., Pham T.H., Nguyen, T.P., Kawasaki, S., Tran, D.H.
    • 学会等名
      International Workshop on Third Generation Data Mining, ECMLIPKDD 2009
    • 発表場所
      Bled, Slovenia
    • 年月日
      20090907-20090911
  • [学会発表] Privacy preserving EM-based Clustering2009

    • 著者名/発表者名
      Luong, T.D., Ho, T.B.
    • 学会等名
      IEEE RIVF International Conference on Computing and Communication Technologies
    • 発表場所
      Da Nang, Viet Nam
    • 年月日
      20090713-20090717
  • [図書] Advances in Knowledge Discovery and Data Mining (Eds.), Proceedings of the 13th Pacific-Asia Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, Lecture Notes in Artificial Intelligence LNAI 54762009

    • 著者名/発表者名
      Theramunkong, T., Kijsirikul, B, Cercone, N., Ho, T.B. 編
    • 総ページ数
      1076
    • 出版者
      Springer

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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