CBMを利用したキチンを基盤とする

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21500423
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 医用生体工学・生体材料学
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 中村 聡 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (50227899)
• 研究協力者: 深川 聡子 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 学生
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 再生医工学材料

研究概要

好アルカリ性Bacillus sp. J813株由来キチナーゼは,触媒ドメイン,フィブロネクチンタイプIII様ドメイン(FnIIID)およびキチン結合ドメイン(ChBD)から構成される。Arg-Gly-Asp(RGD)配列は,細胞外マトリックス分子フィブロネクチン中に存在し,細胞表面レセプターのインテグリンを介して細胞と相互作用する。RGDを融合した各種FnIIID/ChBDおよびChBDタンパク質を調製し,その性質を調べた。融合タンパク質はキチン結合能,インテグリン結合能および細胞接着能を示した。

研究成果

• [雑誌論文] Mutational analysis of a CBM family 5 chitin-binding domain of an alkaline chitinase from Bacillus sp (2012)
  • 著者名/発表者名: F. Uni, S. Lee, R. Yatsunami, T. Fukui, and S. Nakamura
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 巻: 76 ページ: 530-535
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanism of the thermal inactivation of a MBP-fused heparinase I : Biochemical investigations and kinetic modeling (2011)
  • 著者名/発表者名: S. Chen, F. Ye, H. Zhao, Y. Chena, Y. Chen, S. Nakamura, F. Arisaka and X. Xing
  • 雑誌名: Biotechnol. Bioeng 巻: 108 ページ: 1841-1851
  • 査読あり
• [雑誌論文] alcium-dependent xylan-binding domain of alkaline xylanase from alkaliphilic Bacillus sp. strain 41M-1 (2011)
  • 著者名/発表者名: R. Yazawa, J. Takakura, T. Sakata, Ihsanawati, R. Yatsunami, T. Fukui, T. Kumasaka, N. Tanaka and S. Nakamura, A
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 巻: 75 ページ: 379-381
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improvement of alkaliphily of thermostable GH family 10 xylanase from Thermotoga maritima by directed evolution (2010)
  • 著者名/発表者名: W. Tsukimura, K. Watanabe, C. Morokuma, R. Yatsunami, T. Fukui and S. Nakamura
  • 雑誌名: Jpn. Soc. Extr. 巻: 9 ページ: 15-18
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene expression and characterization of a novel GH family 18 chitinase from extremely halophilic archaeon Halobacterium salinarum NRC-1 (2010)
  • 著者名/発表者名: R. Yatsunami, M. Sato, K. Orishimo, Y. Hatori, Y. Zhang, T. Takashina, T. Fukui and S. Nakamura
  • 雑誌名: pn. Soc. Extr. 巻: 9 ページ: 19-24
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of a haloarchaeal GH family 18 chitinase with additional acidic amino acids on its protein surface (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Zhang, R. An, R. Yatsunami, M. Sato, K. Orishimo, Y. Hatori, T. Fukui and S. Nakamura
  • 雑誌名: Jpn. Soc. Extr. 巻: 9 ページ: 72-74
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improvement of alkaliphily of Bacillus alkaline xylanase by introducing amino acid substitutions both on catalytic cleft and protein surface, Biosci (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Umemoto, Ihsanawati, M. Inami, R. Yatsunami, T. Fukui, T. Kumasaka, N. Tanaka and S. Nakamura
  • 雑誌名: Biotechnol. Biochem. 巻: 73 ページ: 965-967
  • 査読あり
• [雑誌論文] Additional carbohydrate-binding modules enhance the insoluble substrate hydrolytic activity of beta-1, 3-glucanase from alkaliphilic Nocardiopsis sp. F96 (2009)
  • 著者名/発表者名: N. Koizumi, S. Masuda, K. Maeda, Y. Isoda, R. Yatsunami, T. Fukui and S. Nakamura
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 巻: 73 ページ: 1078-1082
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of functional domains and improvement of alkaliphily of an alkaline xylanase on the basis of its three-dimensional structure (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Umemoto, R. Yazawa, J. Takakura, R. Yatsunami, T. Fukui and S. Nakamura
  • 雑誌名: J. Appl. Glycosci. 巻: 57 ページ: 145-150
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of exposed aromatic residues in substrate-binding of CBM family 5 chitin-binding module of alkaline chitinase (2009)
  • 著者名/発表者名: F. Uni, S. Lee, R. Yatsunami, T. Fukui and S. Nakamura
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser. 巻: 53 ページ: 311-312
• [学会発表] Mutational analysis of a CBM family 5 chitin-binding domain of alkaline chitinase (2010)
  • 著者名/発表者名: F. Uni, S. Lee, R. Yatsunami, T. Fukui and S. Nakamura
  • 学会等名: TOCAT6
  • 発表場所: Sapporo
  • 年月日: 20100618-23
• [学会発表] ヘミセルロースの有効利用に向けたアルカリキシラナーゼの機能向上 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中村聡
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-30
• [図書] Extremophiles Handbook (2011)
  • 著者名/発表者名: S. Nakamura, K. Nakasone and T. Takashina
  • 総ページ数: 363-381
  • 出版者: Genetics and genomics of triangular disc-shaped halophilic archaeon Haloarcula japonica strain TR-1
• [図書] ソフトマテリアルの応用展開(西敏夫・編),シーエムシー,大阪 (2010)
  • 著者名/発表者名: 三原久和,中村聡,小畠英理
  • 総ページ数: 3-15
  • 出版者: ソフトマテリアルとしてのタンパク質・ペプチド
• [図書] Biotechnology of Lignocellulose Degradation and Biomass Utilization (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Zhang, R. Yatsunami, Y. Hatori, M. Sato, K. Orishimo, T. Fukui and S. Nakamura
  • 総ページ数: 442-447
  • 出版者: Halotolerancy and organic-solvent tolerancy of haloarchaeal chitinase
• [図書] Biotechnology of Lignocellulose Degradation and Biomass Utilization (2009)
  • 著者名/発表者名: W. Tsukimura, K. Watanabe, C. Morokuma, Ihsanawati, R. Yatsunami, T. Fukui, T. Kumasaka, N. Tanaka and S. Nakamura
  • 総ページ数: 423-427
  • 出版者: Improvement of alkaliphily of family 10 xylanase from hyperthermophile Thermotoga maritima
• [図書] Biotechnology of Lignocellulose Degradation and Biomass Utilization (2009)
  • 著者名/発表者名: R. Yazawa, J. Takakura, T. Sakata, H. Miyakubo, Ihsanawati, H. Umemoto, R. Yatsunami, T. Fukui, T. Kumasaka, N. Tanaka, and S. Nakamura
  • 総ページ数: 448-454
  • 出版者: Mutational analysis of CBM family 36 xylan-binding domain of alkaline xylanase
• [備考]
  • URL: http://www.nakamura.bio.titech.ac.jp/