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2009 年度 実績報告書

U1に依存しない新規スプライシング機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21510204
研究機関神戸大学

研究代表者

井上 邦夫  神戸大学, 理学研究科, 准教授 (40252415)

キーワードゲノム発現 / スプライシング / エキソン / イントロン / スプライス部位 / U1 snRNP
研究概要

真核生物遺伝子を分断化するイントロン配列は、RNAスプライシングによって除去される。スプライシング初期過程において、U1 snRNPは5'スプライス部位の認識に不可欠である。これに対し、本研究では、U1 snRNPに依存しない新規スプライシング反応の分子メカニズムを明らかにするとともに、これまで見過ごされてきたU1非依存的にスプライシングされる遺伝子群を探索し、この機構の一般性を検証するとともに、U1非依存的スプライシングの生理的な役割に光を当て、ゲノム情報発現における意義を解明することを目的とする。
ヒトF1γ遺伝子の第9イントロンにはU1 snRNPが結合せず、U1 snRNPに依存しないスプライシングが行われている。これに対し、5'スプライス部位の配列を保存配列に置換すると通常のU1依存型スプライシングとなった。選択的スプライシング制御因子Fox蛋白質は第9イントロンの抑制によって第9エキソンのスキッピング誘導を行う(Fukumura et al., Nucleic Acids Res., 2007)が、第9イントロンをU1依存型に置換した場合にはFox蛋白質による誘導が行われなくなった。また、第9イントロンの5'スプライス部位配列に相補的な配列を持つサプレッサーU1 snRNAを強制発現した場合にも、Fox蛋白質による制御が阻害された。これらのことから、ヒトF1γ遺伝子におけるU1 snRNPに依存しないスプライシングは、Fox蛋白質による選択的スプライシング制御に必須なことが明らかとなった。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2009 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] U1-independent pre-mRNA splicing contributes to the regulation of alternative splicing.2009

    • 著者名/発表者名
      Fukumura, K., et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 37

      ページ: 1907-1914

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role and mechanism of U1-independent pre-mRNA splicing in the regulation of alternative splicing.2009

    • 著者名/発表者名
      Fukumura, K., Inoue, K.
    • 雑誌名

      RNA Biology 6

      ページ: 395-398

    • 査読あり
  • [学会発表] U1-independent splicing and the splicing regulation2009

    • 著者名/発表者名
      Inoue, K.
    • 学会等名
      第32回 日本分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2009-12-09
  • [備考]

    • URL

      http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/

URL: 

公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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