タンパク質高次構造におけるダイナミクスの解析

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21540417
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物物理・化学物理
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 杉山 正明 京都大学, 原子炉実験所, 教授 (10253395)
• 研究分担者: 加藤 晃一 名古屋市立大学, 薬学研究科, 教授 (20211849) ; 森本 幸生 京都大学, 原子炉実験所, 教授 (80200450)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 生物物理

研究概要

重水素化試料及び溶媒コントラスト変調法を用いた中性子小角散乱法により、タンパク質の高次構造のダイナミクスの解析法を確立した。同手法を用いて、20Sプロテアソームを形成するサブユニットの1つ(α7)が単独で作る会合体において、そのサブユニットが交換する現象が存在することを初めて確認し、同時にそのKineticsの解析も行った。

研究成果

• [雑誌論文] Kinetic Asymmetry of Subunit Exchange of Homo-Oligomeric Protein as Revealed by Deuteration-assisted Small-Angle Neutron Scattering (2011)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama, E. Kurimoto, H. Yagi, K. Mori, T. Fukunaga, M. Hirai, G. Zaccai and K. Kato
  • 雑誌名: Biophysical Journal 巻: 110(8) ページ: 2037-2042
  • DOI: DOI:10.1016/j.bpj.2011.09.004
  • 査読あり
• [雑誌論文] SAXS and SANS Observations of Abnormal Aggregation of Humanα-Crystallin (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama, N. Fujii, Y. Morimoto, K. Itoh, K. Mori, T. Fukunaga and N. Fujii
  • 雑誌名: Chemistry & Biodiversity 巻: 7No.6 ページ: 1380-1386
  • DOI: DOI:10.1002/cbdv.200900332
  • 査読あり
• [雑誌論文] SANS investigation of assembly state of proteasome activator 28 and the 20 Sproteasome (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama, E. Kurimoto, H. Sahashi, E. Sakata, Y. Morimoto, K. Itoh, K. Mori, T. Fukunaga, Y. Minami and K. Kato
  • 雑誌名: Journal of Physics 巻: 247 ページ: 012020
  • DOI: DOI:10.1088/142-6596/24/1/012021/1τ42-6596/24τ/1/012021
  • 査読あり
• [雑誌論文] Assembly State of Proteasome Activator 28 in an Aqueous Solution as Studied by Small-Angle Neutron Scattering (2009)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama, E. Kurimoto, Y. Morimoto, H. Sahashi, E. Sakata, K. Hamada, K. Itoh, K. Mori, T. Fukunaga, Y. Minami and K. Kato
  • 雑誌名: Journal of the Physical Society of Japan 巻: 78 ページ: 124802
  • DOI: DOI:10.1143/JPSJ.78.124802
  • 査読あり
• [学会発表] Observation of Nano-Scale Structure of Protein with Deuteration. Assisted Small-Angle Neutron Scattering (2012)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama
  • 学会等名: The 12th International Symposium on Biomimetic Materials Processing
  • 発表場所: 野依ホール名古屋大学
  • 年月日: 2012-01-25
• [学会発表] High Order Structure of Protein and Its Kinetics with Deuteration-Assisted Small-Angle Neutron Scattering (2011)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama
  • 学会等名: The International Conference on Advanced Materials and Nanotechnology
  • 発表場所: Park Village Resort Hotel, Kathmanduネパール
  • 年月日: 2011-10-22
• [学会発表] 野生型PA28におけるSubunit配置と解離 (2010)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 第10回日本中性子科学会年会
  • 発表場所: 東北大学片平さくらホール
  • 年月日: 2010-12-11
• [学会発表] Abnormal Aggregation of alpha-crystallin (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama
  • 学会等名: The 11th IUMRS-International Conference in Asia
  • 発表場所: Quingdao, China
  • 年月日: 2010-09-26
• [学会発表] Observation of Subunit Kinetics in Proteasome aτring with SANS and SAXS (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama
  • 学会等名: The Fourth Taiwan-Japan Joint Meeting on Neutron and X-ray Scattering
  • 発表場所: Yilan, Taiwan
  • 年月日: 2010-03-09
• [学会発表] プロテアソーム複合体におけるサブユニットキネティクスの研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 日本中性子科学会第9回年会
  • 発表場所: いばらき量子ビーム研究センター
  • 年月日: 2009-11-11
• [学会発表] SANS Investigation of Packing Structure of Proteasome Activator 28 with Deuterated Subunit (2009)
  • 著者名/発表者名: M. Sugiyama
  • 学会等名: XIV International Conference on Small-Angle Scattering
  • 発表場所: Oxford, United Kingdom
  • 年月日: 2009-09-16