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2011 年度 実績報告書

レセプター分子との複合体における糖鎖の高精度選択的検出法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21550092
研究機関明星大学

研究代表者

田代 充  明星大学, 理工学部, 准教授 (40315750)

研究分担者 吉村 悦郎  東京大学, 農学生命科学, 教授 (10130303)
キーワード生物学的分析 / レセブター・リガンド複合体 / 選択的検出 / 核磁気共鳴 / 分子間相互作用 / 高感度化・高精度化
研究概要

核磁気共鳴法(NMR)により、リガンドーレセプター複合体の相互作用解析のための新規測定法の開発を行った。
(1)モデルシステムとして使用した複合体
モデルシステムとして、卵白リゾチームーグルコースおよびヒト血清アルブミンートリプトファンを使用した。リゾチームおよびヒト血清アルブミンは、共に市販品であり入手可能である。
モデル化合物として実際に使用したタンパク質関連の試料溶液は以下の3種類である。
(1)50mMグルコース+0.4mMリゾチーム(10mMリン酸緩衝液pH7.5)
(2)2.OmMトリプトファン+0.1mMヒト血清アルブミン
(3)2.OmMトリプトファン+0.1mMヒト血清アルブミン+2.OmMグルコース
(2)NMR測定法
NMR測定法として、STD法およびWater-LOGSY法の2種類が、高親和性のリガンドに対しても適用可能との報告がある。本研究では水シグナル近傍のリガンドシグナル観測の観点より、STD法をベースに高感度化・高精度化を目指した。pre-saturationおよびZ-filterを繰り返して2回用いたシーケンスが水シグナルの消去に大変効果的であった。
(3)リガンドシグナルの選択的検出
リゾチーム+グルコース複合体においてリガンド(グルコース)シグナルの選択的検出を試みたところ、(2)で述べたpre-saturationおよびZ-filterの組み合わせにより、水シグナルの近傍にある全てのグルコースシグナルを検出できた。ヒト血清アルブミン+トリプトファン複合体にも応用したところ、巨大な水シグナルが線幅の細いシグナルとして観測され、水シグナルの近傍にあるグルコースの1位のシグナルも鮮明に観測された。この複合体においては、結合に関与しないグルコースが同一の溶液中に存在しても、リガンドであるトリプトファンの選択的検出が可能であった。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2011 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Characterization of the complex formation of 1,6-anhydro-β-maltose and potassium ions using NMR spectroscopy and single-crystal X-ray crystallography2011

    • 著者名/発表者名
      T.Fujimoto, T.Kato, Y.Usui, O.Kamo, K.Furihata, K.Tsubono, T.Kato, T.Machinami, M.Tashiro
    • 雑誌名

      Carbohydr.Res.

      巻: 346 ページ: 1991-1996

    • DOI

      10.1016/j.carres.2011.06.017

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective J-resolved-HMQC-1 and-2, new methods for measuring proton-proton coupling constants in strongly coupled spin systems2011

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata, M.Tashiro
    • 雑誌名

      Magn.Reson.Chem.

      巻: 49 ページ: 459-463

    • DOI

      DOI:10.1002/mrc.2778

    • 査読あり
  • [雑誌論文] BIRD-J-resolved HMBC and BIRD-high resolution-HMBC pulse sequences for measuring heteronuclear long range coupling constants and proton-proton spin coupling constants in the complicated spin systems2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuo Furihata, M.Tashiro, H.Seto
    • 雑誌名

      Magn.Reson.Chem.

      巻: 49 ページ: 53-58

    • DOI

      DOI:10.1002/mrc.2702

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Demonstration of three dopamine molecules bound to α-synuclein : Implication of oligomerization at the initial stage

    • 著者名/発表者名
      S.Shimotakahara, Y.Shiroyama, T.Fujimoto, M.Akai, T.Onoue, H.Seki, S.Kado, T.Machinami, Y.Shibusawa, K.Ueda, Mitsuru Tashiro
    • 雑誌名

      J.Biophy.Chem.

      巻: (印刷中)

    • 査読あり
  • [学会発表] Complex formation of the sugar 1,6-anhydro-β-maltose with sodium ions as probed by NMR spectroscopy2011

    • 著者名/発表者名
      田代充、吉村悦郎
    • 学会等名
      The 3^<rd> International Symposium on Metallomics
    • 発表場所
      ミュンスター大学、ドイツ
    • 年月日
      20110614-20110619
  • [学会発表] An effective pulse Sequence for detecting a ligand binding with a protein receptor using a WET Sequence and the repeated Z-filters2011

    • 著者名/発表者名
      田代充、下高原櫻子、降旗一夫
    • 学会等名
      52^<th> Experimental NMR Conference
    • 発表場所
      カリフォルニア、USA
    • 年月日
      20110411-20110415

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公開日: 2013-06-26  

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