レセプター分子との複合体における糖鎖の高精度選択的検出法の開発

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21550092
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分析化学
• 研究機関: 明星大学
• 研究代表者: 田代 充 明星大学, 理工学部, 准教授 (40315750)
• 研究分担者: 吉村 悦郎 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (10130303)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 生物学的分析 / 高精度選択的分析

研究概要

核磁気共鳴(NMR)法によるタンパク質-リガンド複合体の分子間相互作用の検出方法の開発を行った。従来は、重水溶媒(100% D_2O)での測定例が多かったが、試料調製の効率化の観点から軽水溶液(95% H_2O+5% D_2O)での試料溶液に対して、容易に測定できる手法の開発を行った。また、汎用性と実践面を考慮し、水シグナル近傍のリガンドシグナルの検出も可能となる、要請度が高いと思われる測定方法の開発に取り組んできた。

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of the complex formation of 1, 6-anhydro-maltose and potassium ions using NMR spectroscopy and single-crystal X-ray crystallography (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Fujimoto, T. Kato, Y. Usui, O. Kamo, K. Furihata, K. Tsubono, T. Kato, T. Machinami and M. Tashiro
  • 雑誌名: Carbohydr. Res 巻: 346 ページ: 1991-1996
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective J-resolved-HMQC-1 and-2, new methods for measuring proton-proton coupling constants in strongly coupled spin systems (2011)
  • 著者名/発表者名: K. Furihata and M. Tashiro
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem 巻: 49 ページ: 459-463
  • 査読あり
• [雑誌論文] BIRD-J-resolved HMBC and BIRD-high resolution-HMBC pulse sequences for measuring heteronuclear long range coupling constants and proton-proton spin coupling constants in the complicated spin systems (2011)
  • 著者名/発表者名: Kazuo Furihata, M. Tashiro and H. Seto
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem 巻: 49 ページ: 53-58
  • 査読あり
• [雑誌論文] The binding of aluminum to mugineic acid and related compounds as studied by potentiometric titration (2011)
  • 著者名/発表者名: E. Yoshimura, H. Kohde, S. Mori, R. C. Hider
  • 雑誌名: Biometals 巻: 24 ページ: 723-727
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synechocystis ferredoxin-NADP(+) oxidoreductase is capable of functioning as ferric reductase and of driving the Fenton reaction in the absence or presence of free flavin (2011)
  • 著者名/発表者名: J. Sato, K. Takeda, R. Nishiyama, T. Watanabe, M. Abo, E. Yoshimura, J. Nakagawa, A. Abe, S. Kawasaki, Y. Niimura
  • 雑誌名: Biometals 巻: 24 ページ: 311-321
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cadmium(II)-stimulated enzyme activation of Arabidopsis thaliana phytochelatin synthase (2011)
  • 著者名/発表者名: S. Ogawa, T. Yoshidomi, E. Yoshimura
  • 雑誌名: J. Inorg. Biochem 巻: 105 ページ: 111-117
  • 査読あり
• [雑誌論文] An effective pulse Sequence for detecting a ligand binding with a protein receptor using a WET Sequence and the repeated Z-filters (2010)
  • 著者名/発表者名: K. Furihata, S. Shimotakahara, Y. Shibusawa and M. Tashiro
  • 雑誌名: Anal. Sci 巻: 26 ページ: 1107-1110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a descrete peroxide dianion, O_2+2-, in a two sodium-(1, 6-anhydro-β-maltose)_2-peroxide complex (2010)
  • 著者名/発表者名: T. Kato, T. Fujimoto, A. Tsutsui, M. Tashiro, Y. Mitsutsuka, and T. Machinami
  • 雑誌名: Chem. Lett 巻: 39 ページ: 136-137
  • 査読あり
• [雑誌論文] High resolution-HMBC(HR-HMBC), a new method for measuring heteronuclear long range coupling constants (2010)
  • 著者名/発表者名: K. Furihata, M. Tashiro and H. Seto
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem 巻: 48 ページ: 179-183
  • 査読あり
• [雑誌論文] Micro total bioassay system for ingested substances : assessment of intestinal absorption, hepatic metabolism, and bioactivity (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Imura, K. Sato, E. Yoshimura
  • 雑誌名: Anal. Chem 巻: 82 ページ: 9983-9988
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aluminum stress increases carbon-centered radicals in soybean roots (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Abo, H. Yonehara, E. Yoshimura
  • 雑誌名: J. Plant Physiol 巻: 167 ページ: 1316-1319
  • 査読あり
• [雑誌論文] Determination of thermodynamic parameters of cadmium(II) association to glutathione using the fluorescent reagent FluoZin-1 (2010)
  • 著者名/発表者名: S. Ogawa, E. Yoshimura
  • 雑誌名: Anal. Biochem 巻: 402 ページ: 200-202
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective J-resolved-HMBC, an efficient method for measuring heteronuclear long range coupling constants (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Furihata, M. Tashiro and H. Seto
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem 巻: 47 ページ: 814-818
  • 査読あり
• [雑誌論文] Application of WET sequence for detection of the ligand signals resonating close to water (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Furihata, S. Shimotakahara, Y. Shibusawa and M. Tashiro
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem 巻: 47 ページ: 971-976
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of the complex formation of 1, 6-anhydro-β-maltotriose with potassium using 1^H and 39^K NMR spectroscopy (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Kato, K. Tsubono, O. Kamo, T. Kato, K. Furihata, T. Fujimoto, T. Machinami and M. Tashiro
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem 巻: 47 ページ: 948-952
  • 査読あり
• [雑誌論文] A microfluidic system to evaluate intestinal absorption (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Imura, Y. Asano, K. Sato, E. Yoshimura
  • 雑誌名: Anal. Sci 巻: 25 ページ: 1403-1407
  • 査読あり
• [雑誌論文] Revision of analytical conditions for determining ligand molecules specific to soft metal ions using dequenching of copper(I)-bathocuproine disulfonate as a detection system (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Ogawa, R. Ichiki, M. Abo, E. Yoshimura
  • 雑誌名: Anal. Chem 巻: 81 ページ: 9199-9200
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of phytochelatin synthase produced by the primitive red alga Cyanidioschyzon merolae (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Osaki, T. Shirabe, H. Nakanishi, T. Wakagi, E. Yoshimura
  • 雑誌名: Metallomics 巻: 1 ページ: 353-358
  • 査読あり
• [雑誌論文] Demonstration of three dopamine molecules bound to α-synuclein : Implication of oligomerization at the initial stage
  • 著者名/発表者名: S. Shimotakahara, Y. Shiroyama, T. Fujimoto, M. Akai, T. Onoue, H. Seki, S. Kado, T. Machinami, Y. Shibusawa, K. Ueda and Mitsuru Tashiro
  • 雑誌名: J. Biophy. Chem 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] Complex formation of the sugar 1, 6-anhydro-maltose with sodium ions as probed by NMR spectroscopy (2011)
  • 著者名/発表者名: 田代充、吉村悦郎
  • 学会等名: 3^<rd> International Symposium on Metallomics
  • 発表場所: Munster, Germany
  • 年月日: 20110614-19
• [学会発表] An effective pulse Sequence for detecting a ligand binding with a protein receptor using a WET Sequence and the repeated Z-filters (2011)
  • 著者名/発表者名: 田代充、下高原櫻子、降旗一夫
  • 学会等名: 52^<th> Experimental NMR Conference
  • 発表場所: CA, USA
  • 年月日: 20110411-15
• [学会発表] Characterization of the complex formation of 1, 6-anhydro sugars with potassium using^<1> H and^<39> K NMR spectroscopy (2010)
  • 著者名/発表者名: 田代充、町並智也、藤本崇、加藤隆之
  • 学会等名: The 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies(PACIFICHEM 2010)
  • 発表場所: Honolulu, USA
  • 年月日: 20101216-20
• [学会発表] Characterization of gold nanoparticles conjugated with 2-mercaptoethanol using NMR pectroscopy (2010)
  • 著者名/発表者名: 田代充、吉村悦郎
  • 学会等名: Challenges in Inorganic and Materials Chemistry(ISACS3)
  • 発表場所: 香港、中国
  • 年月日: 20100720-23