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2011 年度 実績報告書

ピロリジル転移リボ核酸合成酵素を利用した非天然型アミノ酸の蛋白質への導入

研究課題

研究課題/領域番号 21550167
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

柳沢 達男  独立行政法人理化学研究所, システム研究チーム, 研究員 (10450420)

キーワード非天然型アミノ酸 / アミノアシルtRNA合成酵素 / tRNA / タンパク質 / ケミカルバイオロジー / 翻訳 / 翻訳後修飾 / クロスリンカー
研究概要

重原子、反応性官能基、蛍光基、クロスリンカー等、有用な官能基を有する非天然型アミノ酸を部位特異的に導入する方法はタンパク質の構造と機能を知る上で重要な技術となってきている。ピロリジルtRNA合成酵素(PylRS)/tRNA^<Pyl>ペアは大腸菌や哺乳類細胞などの宿主由来のアミノアシルtRNA合成酵素(aaRS)、tRNAと交差反応しない理想的な非天然型アミノ酸導入システムである。柳沢らはPylRS触媒ドメインの結晶構造を解明すると共に、様々なリジン誘導体をタンパク質に導入できる特異なaaRS/tRNAであることを発見し、タンパク質のラベル化や翻訳後修飾に広く利用される系として礎を築いてきた。当研究グループでは細胞内でのタンパク質間相互作用を探索する目的で、以前からクロスリンカー含有非天然型アミノ酸の導入系を開発してきたが、柳沢らは新規のクロスリンカー含有リジン誘導体、N^ε-(trifluoromethyldiazirinylbenzyloxycarbonyl)-L-lysine (TmdZLys)を大腸菌および哺乳類細胞においてタンパク質に部位特異的に導入することに成功した。TmdZLysを導入したGRB2タンパク質は従来のクロスリンカー含有アミノ酸を導入したGRB2と比べ、細胞内ターゲットであるEGFRタンパク質と広い範囲(反応点から6~15Å)でUVクロスリンクが可能であることから、TmdZLysを利用することでタンパク質間相互作用ネットワークを解明することが期待できる。また、当グループで最近開発された翻訳終結因子欠損大腸菌株を利用しN^ε-acetyl-L-lysine (AcLys)などのリジン誘導体をタンパク質中の複数カ所に導入することにも成功している。本課題の成果は今後生命科学研究の重要な基盤技術になると考えられる。

今後の研究の推進方策

(抄録なし)

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件) 図書 (3件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Wade-range protein photo-crosslinking achieved by a genetically encoded N^ε-(benzyloxycarbonyl) lysine derivative with a diazirinyl moiety2012

    • 著者名/発表者名
      T. Yanagisawa, N. Hino, F. Iraha, T. Mukai, K. Sakamoto, S. Yokoyama
    • 雑誌名

      Mol. Bio Syst.

      巻: 8 ページ: 1131-1135

    • DOI

      10.1039/C2MB05321G

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic-code evolution for protein synthesis with non-natural amino acids2011

    • 著者名/発表者名
      T. Mukai, T. Yanagisawa, K. Ohtake, M. Wakamori, J. Adachi, N. Hino, A. Sato, T. Kobayashi, A. Hayashi, M. Shirouzu, T. Umehara, S. Yokoyama, K. Sakamoto
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm.

      巻: 411 ページ: 757-761

    • 査読あり
  • [学会発表] 終止コドンUAGがセンス・コドンに再定義された大腸菌株を用いた非天然型アミノ酸のタンパク質への導入2011

    • 著者名/発表者名
      坂本健作、安達仁朗、若森昌聡、白水美香子、梅原崇史、柳沢達男、向井崇人、横山茂之
    • 学会等名
      第6回無細胞生命科学研究会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市
    • 年月日
      20111116-17
  • [学会発表] 転移RNAを擬態する大腸菌翻訳因子EF-Pのアミノアシル化修飾2011

    • 著者名/発表者名
      柳沢達男、澄田智美、石井亮平、竹本千重、横山茂之
    • 学会等名
      第5回細菌学若手コロッセウム
    • 発表場所
      高知県高知市
    • 年月日
      20110805-07
  • [図書] 化学と生物2011

    • 著者名/発表者名
      柳沢達男、澄田智美、横山茂之
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      転移RNAを擬態する大腸菌翻訳因子EF-Pのアミノアシル化修飾-抗菌薬ターゲットとしての可能性に期待-
  • [図書] Photon Factory Activity Report Research Highlights 20102011

    • 著者名/発表者名
      T. Yanagisawa, T. Sumida, S. Yokoyama
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      The Crystal Structure of Translation Elongation Factor P (EF-P) Complexed with An Aminoacyl-tRNA Synthetase Paralog, GenX, Reveals that EF-P Functionally Mimics Transfer RNA
  • [図書] SPring-8 Research Frontiers 20102011

    • 著者名/発表者名
      T. Yanagisawa, T. Sumida, S. Yokoyama
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      Structure and function of a protein mimicking transfer RNA revealed from the structure of translation elongation factor P complexed with an aminoacyl-tRNA synthetase paralog, GenX.
  • [産業財産権] 新規な非天然型アミノ酸、及びその利用(N^ε-(p-trifluoromethyldia zirinylbenzyloxycarbonyl)-lysine)2011

    • 発明者名
      横山茂之、坂本健作、柳沢達男、樋野展正、伊良波史枝
    • 権利者名
      横山茂之、坂本健作、柳沢達男、樋野展正、伊良波史枝
    • 産業財産権種類
      特許権
    • 産業財産権番号
      2011-253307
    • 出願年月日
      2011-11-18

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公開日: 2015-07-13  

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