転写制御におけるクロマチンダイナミズムを規定するシス及びトランス因子の機能解析

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21570185
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 明星大学
• 研究代表者: 清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
• 研究協力者: 胡桃坂 仁志 早稲田大学, 理工学術院, 教授 (80300870) ; MITCHELL Aaron P. 米国カーネーギーメロン大学, 教授
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 遺伝子 / 発現制御 / ゲノム / クロマチン / ヌクレオソーム

研究概要

遺伝子発現におけるクロマチン機能に関する重要な問題の一つは、ヌクレオソームの配置決定とそのダイナミクスの機構である。本研究では、転写制御に着目し、出芽酵母ゲノム及びミニ染色体において、ヌクレオソームの配置を規定するシス因子としていくつかのDNAリピート配列を同定した。また、トランス因子としてクロマチンリモデリングIsw2複合体、ヒストン脱アセチル化酵素Rpd3、ピストンH3バリアントの機能を解析した。

研究成果

• [雑誌論文] Highly Efficient Chromatin Transcription Induced by Superhelically Curved DNA Segmens : The Underlying Mechanism Revealed by a Yeast System (2010)
  • 著者名/発表者名: Jun-ichi Tanase, Nobuyuki Morohashi, Masashi Fujita, Jun-ichi Nishikawa, Mitsuhiro Shimizu, Takashi Ohyama
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 49 ページ: 2351-2358
  • 査読あり
• [雑誌論文] 5-Bromodeoxyuridine induces transcription of repressed genes with dismption of nucleosome positioning (2010)
  • 著者名/発表者名: Kensuke Miki, Mitsuhiro Shimizu, Michihiko Fujii, Shinichi Takayama, Mohammad N. Hossain, Dai Ayusawa
  • 雑誌名: FEB3 J 巻: 277 ページ: 4539-4548
  • 査読あり
• [学会発表] The effect of human telomeric repeat sequences and telomere binding protein TRF1 on nucleosome positioning in yeas (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Ichikawa, Nobuyuki Morohashi, Keita Handa, Yoshifumi Nishimura, Hitoshi Kurumizaka, Mitsuhiro Shimizu
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Intrinsically disordered regions essential for activator and repressor functions of Ume6 (2012)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Morohashi, Erika Oshimal, Ayako Oshima, Ayako Makino, Yuichi Ichikawa, Hitoshi Kurumizaka, Sato shi Fukuchi, Yoshifumi Nishimura, Mitsuhiro Shimizu
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Promotion of nucleosome assembly with ATTCT and CTG repeats and its effect on transcription (2012)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Morohashi, Ayako Oshima, Tomohiro Fuse, Tohru Matsuura, Wakana Iwasaki, Hiroaki Tachiwana, Wataru Kagawa, Hitoshi Kurumizaka, Mitsuhiro Shimizu
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Promotion of nucleosome assembly with DNA repeat sequences associated with hereditary neurological diseases (2012)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Morohashi, Tomohiro Fuse, Tohru Matsuura, Wakana Iwasaki, Hiroaki Tachiwana, Watam Kagawa, Hitoshi Kurumizaka, Mitsuhiro Shimizu
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on EPIGENETICS & CHROMATIN
  • 発表場所: Codld Spring Harbor, New York, USA
  • 年月日: 20120911-15
• [学会発表] In vivoにおけるATTCTリピートによるヌクレオソームポジショニングとその転写制御に及ぼす影響 (2012)
  • 著者名/発表者名: 諸橋伸行、黒川和希、渋沢庸一、松浦徹、清水光弘
  • 学会等名: 日本薬学会第132年会
  • 発表場所: 北海道大学、札幌
  • 年月日: 20120328-31
• [学会発表] クロマチン関連転写因子Ume6における天然変性領域の機能解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 清水光弘
  • 学会等名: 新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第2回公開シンポジウム
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター、大阪(依頼講演)
  • 年月日: 20120124-25
• [学会発表] Functional Analysis of intrinsically disordered regions for transcriptional activation by Ume6, an activator/repressor protein of early meiotic genes in S. cerevisiae (2011)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Morohashi, Ayako Oshima, Erika Oshima, Azusa Matsumoto, Satoshi Fukuchi, Yoshifumi Nishimura, Aaron P. Mitchell, Mitsuhiro Shimizu
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 20111213-16
• [学会発表] 出芽酵母Ume6による転写抑制に関与する天然変性領域の機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 大島えりか、諸橋伸行、大島綾子、福地佐斗志、西村善文、Aaron P. Mitchell、清水光弘
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 20111213-16
• [学会発表] Promotion of nucleo some assembly with DNA repeat sequences associated with hereditary neurological diseases (2011)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Morohashi, Kazuki Kurokawa, Tohru Matsuura, Hiro aki Tachiwana, Tatsuya Shiga, Wataru.Kagawa, Hitoshi Kurumizaka, Mitsuhiro Shimizu
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 20111213-16
• [学会発表] The effect of human telomeric Sequences on nucleocome positioning in yeast cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Yuichi lchikawa, Nobuyuki Morohashi, Yoshifumi Nishimura, Hitoshi Kurumizaka, Mitsuhiro Shimizu
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 20111213-16
• [学会発表] DNAリピート配列のクロマチン構造とその転写制御に及ぼす影響 (2011)
  • 著者名/発表者名: 清水光弘
  • 学会等名: 平成23年度国立遺伝学研究所研究会「クロマチンダイナミクスの分子機構
  • 発表場所: 国立遺伝学研究所、三島(依頼講演)
  • 年月日: 20111020-21
• [学会発表] DNAリピート配列が形成するヌクレオソームの構造と機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 諸橋伸行、立和名博昭、志賀達也、香川亘、胡桃坂仁志、清水光弘
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都(招待講演)
  • 年月日: 20110921-24
• [学会発表] 出芽酵母の転写活性化・抑制因子Ume6における天然変性領域の機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 諸橋伸行、大島えりか、藤田仁、大島綾子、Aaron R Mitchell、清水光弘
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都
  • 年月日: 20110921-24
• [学会発表] DNA配列によるヌクレオソーム形成の促進と転写制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 清水光弘、藤田亮、富田伸之、森智、神庭昂平、小林玄太、松浦徹、諸橋伸行
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド、神戸
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] 出芽酵母の転写活性化・抑制因子Ume6における天然変性領域の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 諸橋伸行、大島えりか、藤田仁、大島綾子、Aaron P Mitchell、清水光弘
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド、神戸
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] ヌクレオソーム形成促進配列と転写制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 清水光弘
  • 学会等名: 平成22年度遺伝研研究会細胞核超分子複合体の動態とその機能
  • 発表場所: 国立遺伝学研究所、三島(依頼講演)
  • 年月日: 20101021-22
• [学会発表] 酵母ゲノムでのシスおよびトランス因子の変異によるヌクレオソームの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 清水光弘
  • 学会等名: 第19回酵母合同シンポジウムーイノベーションを推進する酵母研究
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 20100624-25
• [学会発表] クロマチン構造をシスに制御するDNA因子と転写制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 諸橋伸行、渋沢庸一、清水光弘
  • 学会等名: 第54回日本薬学会関東支部会
  • 発表場所: 東京薬科大学、東京
  • 年月日: 2010-10-02
• [学会発表] 出芽酵母におけるDNA構造による遺伝子発現とクロマチン構造の制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤田仁、諸橋伸行、棚瀬潤一、大山隆、清水光弘
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 出芽酵母におけるヒト由来ヒストンH3バリアントの発現と機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 早川新一、諸橋伸行、立和名博昭、胡桃坂仁志、清水光弘
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] クロマチンを介した転写抑制 機構と天然変性タンパク質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 清水光弘
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会シンポジウム
  • 発表場所: 神戸(招待講演)
  • 年月日: 2009-10-21
• [備考]
  • URL: http://www.hino.meisei-u.ac.jp/chem/LBT/Shimizu01.html