新規核タンパク質修飾アルグピリミジン化による神経分化制御

2011 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 21570203
• 研究機関: 大阪市立大学
• 研究代表者: 立花 太郎 大阪市立大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (80311752)
• キーワード: 核構造 / クロマチン

研究概要

これまでの生化学的な解析から、アルグピリミジン化を受けるタンパク質のひとつがクロマチンリモデリング因子SWI/SNF複合体の構成因子であることを明らかにした。分化の際にその修飾が変動することから、まず、株化培養細胞の分化誘導系を用いて、クロマチンリモデリング因子SWI/SNF複合体の分化における役割を解析した。構成因子のひとつをノックダウンさせるとSWI/SNF複合体が正常に形成されず、分化が阻害されることがわかった。
したがって、細胞分化の際にSWI/SNF複合体がどのような遺伝子発現の制御を行うか、またその遺伝子発現制御におけるSWI/SNF複合体アルグピリミジン化の役割を明らかにすることが非常に重要となる。そこで本年度は以下の実験を行った。
・SWI/SNF複合体構成因子抗体および抗アルグピリミジン抗体を用い、クロマチン免疫沈降法(ChIPアッセイ)を行った。さらに次世代シークエンサーによる遺伝子配列解析法と組み合わせたChIP-Seq法を用い、アルグピリミジン修飾を受けたSWI/SNF複合体が結合するゲノム領域を同定した。

研究成果

• [雑誌論文] Enzymatic actions of Pasteurella multocida toxin detected by monoclonal antibody recognizing the deamidated alpha subunit of the heterotrimeric GTPase Gq (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamitani, S., Ao, S., Toshima, H., Tachibana, T., Hashimoto, M., Kitadokoro, K., Fukui-Miyazaki, A., Abe, H., and Horiguchi, Y
  • 雑誌名: FEBS Journal 巻: 278 ページ: 2702-2712
  • 査読あり
• [雑誌論文] The classification of mRNA expression levels by the phosphorylation state of RNAPII CTD based on a combined genome-wide approach (2011)
  • 著者名/発表者名: Odawara, et al
  • 雑誌名: BMC Genomics. 巻: 12 ページ: 516
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cross talk between distinct nuclear import pathways enables efficient nuclear import of E47 in conjunction with its partner transcription factors (2011)
  • 著者名/発表者名: Mehmood, et al
  • 雑誌名: Mol.Biol.Cell 巻: 22 ページ: 3715-3724
  • 査読あり
• [雑誌論文] Steroidogenic Factor 1 (NR5A1) resides in centrosomes and maintains genomic stability by controlling centrosome homeostasis (2011)
  • 著者名/発表者名: Lai, et al
  • 雑誌名: Cell Death Differ. 巻: 18 ページ: 1836-1844
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial prohibitins and septin 9 are implicated in the onset of rat hepatocarcinogenesis (2011)
  • 著者名/発表者名: Kakehashi, et al
  • 雑誌名: Toxicol Sci. 巻: 119 ページ: 61-72
  • 査読あり