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2010 年度 実績報告書

オオムギ野生種におけるS遺伝子座領域のゲノム解析と認識決定因子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 21580006
研究機関三重大学

研究代表者

掛田 克行  三重大学, 大学院・生物資源学研究科, 准教授 (50221867)

キーワード自家不和合性 / イネ科 / S遺伝子 / ゲノム解析
研究概要

オオムギ野生種(Hordeum bulbosum)は独立二遺伝子座(SおよびZ)支配の自家不和合性を有している。本研究では、雌ずい側の有力なS遺伝子候補HPS10(Hordeum Pistil S-specific 10)の単離に引き続き、新たな花粉側S遺伝子候補を探索するため、HPS10遺伝子周辺ゲノム領域の塩基配列解析を行い、ゲノム上でHPS10に隣接し、生殖器官で発現している遺伝子として、植物の機能未知ドメインDUF247を持つ遺伝子を見出した。本年度は、このDUF247遺伝子が花粉側S遺伝子候補になりうるかを検討するため、その転写領域、発現特異性、塩基配列多型性について解析を行った。DUF247遺伝子の転写領域を決定するため、3'RACE解析を行った結果、1つのエキソンからなる転写産物(DUF247a)と、2つのエキソン構造を持つ転写産物(DUF247b)の主に2種類の転写産物が存在することが明らかとなった。また、DUF247bの第2エキソンはHPS10 mRNAの相補鎖に部分的にオーバーラップすることが示された。それぞれの転写産物から翻訳される推定アミノ酸配列をS_1およびS_3ハプロタイプ間で比較すると、DUF247aは79%の相同性を示しC末端領域が保存されていたのに対して、DUF247bでは第2エキソンにコードされるC末端部分に多型領域のあることが示された。また発現パターンに関して、DUF247aが全組織で発現するのに対して、DUF247bは生殖器官特異的(S_1では雌ずい、S_3では葯と雌ずい)発現を示した。さらに、S_1ハプロタイプでは葯で特異的に発現するもう1つの転写産物(DUF247c)が存在することが示された。これらの結果から、生殖器官特異的に発現する転写産物にコードされるDUF247タンパク質は新たなS決定因子の候補になりうるが、花粉側S因子の候補と考えるには、S_1-DUF247cのような葯特異的なスプライシング産物が他のSハプロタイプにも存在するかどうか、今後さらに詳しく調査する必要があると考えられた。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Expression and functional analysis of the barley Nud gene using transgenic rice2011

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda, N. Ishihara, Y. Izumi, K. Sato, S. Taketa
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 61 ページ: 35-42

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deletion mutations of the self-incompatibility (S) locus induced by gamma irradiation in a wild diploid species of sweet potato, Ipomoea trifida2010

    • 著者名/発表者名
      K.Kakeda
    • 雑誌名

      Jpn.Agr.Res.Qtr.(JARQ)

      巻: 44 ページ: 127-131

    • 査読あり
  • [学会発表] イネ科植物の受粉過程における二遺伝子座自家不和合性システム2010

    • 著者名/発表者名
      掛田克行
    • 学会等名
      日本分子生物学会第33回年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] オオムギ属野生種におけるCly1ホモログの解析2010

    • 著者名/発表者名
      掛田克行
    • 学会等名
      日本育種学会第118回講演会
    • 発表場所
      秋田市
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] Molecular and genomic analysis of the S locus region in wild barley, Hordeum bulbosum2010

    • 著者名/発表者名
      K.Kakeda
    • 学会等名
      11th International Congress on Sexual Plant Reproduction
    • 発表場所
      Bristol (U.K.)
    • 年月日
      2010-08-05

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公開日: 2012-07-19  

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