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β-アミノ酸含有ペプチドは、生体内における各種ペプチダーゼによる加水分解に対して抵抗性を示し、医薬品分野においてペプチド模倣化合物あるいは特異的な阻害剤として有用な化合物である。このβ-ペプチドを酵素法により合成することを目的として、Pseudomanas sp.MCI3434株由来のβ-Ala-Xaaジペプチダーゼ(BapA)や、自然界の微生物やゲノム情報内に新規β-ペプチド特異的ペプチダーゼを網羅的に探索した。このうちの1菌株よりβ-ペプチド特異的ペプチダーゼの精製を行い、諸性質を検討するとともに、遺伝子クローニングを行った。さらに、本遺伝子の大腸菌における発現を検討し、組換え酵素の大量調製を行い、得られた酵素を用いてβ-ペプチド合成を検討した。また、各種微生物のゲノムデータベース内にBapA様配列を検索するなどの網羅的な酵素探索により、β-ペプチド特異的ペプチダーゼのライブラリーを作製し、これらを大腸菌内で発現させ、β-ペプチド合成を検討した。
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