研究課題
本研究では、テロメア四重鎖DNAに強く結合する新規オクタカチオン性ポルフィリンの静電相互作用モデルに基づく分子設計と合成、複合体の分子ドッキングシミュレーション(DOCK)と分子動力学シミュレーション(MD)による結合様式と結合自由エネルギー(ΔG)の予測、複合体の融解温度と熱力学的諸量の測定による安定化能、結合能の検証と評価、複合体の単結晶化とそのX線結晶構造による原子レベルでの詳細な解析、テロメラーゼ阻害活性と抗腫瘍細胞増殖活性の検討と評価を目的としている。このように本研究の特色は、四重鎖DNAを標的とすること、その構造の特徴を生かし相互作用させる分子基盤として大環状芳香族化合物のポルフィリンを用いること、さらに分子シミュレーションを駆使した論理的開発を行うというユニークな創薬コンセプトである。今年度は、アルキル鎖長の異なるオクタカチオン性ポルフィリンの分子設計と化学合成を進めた。まずTPyP3を合成後、ジヨードメタン、ジヨードエタン、ジヨードプロパン、ジヨードブタンを反応させた。このうち、ヨードエチル基、ヨードプロピル基、ヨードブチル基をもつTPyP3誘導体が得られた。さらにこれらとピリジンを反応させたところ、ヨードプロピル基ヨードブチル基をもつTPyP3誘導体がオクタカチオン性ピリジニウム付加物を与えた。また構造生物学的解析のため、これらとテロメラ四重鎖DNAの複合体の単結晶化を行ったが結晶が得られず、引き続き単結晶化を進めている。
すべて 2010 その他
すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (9件) 備考 (1件)
YAKUGAKU ZASSHI
巻: 130 ページ: 1289-1293
Molbank
ページ: M704(1-4)
J.Biochem.
巻: 147 ページ: 459-462
http://db.u-shizuoka-ken.ac.jp/show/prof331.html
