ルイス式血液型合成に関与するFUT2とFUT3の多型および相関解析

2010 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 21590750
• 研究機関: 久留米大学
• 研究代表者: 副島 美貴子 久留米大学, 医学部, 助教 (80279140)
• 研究分担者: 神田 芳郎 久留米大学, 医学部, 教授 (90231307)
• キーワード: ルイス式血液型 / 分泌型 / DNA多型 / DNAメチル化

研究概要

本研究対象であるFUT2はその構造から遺伝子組換えの起こりやすい座位であることが報告され、現在までに4種類の組換え体アリルが同定されている。前年度に開発した比較Ct法によるFUT2のコピー数多型(CNVs)検出法を用い、中国人集団に新たな組換え体アリルを見出した。これまでに見出されているFUT2のCNVsはいずれもコピー数減少型であるが、本法は増加型も検出可能であり、今後対象サンプルを増やすことにより異なるタイプのCNVsが同定されることが予想される。遺伝子組換えはDNAの多様性増加の原動力となる機構の一つとして知られ、FUT2の多型研究のみならず、組換え機構についての知見を得られるという点が意義のあるものと考えている。さらに今年度はベトナム人集団のDNA294サンプルについてFUT2の多型解析をおこなった。その結果、新規SNPsとしてC818AとG853Aを見出した。これら2つの多型の頻度を調べる為にHRM解析を実施したところ効率良く多型をスクリーニングすることが出来た。これらはいずれもアミノ酸の置換を伴う多型であり、現在酵素活性に与える影響をモニターするための培養細胞を用いた実験を実施している。
FUT2の遺伝子発現制御におけるDNAメチル化について理解をする目的で遂行している研究では、培養細胞のリアルタイムPCRによる発現解析の結果、遺伝子発現レベルが近位のCpGサイトでのメチル化の程度と相関していることが分った。今後は薬剤によるメチル化のコントロール実験等により制御機構を解明する予定である。

研究成果

• [雑誌論文] Rapid Detection of Haptoglobin Gene Deletion in Alkaline-Denatured Blood by Loop-Mediated Isothermal Amplification Reaction. (2011)
  • 著者名/発表者名: Soejima M, Egashira K, Kawano H, Kawaguchi A, Sagawa K, Koda Y.
  • 雑誌名: J Mol Diagnos. 巻: In press
  • 査読あり
• [雑誌論文] TaqMan-based real-time polymerase chain reaction for detection of FUT2 copy number variations : identification of novel Alu-mediated deletion. (2011)
  • 著者名/発表者名: Soejima M, Koda Y
  • 雑誌名: Transfusion 巻: In press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional and genetic survey of all known single-nucleotide polymorphisms within the human deoxyribonuclease I gene in wide-ranging ethnic groups. (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujihara J, Ueki M, Yasuda T, Iida R, Soejima M, Koda Y, Kimura-Kataoka K, Kato H, Panduro A, Tongu M, Takeshita H.
  • 雑誌名: DNA Cell Biol. 巻: 30(In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] First survey of the three gene polymorphisms (PONI Q192R, eNOS E298D and eNOS C-786T) potentially associated with coronary artery spasm in African populations and comparison with worldwide data. (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujihara J, Yasuda T, Kawai Y, Morikawa N, Arakawa K, Koda Y, Soejima M, Kimura-Kataoka K, Takeshita H
  • 雑誌名: Cell Biochem Funct 巻: 29 ページ: 56-63
  • 査読あり
• [雑誌論文] 輸血副作用原因遺伝子ハプトグロビン欠失アリルの輸血前診断法の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 神田芳郎、副島美貴子、川野洋之、江頭弘一、佐川公矯
  • 雑誌名: 日本輸血細胞治療学会誌 巻: 57 ページ: 34-38
  • 査読あり
• [雑誌論文] FDistribution of 42-bp variable tandem repeat polymorphism of the cold-induced autoinflammatory syndrome l (CIASI) gene in eight human populations. (2011)
  • 著者名/発表者名: Omi T, Koda Y, Soejima M, Munkhtulga L, Iwamoto S.
  • 雑誌名: Leg Med (Tokyo) 巻: 13 ページ: 44-46
  • 査読あり
• [雑誌論文] FGlobal analysis of single nucleotide polymorphisms in the exons of human deoxyribonuclease I-like I and 2 genes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujihara J, Yasuda T, Iida R, Kimura-Kataoka K, Soejima M, Koda Y, Kato H, Panduro A, Yuasa I, Takeshita H.
  • 雑誌名: Electrophoresis 巻: 31 ページ: 3552-3557
  • 査読あり
• [雑誌論文] A biochemical and genetic study on all non-synonymous single nucleotide polymorphisms of the gene encoding human deoxyribonuclease I potentially relevant to autoimmunity. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuda T, Ueki M, Takeshita H, Fujihara J, Kimura-Kataoka K, Iida R, Tsubota E, Soejima M, Koda Y, Kato H, Panduro A.
  • 雑誌名: Int J Biochem CellBiol. 巻: 42 ページ: 1216-1225
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development and validation of a SYBR Green I-based real-time polymerase chain reaction method for detection of haptoglobin gene deletion in clinical materials. (2010)
  • 著者名/発表者名: Soejima M, Tsuchiya Y, Egashira K, Kawano H, Sagawa K, Koda Y
  • 雑誌名: Transfusion 巻: 50 ページ: 1322-1327
  • 査読あり
• [学会発表] Y染色体のハプログループを利用した民族推定法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 室友紀, 今村真二, 渡部有希菜, 中村博明, 藤原純子, 飯田礼子, 安田年博, 木村かおり, 湯浅勲, 副島美貴子, 神田芳郎, 竹下治男
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第19回学術集会
  • 発表場所: 三島市(静岡県)
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] TaqMan法を用いたFUT2 CNV検査法を用いた新規Alu mediated deletlonの同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 副島美貴子, 神田芳郎
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第19回学術集会
  • 発表場所: 三島市(静岡県)
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] 急性出血性膵炎により死亡したと思われる水中死体の-症例 (2010)
  • 著者名/発表者名: 神田芳郎, 副島美貴子, 上村繁雄
  • 学会等名: 第60回日本法医学会学術九州地方集会
  • 発表場所: 北九州(福岡県)
  • 年月日: 2010-10-15
• [学会発表] 輸血副作用原因遺伝子ハプトグロビン欠失アリルの輸血前診断 (2010)
  • 著者名/発表者名: 副島美貴子, 神田芳郎
  • 学会等名: 第94次日本法医学会総会
  • 発表場所: 江戸川区(東京都)
  • 年月日: 2010-06-25
• [学会発表] DNASE IおよびDNase II遺伝子exon内SNP検索:集団調査及び酵素活性に及ぼす変異の影響 (2010)
  • 著者名/発表者名: 木村かおり, 藤原純子, 竹下治男, 飯田礼子, 安田年博, 副島美貴子, 神田芳郎, 加藤秀章
  • 学会等名: 第94次日本法医学会総会
  • 発表場所: 江戸川区(東京都)
  • 年月日: 2010-06-24
• [図書] DNA多型 Vol.18 (2010)
  • 著者名/発表者名: 副島美貴子, 神田芳郎
  • 総ページ数: 305
  • 出版者: 東洋書店
• [備考]
  • URL: http://www.med.kurume-u.ac.jp/med/foren/