ルイス式血液型合成に関与するFUT2とFUT3の多型および相関解析

2011 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 21590750
• 研究機関: 久留米大学
• 研究代表者: 副島 美貴子 久留米大学, 医学部, 講師 (80279140)
• 研究分担者: 神田 芳郎 久留米大学, 医学部, 教授 (90231307)
• キーワード: ルイス式血液型 / 分泌型 / DNA多型 / 遺伝子組換え

研究概要

FUT2は多型に富んでいるが、これらは集団に特徴的な分布を示しているため帰属集団マーカーとしての有用性が示唆されている。
今年度は、前年度の解析によってベトナム人集団に新たに見出した2つの一塩基多型(SNPs)についてハプロタイプ解析、ならびに産物であるα(1,2)フコ-ス転移酵素活性に与える影響について、培養細胞を用いた実験系と、in silicoの推定により解析をおこなった。その結果、いずれの多型も酵素活性に大きな影響を与えることが分かった。この結果は2つの解析法で矛盾が無く、用いたフリーソフトウェアは簡便に利用できる機能推定の有用なツールであると考えられる。
一方、同座位には現在までに5種類の組換え体アリルが同定されており、遺伝子構造と局所的な配列から遺伝子組換えが起こりやすいことが示唆される。初年度に開発した比較C_T法によるFUT2のコピ-数多型(CNVs)検出法の活用により、昨年度新たな組換え体アリルを見出したが、同法ではFUT2の偽遺伝子であるSEC1の一部がFUT2に入れ替わったSEC1-FUT2-SEC1アリルの検出は不可能である。当該年度では、このようなハイブリッド遺伝子の検出を目的とし、SEC1とのduplexPCR法をデザインした。
この方法により、ヨーロッパ人を祖先とする南アフリカ集団の1つのサンプルにハイブリッドアリルのヘテロ接合体を見出した。シークエンス解析の結果、このアリルは以前モンゴル人に見出されたSEC1-FUT2-SEC1とは配列を異にするアリルであることが分った。このアリルの同定により、FUT2座位組換えのホットスポット領域を狭めることができた。本法は信頼性が高く、簡便で多数検体を処理できるので、日本人のようにハイブリッドアリルの頻度が無視できない集団を対象とした関連解析にも有用な方法である。

研究成果

• [雑誌論文] Genetic variation of FUT2 in a Vietnamese population : identification of two novel Se enzyme-inactivating mutations (2012)
  • 著者名/発表者名: Soejima M, Fujimoto R, Agusa T, Iwata H, Fujihara J, Takeshita H, Minh TB, Trang PT, Viet PH, Nakajima T, Yoshimoto J, Tanabe S, Koda Y
  • 雑誌名: Transfusion 巻: (In press)
  • DOI: 10.1111/j.1537-2995.2011.03485.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective quantification of human DNA by real-time PCR of FOXP2 (2012)
  • 著者名/発表者名: Soejima M, Hiroshige K, Yoshimoto J, Koda Y
  • 雑誌名: Forensic Sci Int Genet 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nonsynonymous Single-Nucleotide Polymorphisms of the Human Apoptosis-Related Endonuclease-DNA Fragmentation Factor Beta Polypeptide, Endonuclease G, and Flap Endonuclease-1-Genes Show a Low Degree of Genetic Heteroseneity (2012)
  • 著者名/発表者名: Takeshita H, Fujihara J, Ueki M, Iida R, Koda Y, Soejima M, Yuasa I, Kato H, Nakajima T, Kominato Y, Yasuda T
  • 雑誌名: DNA Cell Biol 巻: 1 ページ: 36-42
  • 査読あり
• [雑誌論文] TaqMan-based real-time polymerase chain reaction for detection of FUT2 copy number variations : identification of novel Alu-mediated deletion (2011)
  • 著者名/発表者名: Soejima M, Koda Y
  • 雑誌名: Transfusion 巻: 51(4) ページ: 762-769
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polymorphic trial in oxidative damage of arsenic exposed Vietnamese (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujihara J, Soejima M, Yasuda T, Koda Y, Kunito T, Iwata H, Tanabe S, Takeshita H
  • 雑誌名: Toxicol Appl Pharmacol 巻: 256 ページ: 174-178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Confirmation that SNPs in the high mobility group-A2 gene (HMGA2) are associated with adult height in the Japanese population ; wide-ranging population survey of height-related SNPs in HMGA2 (2011)
  • 著者名/発表者名: Takeshita H, Fujihara J, Soejima M, Koda Y, Kimura-Kataoka K, Ono R, Yuasa I, Iida R, Ueki M, Nagao M, Yasuda T
  • 雑誌名: Electrophoresis 巻: 32 ページ: 1844-1851
  • DOI: 10.1002/elps.201100128
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid detection of haptoglobin gene deletion in alkaline-denatured blood by loop-mediated isothermal amplification reaction (2011)
  • 著者名/発表者名: Soejima M, Egashira K, Kawano H, Kawaguchi A, Sagawa K, Koda Y
  • 雑誌名: J Mol Diagn 巻: 13 ページ: 334-339
  • 査読あり
• [雑誌論文] First survey of the three gene polymorphisms (PON1 Q192R, eNOS E298D and eNOS C-786T) potentially associated with coronary artery spasm in African populations and comparison with worldwide data (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujihara J, Yasuda T, Kawai Y, Morikawa N, Arakawa K, Koda Y, Soejima M, Kimura-Kataoka K, Takeshita H
  • 雑誌名: Cell Biochem Funct 巻: 29 ページ: 156-163
  • DOI: 10.1002/cbf.1721
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional and gcnctic surycy of all known single-nucleotide polymuphisms within the human deoxyribonuclease I gene in wide-ranging ethnic groups (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujihara J, Ueki M, Yasuda T, Iida R, Soejima M, Koda Y, Kimura-Kataoka K, Kato H, Panduro A, Tongu M, Takeshita H
  • 雑誌名: DNA Cell Biol 巻: 30 ページ: 205-217
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of 42-bp variable tandem repeal polymorphism of the cold-induced autoinflammatory syndrome 1 (CIAS1) gene in eight human populations (2011)
  • 著者名/発表者名: Omi T, Koda Y, Soejima M, Munkhtulga L, Iwamoto S
  • 雑誌名: Leg Med (Tokyo) 巻: 13 ページ: 44-46
  • 査読あり
• [学会発表] FOXP2を用いた人獣鑑別法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 副島美貴子, 廣重憲一, 吉本譲爾, 神田芳郎
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第20回学術集会
  • 発表場所: はまぎんホールヴィアマーレ(神奈川県)
  • 年月日: 2011-12-01
• [学会発表] 心筋に広範な収縮帯壊死を認めた小児虐待の一剖検例 (2011)
  • 著者名/発表者名: 神田芳郎, 副島美貴子
  • 学会等名: 第61回日本法医学会学術九州地方集会
  • 発表場所: 長崎大学医学部良順会館ボードウィンホール(長崎県)
  • 年月日: 2011-10-07
• [学会発表] FOXP2を用いたヒトDNAの選択的定量法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 副島美貴子, 神田芳郎
  • 学会等名: 第61回日本法医学会学術九州地方集会
  • 発表場所: 長崎大学医学部良順会館ボードウィンホール(長崎県)
  • 年月日: 2011-10-07
• [学会発表] Simple method for identification of human DNA by real-time PCR of FOXP2 (2011)
  • 著者名/発表者名: Koda Y, Soejima M, Hiroshige K
  • 学会等名: 8th International Symposium ADVANCES IN LEGAL MEDICINE
  • 発表場所: Johann Wolfgang Goethe-University (Frankfurt, Germany)
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] LAMP法を用いた輸血副作用原因遺伝子ハプトグロビン欠失アリルの検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 副島美貴子, 神田芳郎
  • 学会等名: 第95次日本法医学会総会
  • 発表場所: コラッセ福島(福島県)
  • 年月日: 2011-06-17
• [学会発表] Delta-aminolevulinic acid dehydratase (ALAD) G177C (Asn59Lys)多型の頻度分布における民族差異 (2011)
  • 著者名/発表者名: 藤原純子, 竹下治男, 安田年博, 加藤秀章, 神田芳郎, 副島美貴子
  • 学会等名: 第95次日本法医学会総会
  • 発表場所: コラッセ福島(福島県)
  • 年月日: 2011-06-17
• [学会発表] ヒ素代謝に関与するAS3MT遺伝子多型の民族差異 (2011)
  • 著者名/発表者名: 藤原純子, 竹下治男, 安田年博, 加藤秀章, 神田芳郎, 副島美貴子
  • 学会等名: 第95次日本法医学会総会
  • 発表場所: コラッセ福島(福島県)
  • 年月日: 2011-06-16
• [学会発表] LAMP法を用いた輸血副作用原因遺伝子Hp^<del>の検出法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 神田芳郎, 川野洋之, 江頭弘一, 佐川公矯
  • 学会等名: 第59回日本輸血・細胞治療学会総会
  • 発表場所: (震災により中止)(紙上発表)
  • 年月日: 2011-04-14
• [図書] DNA多型Vol.19 (2011)
  • 著者名/発表者名: 副島美貴子, 神田芳郎
  • 総ページ数: 305
  • 出版者: 東洋書店
• [備考]
  • URL: http://www.med.kurume-u.ac.jp/med/foren/