次世代シーケンサーを利用した三角頭蓋症候群の原因および病態解明

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21591329
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 琉球大学
• 研究代表者: 要 匡 琉球大学, 大学院・医学研究科, 准教授 (40264288)
• 研究分担者: 成富 研二 琉球大学, 大学院・医学研究科, 教授 (20101446) ; 柳 久美子 琉球大学, 大学院・医学研究科, 助教 (90294701)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 遺伝子 / 奇形症候群 / ゲノム / 次世代シーケンサー / マイクロアレイ

研究概要

三角頭蓋を呈する疾患は複数あり、その原因や全体像は明確になってはいない。本研究では、それら症候群の原因・病態解明および変異検出法の構築を目的とし、解析を行った。
結果、アレイCGHにより9q34. 11の部分欠失を、次世代シーケンサーによるホールエクソーム解析により、ASXL1変異(Bohring-Opitz症候群患児)を、ダイレクトシーケンス解析によりCD96変異、ASXL1変異を新たに同定した。両遺伝子については、qPCR-HRM法を用いた変異スクリーニング法を確立した。また、CD96はラミニンと結合することが判明した。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of four novel synonymous substitutions in the X-linked genes neuroligin 3 and neuroligin 4X in Japanese patients with autistic spectrum disorder (2012)
  • 著者名/発表者名: Yanagi K, Kaname T, Wakui K, Hashimoto O, Fukushima Y, Naritomi K.
  • 雑誌名: Autism Res Treat 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Paleolithic Contingent in Modern Japanese : Estimation and Inference using Genome-wide Data (2012)
  • 著者名/発表者名: He Y
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 2 ページ: 355
  • DOI: doi:10.1038/srep00355
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic dating indicates that the Asian-Papuan admixture th rough Eastern Indonesia corresponds to the Austronesian expansion. Proc Natl Acad (2012)
  • 著者名/発表者名: Xu S, Pugach I, Stoneking M, Kayser M, Jin L
  • 雑誌名: Sci USA 巻: 109 ページ: 4574-4579
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations affecting components of the SWI/SNF complex cause Coffin-Siris syndrome (2012)
  • 著者名/発表者名: Tsurusaki Y, Okamoto N, Ohashi H, Kosho T, Imai Y, Hibi-Ko Y, Kaname T, Naritomi K, 他23名
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 44 ページ: 376-378
  • DOI: doi:10.1038/ng.2219.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bacterial delivery of large intact genomic-DNA-containing BACs into mammalian cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Cheung W, Kotzamanis G, Abdulrazzak H, Goussard S, Kaname T, Kotsinas A, Gorgoulis VG, Grillot-Courvalin C, Huxley C.
  • 雑誌名: Bioeng Bugs 巻: 3 ページ: 86-92
  • URL: http://dx.doi.org/10.4161/bbug.18621
  • 査読あり
• [雑誌論文] A commentary on implication of gene copy number variation in health and diseases (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaname T
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57 ページ: 79-80
  • 査読あり
• [雑誌論文] Missense mutations in the DNA-binding/dimerization domain of NFIX cause Sotos-like features (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoneda Y, Naritomi K(15人中14番目), Matsumoto N
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57 ページ: 207-211
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of cl ose relatives in the HUGO Pan-Asian SNP database (2011)
  • 著者名/発表者名: Yang X, Xu S
  • 雑誌名: P LoS One 巻: 6 ページ: e29502
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bamshad MJ, Spectrum of MLL2(ALR) mutations in 110 cases of Kabuki syndrome (2011)
  • 著者名/発表者名: Hannibal MC, Naritomi K, Kaname T(36人中17, 18番目)
  • 雑誌名: Am J Med Genet 巻: 155A ページ: 1511-1516
  • DOI: doi:10.1002/ajmg.a.34074.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Population genetic structure of peninsular Malaysia Malay sub-ethnic groups (2011)
  • 著者名/発表者名: Hatin WI, Nur-Shafawati AR, Zahri MK, Xu S, Jin L, Tan SG, Rizman-Idid M
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6 ページ: e18312
  • 査読あり
• [雑誌論文] MOC1 is essential for ocular and limb development in humans and mice (2011)
  • 著者名/発表者名: Okada I, Kaname T(28人中21番目) Saitsu H
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 巻: 88 ページ: 30-41
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA・遺伝子・染色体 (2010)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 雑誌名: 日本医師会雑誌 巻: 139 ページ: 558-559
• [雑誌論文] Genetic evidence supports linguistic affinity of Mlabri-a hunter-gatherer group in Thailand (2010)
  • 著者名/発表者名: Xu S, Kangwanpong D, Seielstad M, Srikummool M, Kampuansai J, Jin L
  • 雑誌名: BMC Genet 巻: 11 ページ: 18
  • 査読あり
• [雑誌論文] NDS1欠失の認められたSotos症候群16例の臨床的検討 (2010)
  • 著者名/発表者名: 當山真弓、當山潤、遠藤尚宏、竹谷徳雄、高良幸伸、要匡、成富研二
  • 雑誌名: 日本小児科学会雑誌 巻: 114 ページ: 48-52
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolution of a patient with Bohring-Opitz syndrome (2009)
  • 著者名/発表者名: Pierron S, Richelme C, Triolo V, Mas JC, Griffet J, Karmous-Benailly H, Quere M, Kaname T, Lambert JC, Giuliano F
  • 雑誌名: Am J Med Genet 巻: 149A ページ: 1754-1757
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of the complex 7q21. 3 rearrangement in a patient with bilateral split-foot malformation and hearing loss (2009)
  • 著者名/発表者名: Saitsu H, Kurosawa K, Kawara H, Eguchi M, Mizuguchi T, Harada N, Kaname T, Kano H, Miyake N, Toda T, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet 巻: 149A ページ: 1224-1230
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mapping human genetic diversity in Asia (2009)
  • 著者名/発表者名: HUGO Pan-Asian SNP Consortium
  • 雑誌名: Science 巻: 326 ページ: 1541-1455
  • 査読あり
• [雑誌論文] Opitz症候群(Opitz G/BBB症候群) (2009)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 雑誌名: 小児科診療 巻: 72 ページ: 69
• [雑誌論文] Holt-Oram症候群 (2009)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 雑誌名: 小児科診療 巻: 72 ページ: 53
• [雑誌論文] holoprosencephaly sequence (2009)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 雑誌名: 小児科診療 巻: 72 ページ: 52
• [雑誌論文] Molecular karyotyping in 17 patients and mutation screening in 41 patients with Kabuki syndrome (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuniba H, Kaname T, Naritomi K(19人中11, 12番目), Niikawa N
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 54 ページ: 304-309
  • 査読あり
• [学会発表] Exome解析を活用したヒト遺伝性疾患の原因解析の実践(invited) (2012)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 学会等名: ゲノムテクノロジー第164委員会沖縄分科会
  • 発表場所: 那覇
  • 年月日: 2012-01-25
• [学会発表] The practice of whole exome sequencing in two genetic diseases, X-linked recessive and autosomal dominant disorders(invited) (2011)
  • 著者名/発表者名: Kaname T
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20111213-16
• [学会発表] Opitz C様症候群(Bohring-Opitz症候群)におけるASXL1遺伝子変異 (2011)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第56回大会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 20111110-12
• [学会発表] The development of high-throughput gene scanning system for autism spectrum disorders by a PCR coupled high-resolution melting curve analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, et al.
  • 学会等名: 60^<th> the American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: Washington DC, USA.
  • 年月日: 20111102-06
• [学会発表] Detection of a mutation in Lenz microphthalmia family by exome sequencing (2011)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, et al.
  • 学会等名: 61^<st> the American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: Montreal, Canada
  • 年月日: 20111018-21
• [学会発表] 免疫グロブリンスーパーファミリーCD96の細胞外マトリックスタンパク質との反応性の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 20110921-24
• [学会発表] Opitz三角頭蓋症候群原因遺伝子CD96のPCR-HRM法による変異スキャニングシステム (2011)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第51回日本先天異常学会学術集会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20110722-24
• [学会発表] Analysis of interaction between CD96 and extracellular matrix proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, et al
  • 学会等名: 44th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists
  • 発表場所: Okinawa
  • 年月日: 20110518-21
• [学会発表] Lenz小眼球症候群を呈する一家系の原因遺伝子解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第18回出生前診断研究会
  • 発表場所: 佐賀
  • 年月日: 2011-10-01
• [学会発表] 医学研究とバイオインフォマティクス(invited) (2011)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 学会等名: バイオインフォマティクス・フォーラムin沖縄2011
  • 発表場所: 那覇
  • 年月日: 2011-06-26
• [学会発表] 次世代シーケンサが拓く医療・医学の新時代(invited) (2011)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 学会等名: OKINAWAライフサイエンスシンポジウムIII
  • 発表場所: 那覇
  • 年月日: 2011-01-20
• [学会発表] Exome analysis in a patient with Kabuki make-up syndrome by whole exon capture and re-sequencing (2010)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: BMB2010
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] 歌舞伎メーキャップ症候群のエクソーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第55回大会
  • 発表場所: 大宮
  • 年月日: 20101027-30
• [学会発表] PCR-高精度融解曲線分析法による自閉症関連遺伝子群の変異/多型スクリーニングシステムの構築 (2010)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第50回に本先天異常学会学術集会
  • 発表場所: 淡路(兵庫)
  • 年月日: 20100708-10
• [学会発表] Resequencing of the candidate region for 16q-ADCA and detection of an insertion polymorphism by fragment assembly data using massively parallel short-read sequencing (2010)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, et al.
  • 学会等名: ESHG2010(EUROPEAN Human Genetics Conference 2010)
  • 発表場所: Gothenburg, Sweden
  • 年月日: 20100612-15
• [学会発表] 自閉症関連遺伝子NLGN3, NLGN4の高速多型スキャニングシステムの構築と解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第113回日本小児科学会学術集会
  • 発表場所: 盛岡
  • 年月日: 20100423-25
• [学会発表] 微量検体からの迅速・安価な遺伝子変異スキャニングシステムの構築 (2010)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第17回出生前診断研究会
  • 発表場所: 那覇
  • 年月日: 2010-11-20
• [学会発表] Exploring the responsible gene for a familial ALS by next-generation sequencer(invited) (2010)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, et al.
  • 学会等名: 第51回日本神経学会総会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-05-22
• [学会発表] これから目線でゲノムを見に行こう.次世代シーケンサーが我々にもたらしたもの-(invited) (2010)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 学会等名: 市民講座「ゲノム情報がもたらす医療の革新」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-02-28
• [学会発表] PCR-高解像度融解曲線分析法による高速遺伝子変異スクリーニングシステムの構築 (2009)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第112回日本小児科学会学術集会
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 20090417-19
• [学会発表] ヒト遺伝性疾患の原因同定へ向けた全候補領域リシーケンス解析(invited) (2009)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 学会等名: 第4回バイオインフォマティクス研究者と医学研究者の交流会
  • 発表場所: 柏(千葉)
  • 年月日: 2009-11-20
• [学会発表] Resequencing of the whole candidate region for 16q22-linked spinocerebellar ataxia in Japanese individuals using next-generation sequencing (2009)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, et al.
  • 学会等名: 59^<th> the American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: Hawaii, USA.
  • 年月日: 2009-10-22
• [学会発表] 次世代シーケンサによる日本人ゲノム16q-ADCA原因候補領域の構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-09-25
• [学会発表] 次世代シーケンサを用いた原因全候補領域リシーケンス解析へのアプローチ (2009)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第16回日本遺伝子診療学会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2009-07-31
• [学会発表] 次世代シーケンサを用いた染色体16q22領域の日本人ゲノム構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 要匡、他
  • 学会等名: 第49回日本先天異常学会学術集会
  • 発表場所: 鹿児島
  • 年月日: 2009-06-26
• [学会発表] ヒト疾患と遺伝子:臨床診断と責任遺伝子診断(invited) (2009)
  • 著者名/発表者名: 成富研二、要匡
  • 学会等名: 第49回日本先天異常学会学術集会
  • 発表場所: 鹿児島
  • 年月日: 2009-06-25
• [学会発表] A PCR coupled high-resolution melting analysis for reliable gene scanning of the faciogenital dysplasia gene (2009)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, et al.
  • 学会等名: ESHG2009(EUROPEAN Human Genetics Conference 2009)
  • 発表場所: Vienna, Austria
  • 年月日: 2009-05-24
• [図書] Midkine : From embryogenesis to pathogenesis and medication (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaname T, Yanagi K, Maehara H. Osteosarcoma and midkine
  • 出版者: Springer(in press)
• [図書] Encyclopedia of Genetics 2^<nd> edn (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaname T. Female carrier.
  • 出版者: Elsevier(in press)
• [図書] Encyclopedia of Genetics 2^<nd> edn (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaname T. Inversion
  • 出版者: Elsevier(in press)
• [図書] オピッツ症候群「症候群ハンドブック」 (2011)
  • 著者名/発表者名: 成富研二
  • 総ページ数: 674
  • 出版者: 中山書店
• [図書] オピッツC症候群「症候群ハンドブック」 (2011)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 総ページ数: 666
  • 出版者: 中山書店
• [図書] ゆるやかなゲノムのはなし「知の津梁やわらかい南の学徒思想3」 (2010)
  • 著者名/発表者名: 要匡
  • 総ページ数: 340-351
  • 出版者: 沖縄タイムス出版
• [備考] 琉球大学遺伝医学
  • URL: http://web.me.com/knaritomi/Home.html