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2009 年度 実績報告書

E-Life構築を目指したD型タンパク質翻訳系の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21651088
研究機関北海道大学

研究代表者

坂口 和靖  北海道大学, 大学院・理学研究院, 教授 (00315053)

キーワードタンパク質 / リボソーム / 翻訳 / 鏡像体 / スクリーニング
研究概要

生命はL型アミノ酸から構成されるタンパク質とD型デオキシリボースを含むDNAから構成されている。このように、生物学的経路の中心の役割を担うタンパク質とDNAはホモキラリティーが確立しており、その選択性が厳密に制御されている。しかしながら、L型タンパク質とD型タンパク質間、あるいはD型タンパク質同士の相互作用について実験的に解き明かされた報告はほとんどない。これらを解明するためには、L型タンパク質だけではなく、D型のタンパク質を用いた解析が必須であるが、天然のリボソームではD型アミノ酸などの非天然アミノ酸をペプチド鎖に組み込むことが出来ず、タンパク質翻訳により非天然の生体分子を得ることは不可能である。本研究では、D型タンパク質翻訳系の確立を目指し、「D型アミノ酸をペプチド鎖に組み込むことの出来るリボソームの開発」を目的とする。
23S rRNAランダムライブラリーを作成するため、大腸菌から23S rRNAのDNA配列を含むrrnBオペロンをクローニングした。PTCランダム変異ライブラリーを作成するため、リボソームのPTC周辺の立体構造を詳細に解析し、ランダム変異を導入する部位として2444-2449位と2498-2503位の二箇所を選択した。これらの部位をランダムプライマー法により変異させたライブラリーから、1)Dアミノ酸による増殖阻害、2)抗生物質に対する感受性を利用した二種のスクリーニング方法により、目的のD型アミノ酸をペプチド鎖に組み込むことの出来る改良型リボソームを得ることができると期待される。

  • 研究成果

    (29件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (20件)

  • [雑誌論文] Drastic Effects on Fibril Formation of Amyloid-beta Peptides by the Addition of Amino Acid Residue Units to the Termini.2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Asanomi
    • 雑誌名

      Protein Pept Lett. (in press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fluoroalkene modification of mercaptoacetamide-based histone deacetylase inhibitors.2010

    • 著者名/発表者名
      S.Osada
    • 雑誌名

      Bioorg Med Chem. 15

      ページ: 605-11

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inhibition of p53 by Introducing Tetramerization Domain Peptide Fused with Polyvalent Cationic Sequence into cells.2010

    • 著者名/発表者名
      R.Kamada
    • 雑誌名

      Peptide Science 2009

      ページ: 319-320

  • [雑誌論文] Characterization of Two Novel and Potent Inhibitors Specific for p53-Inducible Protein Phosphatase PPM1D.2010

    • 著者名/発表者名
      H.Yagi
    • 雑誌名

      Peptide Science 2009

      ページ: 455-456

  • [雑誌論文] Metal Ion, Phosphoamino, and Sequence Preference of Human PPM1 Family Phosphatases.2010

    • 著者名/発表者名
      R.Iwamuro
    • 雑誌名

      Peptide Science 2009

      ページ: 441-442

  • [雑誌論文] Biomineralization Activity of Multivalent minTBP-1 Peptide Mediated by p53 Tetramerization Domain.2010

    • 著者名/発表者名
      T.Sakaguchi
    • 雑誌名

      Peptide Science 2009

      ページ: 411-412

  • [雑誌論文] Development of Probed-SCAP Directed at Thiol Groups.2010

    • 著者名/発表者名
      K.Watanabe
    • 雑誌名

      Peptide Science 2009

      ページ: 407-408

  • [雑誌論文] Characterization of a new cancer-associated mutant of p53 with a missense mutation(K351N)in the tetramerization domain.2009

    • 著者名/発表者名
      M.Muscolini
    • 雑誌名

      Cell Cycle 8

      ページ: 3396-405

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of tumor-associated mutations in the p53 tetramerization domain on oligomerization state and transcriptional activity.2009

    • 著者名/発表者名
      R.Kamada
    • 雑誌名

      Adv Exp Med Biol. 611

      ページ: 567-8

    • 査読あり
  • [学会発表] p53誘導性ホスファターゼPPM1Dの新規特異的阻害剤2010

    • 著者名/発表者名
      T.Nashimoto
    • 学会等名
      日本薬学会第130年会
    • 発表場所
      岡山県桃太郎アリーナ
    • 年月日
      20100328-20100330
  • [学会発表] SCAP法によるアミロイド活性機能化ナノワイヤーの効果的形成2010

    • 著者名/発表者名
      H.Sakai
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学本部キャンパス
    • 年月日
      20100326-20100329
  • [学会発表] p53四量体形成ドメインを介した空間配向制御によるバイオミネラリゼーションの活性増強と構造制御2010

    • 著者名/発表者名
      T.Sakaguchi
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学本部キャンパス
    • 年月日
      20100326-20100329
  • [学会発表] p53誘導性ホスファターゼPPM1Dの細胞周期における新規制御機構の解明2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Chuman
    • 学会等名
      北大グローバルCOEプログラム若手研究者成果発表会
    • 発表場所
      北大工学部
    • 年月日
      2010-02-24
  • [学会発表] PPM1タイプホスファターゼPPM1Dに対する新規阻害剤2010

    • 著者名/発表者名
      H.Yagi
    • 学会等名
      北大グローバルCOEプログラム若手研究者成果発表会
    • 発表場所
      北大工学部
    • 年月日
      2010-02-24
  • [学会発表] 生体内タンパク質発現レベルでの癌抑制タンパク質p53細胞内転写活性解析2009

    • 著者名/発表者名
      S.Oshima
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      20091121-20091124
  • [学会発表] Effective Method for Controlling Formation of Functionalized Amyloid Nanofibrils.2009

    • 著者名/発表者名
      H.Sakai
    • 学会等名
      第12回北大-ソウル大ジョイントシンポジウム
    • 発表場所
      韓国・ソウル
    • 年月日
      20091121-20091122
  • [学会発表] ポリカチオン配列を融合した四量体形成ドメインペプチドの細胞内導入によるp53機能の阻害2009

    • 著者名/発表者名
      R.Kamada
    • 学会等名
      第46回ペプチド討論会
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      20091104-20091106
  • [学会発表] p53誘導性ホスファターゼPPM1Dに対する2種の新規で強力な特異的阻害剤の活性2009

    • 著者名/発表者名
      H.Yagi
    • 学会等名
      第46回ペプチド討論会
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      20091104-20091106
  • [学会発表] ヒトPPM1Dファミリーホスファターゼの金属イオン、リン酸化アミノ酸、配列選択性2009

    • 著者名/発表者名
      R.Iwamuro
    • 学会等名
      第46回ペプチド討論会
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      20091104-20091106
  • [学会発表] p53四量体形成ドメインを介した多価minTBP-1のバイオメネラリゼーション活性2009

    • 著者名/発表者名
      T.Sakaguchi
    • 学会等名
      第46回ペプチド討論会
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      20091104-20091106
  • [学会発表] チオール基に対するプローブ化SCAPの開発2009

    • 著者名/発表者名
      K.Watanabe
    • 学会等名
      第46回ペプチド討論会
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      20091104-20091106
  • [学会発表] p53誘導性ホスファターゼPPM1Dの基礎認識と阻害剤活性2009

    • 著者名/発表者名
      H.Yagi
    • 学会等名
      第42回若手ペプチド夏の勉強会
    • 発表場所
      八王子セミナーハウス
    • 年月日
      20090802-20090804
  • [学会発表] Effects of tumor-associated mutations in tetramerization domain of p53 on tetrameric structure.2009

    • 著者名/発表者名
      R.Kamada
    • 学会等名
      VIII European Symposium of The Protein Society
    • 発表場所
      スイス・チューリッヒ
    • 年月日
      20090614-20090618
  • [学会発表] 分子情報生命科学:自己組織化を基盤とする機能性分子創成と界面構造2009

    • 著者名/発表者名
      K.Sakaguchi
    • 学会等名
      分子情報生命科学シンポジウム
    • 発表場所
      (独)理化学研究所和光キャンパス
    • 年月日
      2009-12-21
  • [学会発表] Alignment of amyloid peptides modified with a hydrophobic tail on substrate surfaces2009

    • 著者名/発表者名
      X.Chen
    • 学会等名
      分子情報生命科学シンポジウム
    • 発表場所
      (独)理化学研究所和光キャンパス
    • 年月日
      2009-12-21
  • [学会発表] p53誘導性ホスファターゼPPM1Dに対するシリル基を持つ低分子阻害性2009

    • 著者名/発表者名
      H.Yagi
    • 学会等名
      日本生化学会北海道支部第46回例会
    • 発表場所
      旭川医科大学
    • 年月日
      2009-07-17
  • [学会発表] Arrangement of Gold Nanoparticles and Nanorods on Aligned Peptide Fibrils.2009

    • 著者名/発表者名
      X.Chen
    • 学会等名
      日本化学会北海道支部2009年夏季研究発表会
    • 発表場所
      苫小牧工業高等専門学校
    • 年月日
      2009-07-11
  • [学会発表] 変異型p53四量体構造のカリックスアレーン誘導体による安定化2009

    • 著者名/発表者名
      R.Kamada
    • 学会等名
      日本化学会北海道支部2009年夏季研究発表会
    • 発表場所
      苫小牧工業高等専門学校
    • 年月日
      2009-07-11
  • [学会発表] SCAP法による機能化長鎖アミロイド線維の作製と配向制御2009

    • 著者名/発表者名
      H.Sakai
    • 学会等名
      日本化学会北海道支部2009年夏季研究発表会
    • 発表場所
      苫小牧工業高等専門学校
    • 年月日
      2009-07-11

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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