ポリユビキチン鎖認識の構造生物学

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21687009
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 深井 周也 東京大学, 放射光連携研究機構, 准教授 (10361792)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: X線結晶構造解析 / ユビキチン / 分子間相互作用 / 炎症シグナル / DNA損傷応答

研究概要

ユビキチンは,タンパク質分解の目印としてよく知られているが,近年の研究の進展に伴い,分解以外にも多様な細胞機能を制御する目印であることが明らかになってきた.本研究では,ユビキチンが様々な認識タンパク質に結合した複合体の三次元構造解析を行い, DNAの損傷に対する応答や炎症に対する応答の際に,ユビキチンの目印がどのように認識されているのかを原子の解像度で明らかにした.

研究成果

• [雑誌論文] Specific recognition of linear ubiquitin chains by the Npl4 zinc finger(NZF) domain of the HOIL-1L subunit of the linear ubiquitin chain assembly complex (2011)
  • 著者名/発表者名: Sato, Y., Fujita, H., Yoshikawa, A., Yamashita, M., Yamagata, A., Kaiser, S. E., Iwai, K., Fukai, S
  • 雑誌名: Proceedings of National Academy of Science United States of America 巻: 108巻 ページ: 20520-20525
  • DOI: DOI:10.1073/pnas.1109088108
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for specific recognition of Lys 63-linked polyubiquitin chains by NZF domains of TAB2 and TAB3 (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato, Y., Yoshikawa, A., Yamashita, M., Yamagata, A., Fukai, S.
  • 雑誌名: The EMBO Journal 巻: 28巻 ページ: 3903-3909
  • DOI: DOI:10.1038/emboj.2009.345
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the NEMO ubiquitin-binding domain in complex with Lys 63-linked di-ubiquitin (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoshikawa, A., Sato, Y., Yamashita, M., Mimura, H., Yamagata, A., Fukai, S.
  • 雑誌名: FEBS Letters. 巻: 583巻 ページ: 3317-3322
  • DOI: DOI:10.1016/j.febslet.2009.09.028
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for specific recognition of Lys 63-linked polyubiquitin chains by tandem UIMs of RAP80 (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato, Y., Yoshikawa, A., Mimura, H., Yamashita, M., Yamagata, A., Fukai, S.
  • 雑誌名: The EMBO Journal 巻: 28巻 ページ: 2461-2468
  • DOI: DOI:10.1038/emboj.2009.160
  • 査読あり
• [学会発表] 構造解析のためのユビキチン鎖の大量合成 (2011)
  • 著者名/発表者名: 深井周也
  • 学会等名: 第11回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ホテル阪急エキスポパーク
  • 年月日: 2011-06-09
• [学会発表] Structural basis of ubiquitinchain recognition by NZF domains for NF-κB activation (2011)
  • 著者名/発表者名: 深井周也
  • 学会等名: TNF2011
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場
  • 年月日: 2011-05-18
• [学会発表] Mechanisms for recognitionof K63-linked polyubiquitin chains (2010)
  • 著者名/発表者名: 深井周也
  • 学会等名: Pacifichem2010
  • 発表場所: ハワイコンベンションセンター
  • 年月日: 2010-12-19
• [学会発表] Znフィンガーによるユビキチン鎖識別のメカニズム (2010)
  • 著者名/発表者名: 深井周也
  • 学会等名: 平成22年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 大阪大学
  • 年月日: 2010-12-05
• [学会発表] ユビキチン化シグナルを読み解くユビキチン受容体の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 深井周也
  • 学会等名: 文部科学省科研費特定領域研究「タンパク質分解」公開シンポジウム
  • 発表場所: 東京ガーデンパレス
  • 年月日: 2010-08-21
• [学会発表] Lys63結合型ポリユビキチン鎖認識のメカニズム (2009)
  • 著者名/発表者名: 深井周也
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2009-12-10
• [図書] 細胞工学29巻[特集]ユビキチン修飾系の多彩な機能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 深井周也
  • 総ページ数: 1231-1235
  • 出版者: 秀潤社
• [図書] 日本結晶学会誌52巻特集構造生物学研究の新展開 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤裕介,深井周也
  • 総ページ数: 20-24
  • 出版者: 日本結晶学会
• [図書] 生体の科学60巻[特集]ユビキチン化による生体機能の調節 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤裕介,深井周也
  • 総ページ数: 593-598
  • 出版者: 金原一郎記念医学医療振興財団/医学書院
• [図書] 生化学 (2009)
  • 著者名/発表者名: 深井周也
  • 総ページ数: 815-819
  • 出版者: 日本生化学会
• [備考]
  • URL: http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/srro/