創薬ターゲットとしてのトリインフルエンザ抵抗性分子の同定

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21710204
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 国立遺伝学研究所 (2010); 東海大学 (2009)
• 研究代表者: 細道 一善 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 助教 (50420948)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• キーワード: ニワトリ / MHC / ゲノム / 多様性 / SNP / トリインフルエンザ

研究概要

ニワトリMHC領域はトリインフルエンザ抵抗性との関連性から抵抗性を規定する遺伝子が存在する可能性が考えられる。本研究では感受性MHCハプロタイプB13と抵抗性B21のMHC領域220kbのリシークエンスを行い、両ハプロタイプ間の多様性を明らかにすることでトリインフルエンザ抵抗性遺伝子を同定、その機能を明らかにすることを目的とした。MHC領域に含まれるアミノ酸変異を伴う非同義置換のSNPを検索したところ、17遺伝子がトリインフルエンザウイルス抵抗性遺伝子の候補として絞り込まれた。これらのうち、機能的ドメインとしてのアミノ酸変異を精査したところ、TRIM27.2のSPRYドメインにおいて3ヶ所のアミノ酸置換が認められた。

研究成果

• [雑誌論文] Exact break point of a 50 kb deletion 8 kb centromeric of the HLA-A locus with HLA-A*24:02: the same deletion observed in other A*24 alleles and A*23:01 allele. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mitsunaga S, Okudaira Y, Kunii N, Cui T, Hosomichi K, Oka A, Suzuki Y, Homma Y, Sato S, Inoue I, Inoko H.
  • 雑誌名: Immunogenetics. In press.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative genome analysis of the major histocompatibility complex (MHC) class I B/C segments in primates elucidated by genomic sequencing in common marmoset(Callithrix jacchus). (2011)
  • 著者名/発表者名: Shiina T, Kono A, Westphal N, Suzuki S, Hosomichi K, Kita YF, Roos C, Inoko H, Walter L.
  • 雑誌名: Immunogenetics. In press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exome Resequencing Combined with Linkage Analysis Identifies Novel PTH1R Variants in Primary Failure of Tooth Eruption in Japanese. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, Hosomich K, Narita A, Shirota T, Tomoyasu Y, Maki K, Inoue I.
  • 雑誌名: J Bone Miner Res. In press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Primordial Linkage of b2-Microglobulin to the MHC. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ohta Y, Shiina T, Lohr RL, Hosomichi K, Pollin TI, Heist EJ, Suzuki S, Inoko H, Flajnik MF.
  • 雑誌名: J Immunol. 186(6) ページ: 3563-3571
  • 査読あり
• [雑誌論文] 全エクソンシーケンスによる希少疾患の原因遺伝子同定 (2011)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、井ノ上逸朗
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 236(6) ページ: 565-570
• [雑誌論文] TRIM39 and RNF39 are associated with Behcet's disease independently of HLA-B*51 and.A*26. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurata R, Nakaoka H, Tajima A, Hosomichi K, Shiina T, Meguro A, Mizuki N, Ohono S, Inoue I, Inoko H.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 401(4) ページ: 533-537
  • 査読あり
• [雑誌論文] Basic characterization of 90 kDa heat shock protein genes HSP90AA1, HSP90AB1, HSP90B1 and TRAP1 expressed in Japanese quail (Coturnix japonica). (2010)
  • 著者名/発表者名: Nagahori K, Iwamoto S, Maruyama A, Suzuki S, Hosomichi K, Shiina T, Hara H, Yoshida Y, Hanzawa K.
  • 雑誌名: Anim Sci J. 81(4) ページ: 513-518
  • 査読あり
• [雑誌論文] Positional effects of polymorphisms in probe-target sequences on genoplot images of oligonucleotide microarrays. (2010)
  • 著者名/発表者名: Cui TL, Nakaoka H, Akiyama K, Kamura H, Hosomichi K, Bae J, Cheong H, Shin H, Yada T, Inoue I.
  • 雑誌名: Genet Mol Res. 9(1) ページ: 524-531
  • 査読あり
• [雑誌論文] 次世代シークエンサーによるHLA領域のターゲットリシークエンス (2010)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、椎名隆、井ノ上逸朗、猪子英俊
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 233(13) ページ: 1187-1191
• [雑誌論文] BG1 has a major role in MHC-linked resistance to malignant lymphoma in the chicken. (2009)
  • 著者名/発表者名: Goto RM, Wang Y, Taylor RL Jr, Wakenell PS, Hosomichi K, Shiina T, Blackmore CS, Briles WE, Miller MM.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA. 106 ページ: 16740-16745
  • 査読あり
• [雑誌論文] MHC class I A loci polymorphism and diversity in three Southeast Asian populations of cynomolgus macaque. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kita YF, Hosomichi K, Kohara S, Itoh Y, Ogasawara K, Tsuchiya H, Torii R, Inoko H, Blancher A, Kulski JK, Shiina T.
  • 雑誌名: Immunogenetics. 61(9) ページ: 635-648
  • 査読あり
• [雑誌論文] HLA-A allele associations with viral MER9-LTR nucleotide sequences at two distinct loci within the MHC alpha block. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kulski JK, Shigenari A, Shiina T, Hosomichi K, Yawata M, Inoko H.
  • 雑誌名: Immunogenetics. 61(4) ページ: 257-270
  • 査読あり
• [学会発表] Application of targeted resequencing methods to the MHC regions on chicken chromosome 16 (GGA16). (2011)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Miller MM, Goto RM, Suzuki S, Inoko H, Inoue I, Shiina T
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XIX Conference
  • 発表場所: Town & Country Convention Center, San Diego, California
  • 年月日: 20110115-20110119
• [学会発表] Genome sequencing of the major histocompatibility complex regions : comparative genomics from shark to man and re-sequencing of the entire HLA region. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Shiina T
  • 学会等名: Beckman Research Institute Seminar Series
  • 発表場所: City of Hope Medical Center, Los Angeles, California
  • 年月日: 2011-01-18
• [学会発表] Re-sequencing of the entire HLA region for informative polymorphism detection and haplotype map construction (2010)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Shiina T, Wang T, Suzuki S, Inoko H, InoueI
  • 学会等名: 60th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics (ASHG)
  • 発表場所: Washington, DC
  • 年月日: 20101102-20101106
• [学会発表] 医学・医療への応用を目的としたHLA領域のリシークエンシング (2010)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、椎名隆、王〓、鈴木進悟、田平知子、林健志、猪子英俊、井ノ上逸朗
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第55回大会
  • 発表場所: 大宮ソニックシティーホール
  • 年月日: 20101028-20101030
• [学会発表] 疾患ゲノム解明に向けた全エクソンおよびHLA領域ターゲットリシーケンス (2010)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、成田暁、椎名隆、猪子英俊、井ノ上逸朗
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第55回大会シンポジウム
  • 発表場所: 大宮ソニックシティーホール
  • 年月日: 20101028-20101030
• [学会発表] 次世代シークエンサーによるHLAハプロタイプのリシークエンス (2010)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、椎名隆、井ノ上逸朗、猪子英俊
  • 学会等名: 第19回日本組織適合性学会大会シンポジウム
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス
  • 年月日: 20100917-20100919
• [学会発表] Re-sequencing of the human MHC region toward to biomedical application for various animal genomes (2010)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Shiina T, Wang T, Suzuki S, Inoko H, InoueI
  • 学会等名: 9th IVIS International Veterinary Immunology Symposium
  • 発表場所: Tower Holl Funabori, Edogawa-ku, Tokyo
  • 年月日: 20100816-20100820
• [学会発表] Resequencing of the entire major histocompatibility complex regions to identify haplotype structure (2010)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Shiina T, Wang T, Suzuki S, Inoko H, InoueI
  • 学会等名: 日本進化学会2010年大会国際ワークショップ
  • 発表場所: 東京工業大学 大岡山キャンパス
  • 年月日: 20100802-20100805
• [学会発表] Development of personal genome analysis method on the entire HLA region (2009)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Shiina T, Wang T, Kawata H, Inoko H, Inoue I
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2009-12-09
• [学会発表] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発と疾患関連解析への応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 細道一善
  • 学会等名: 第4回バイオインフォマティクス研究者と医学研究者の交流会
  • 発表場所: 東京大学柏キャンパス
  • 年月日: 2009-11-20
• [学会発表] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、猪子英俊、河田寿子、井ノ上逸朗、椎名隆
  • 学会等名: 第18回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2009-09-26
• [学会発表] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、椎名隆、王、河田寿子、猪子英俊、井ノ上逸朗
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • 発表場所: グランドプリンスホテル高輪
  • 年月日: 2009-09-25
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.nig.ac.jp/section/inoue/inoue-j.html