癌特有の微小環境に応答する蛍光性小分子プローブの開発

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21710232
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 京都大学 (2010-2011); 徳島大学 (2009)
• 研究代表者: 中田 栄司 京都大学, エネルギー理工学研究所, 講師 (70467827)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: ケミカルバイオロジー / バイオイメージングプローブ

研究概要

がんの低酸素環境に特異的な蛍光プローブをはじめ、新しい蛍光変化メカニズムに基づく蛍光プローブの合理的な設計方法を確立することに成功し、バイオイメージングにおいても、その有用性について確認することが出来た。

研究成果

• [雑誌論文] Positional effects of phosphorylation on the stability and morphology of tau-related amyloid fibrils (2012)
  • 著者名/発表者名: Masafumi Inoue, Takashi Konno, Kazuki Tainaka, Eiji Nakata, Hiro-o Yoshida, Takashi Morii
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: Vol.51, No.7 ページ: 1396-1406
  • DOI: DOI:10.1021/bi201451z
• [雑誌論文] Zinc-Finger Proteins for Site-Specific Protein Positioning on DNA-Origami Structures (2012)
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, Fong Fong Liew, Chisana Uwatoko, Shigeki Kiyonaka, Yasuo Mori, Yousuke Katsuda, Masayuki Endo, Hiroshi Sugiyama and Takashi Morii
  • 雑誌名: Angew Chem. Int. Ed 巻: Vol.51, No.10 ページ: 2421-2424
  • DOI: DOI:10.1002/anie.201108199
• [雑誌論文] Effect of the Gc-derived Macrophage-activating Factor Precursor(preGcMAF) on Phagocytic Activation of Mouse Peritoneal Macrophages (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshihiro Uto, Syota Yamamoto, Ryota Takeuchi, Yoshinori Nakagawa, KeijiHirota, Hiroshi Terada, Shinya Onizuka, Eiji Nakata and Hitoshi Hori
  • 雑誌名: Anticancer Research 巻: Vol.31 ページ: 2489-2492
  • URL: http://ar.iiarjournals.org/content/31/7/2489.abstract
• [雑誌論文] Design Synthesis and Destructive Dynamic Effects of BODIPY-containing and Curcuminoid Boron Traced rugs for Neutron Dynamic Therapy (2011)
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, Masato Koizumi, Yohei Yamashita, Kenta Onaka, Yoshinori Sakurai, Natsuko Kondo, Koji Ono, Yoshihiro Uto and Hitoshi Hori
  • 雑誌名: Anticancer Research 巻: Vol.31 ページ: 2477-2482
  • URL: http://ar.iiarjournals.org/content/31/7/2477.abstract
• [雑誌論文] A ribonucleopeptide module for effective conversion of an RNA a tamer to a fluorescent sensor (2011)
  • 著者名/発表者名: Fong Fong Liew, Hironori Hayashi, ShunNakano, Eiji Nakata, Takashi Morii
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry 巻: Vol.19, No.19 ページ: 5771-5775
  • DOI: DOI:10.1016/j.bmc.2011.08.031
• [雑誌論文] Construction of Dopamine Sensors by Using Fluorescent Ribonucleopeptide Complexes (2011)
  • 著者名/発表者名: Fong Fong Liew, Tetsuya Hasegawa, Masatora Fukuda, Eiji Nakata, Takashi Morii
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry 巻: Vol.19, No.15 ページ: 4473-4481
  • DOI: DOI:10.1016/j.bmc.2011.06.031
• [雑誌論文] Facile conversion of RNA aptamers to modular fluorescent sensors with tunable detection wavelengths (2011)
  • 著者名/発表者名: Shun Nakano, Eiji Nakata and Takashi Morii
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 巻: Vol.21, No.15 ページ: 4503-4506
  • DOI: DOI:10.1016/j.bmcl.2011.05.120
• [雑誌論文] Formation and regulation of fullerene-incorporation in liposomes under the phase transition temperature (2011)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Ikeda, Yoshihiko Kawai, Jun-ichi Kikuchi, Motofusa Akiyama, Eiji Nakata, Yoshihiro Uto and Hitoshi Hori
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem 巻: Vol.9 ページ: 2622-2627
  • DOI: DOI:10.1039/c0ob01030h
• [雑誌論文] Evaluation of In Vivo Radiosensitizing Activity of Etanidazole as Hypoxic Cell Radiosensitizer Using Tumor-bearing Chick Embryo (2011)
  • 著者名/発表者名: Chiaki Abe, Yoshihiro Uto, Takashi Nakae, Yuuya Shinmoto, Keiichiro Sano, Hiroko Nakata, Mizue Teraoka, Yoshio Endo, Hiroshi Maezawa, Shin-ichiro Masunaga, Eiji Nakata and Hitoshi Hori
  • 雑誌名: J. Radiat. Res 巻: Vol.52 ページ: 208-214
  • DOI: DOI:10.1269/jrr.10122
• [雑誌論文] Synthesis and photo physical properties of new SNARF derivatives as dual emission pH sensors (2011)
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, Yoshijiro Nazumi, Yoshihiro Yukimachi, Yoshihiro Uto, Hiroshi Maezawa, Toshihiro Hashimoto, Yasuko Okamoto, and Hitoshi Hori
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 巻: Vol.21, No.6 ページ: 1663-1666
  • DOI: DOI:10.1246/cl.2010.734
• [雑誌論文] がんの特異的な検出を目指した蛍光イメージング法の最近の展開 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 森井孝, 宇都義浩, 堀均
  • 雑誌名: 放射線生物研究 巻: 46(2) ページ: 145-157
• [雑誌論文] Design of a SNARF-based ratiometric fluorescent probe for esterase (2010)
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, Yoshihiro Yukimachi, Yoshijiro Nazumi, Yoshihiro Uto, Toshihiro Hashimoto, Yasuko Okamoto, and Hitoshi Hori
  • 雑誌名: Chemistry Letters 巻: Vol.39, No.7 ページ: 734-735
  • DOI: DOI:10.1246/cl.2010.734
• [雑誌論文] A newly designed cell-permeable SNARF derivative as an effective intracellular pH indicator (2010)
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, Yoshihiro Yukimachi, Yoshijiro Nazumi, Yoshihiro Uto, Hiroshi Maezawa, Toshihiro Hashimoto, Yasuko Okamoto and Hitoshi Hori
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: Vol.46, No.20 ページ: 3526-3528
  • DOI: DOI:10.1039/c003167d
• [雑誌論文] Medicinal electronomics bricolage design of hypoxia-targeting antineoplastic drugs and invention of boron trace drugs as innovative future-architectural drugs (2010)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Hori, Yoshihiro Uto, Eiji Nakata
  • 雑誌名: Anticancer Res 巻: 30 ページ: 3233-3242
• [雑誌論文] Design of a bioreductively-activated fluorescent pH probe for tumor hypoxia imaging (2009)
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, Yoshihiro Yukimachi, Hirokazu Kariyazono, Seongwang Im, Chiaki Abe, Yoshihiro Uto, Hiroshi Maezawa, Toshihiro Hashimoto, Yasuko Okamoto and Hitoshi Hori
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry 巻: Vol.17, No.19 ページ: 6592-6958
  • DOI: DOI:10.1016/j.bmc.2009.08.037
• [雑誌論文] Semisynthetic fluorescent sensor proteins based on self-labeling protein tags (2009)
  • 著者名/発表者名: Matthias A. Brun, Kui-Thong Tan, Eiji Nakata, Marlon J. Hinner and Kai Johnsson
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: Vol.131, No.16 ページ: 5873-5884
  • DOI: DOI:10.1021/ja900149e
• [雑誌論文] Selective cross-linking of interacting proteins using self-labeling tags (2009)
  • 著者名/発表者名: Arnaud Gautier, Eiji Nakata, Grazvydas Lukinavicius, Kui-Thong Tan and Kai Johnsson
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: Vol.131, No.49 ページ: 17954-17962
  • DOI: DOI:10.1021/ja907818q
• [雑誌論文] Recent Progress in Strategies for Creation of Protein-based Fluorescent Biosensors (2009)
  • 著者名/発表者名: Hangxiang Wang, Eiji Nakata and Itaru Hamachi
  • 雑誌名: Chem BioChem 巻: Vol.10, No.16 ページ: 2560-2577
• [雑誌論文] 次世代動物実験系としての腫瘍移植鶏卵の構築と放射線照射による腫瘍成長阻害活性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 安部千秋, 宇都義浩, 遠藤良夫, 新元優也, 中島宏一郎, 佐野圭一郎, 佐々木有紀, 皆巳和賢, 前澤博, 増永慎一郎, 中田栄司, 堀均
  • 雑誌名: 放射線生物研究 巻: Vol.44, No.2 ページ: 233. 241
• [学会発表] タウタンパク質由来の凝集性ペプチドによるアミロイド線維形成能の評価 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶応大学
  • 年月日: 20120325-28
• [学会発表] 準安定複合体を利用したRNA検出蛍光プローブの開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松本桂彦・中田栄司・森井孝
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶応大学
  • 年月日: 20120325-28
• [学会発表] Zinc Finger proteinを介したDNA origami上への機能性タンパク質の配置 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西口泰裕・LIEW Fong Fong・中田栄司・森井孝
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶応大学
  • 年月日: 20120325-28
• [学会発表] RNAアプタマーを用いた機能性リボヌクレオペプチドの段階的構築 (2012)
  • 著者名/発表者名: 田村友樹・仲野瞬・中田栄司・森井孝
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶応大学
  • 年月日: 20120325-28
• [学会発表] バイオイメージングを指向した蛍光プローブの新しい設計法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司
  • 学会等名: 第2回分子ナノテクノロジーセンターシンポジウム
  • 発表場所: 兵庫県立大学
  • 年月日: 2012-03-13
• [学会発表] RNA高精度検出用蛍光プローブ (2012)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司
  • 学会等名: 大学シーズ説明発表会
  • 発表場所: 京都リサーチパーク
  • 年月日: 2012-01-27
• [学会発表] Sequence selective RNA detection by metastable PNA/RNA fluorescence probe (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto K., Nakata E., Saito I., Morii T.
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
  • 年月日: 20111109-11
• [学会発表] Facile conversion of RNA aptamers to modular fluorescent sensors (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamura T., Nakano S., Nakata E., Morii T.
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
  • 発表場所: Hokkaido
  • 年月日: 20111109-11
• [学会発表] Development of the immobilization technology of functional proteins on DNA origami (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakata E., 他
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
  • 発表場所: Hokkaido
  • 年月日: 20111109-11
• [学会発表] 準安定二重鎖を用いたRNA配列認識PNA蛍光センサー (2011)
  • 著者名/発表者名: 松本桂彦, 中田栄司, 森井孝
  • 学会等名: 第5回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 20110912-14
• [学会発表] DNA origami上への機能性タンパク質固定化技術の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第5回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 20110912-14
• [学会発表] 高いDNA/RNA配列認識能を有するPNA蛍光センサー (2011)
  • 著者名/発表者名: 松本桂彦・中田栄司・森井孝
  • 学会等名: 生体関連化学部会若手の会23回サマースクール
  • 発表場所: 広島
  • 年月日: 20110722-23
• [学会発表] RNPを用いたモジュール型蛍光センサーの作製 (2011)
  • 著者名/発表者名: 田村友樹・仲野瞬・中田栄司・森井孝
  • 学会等名: 生体関連化学部会若手の会23回サマースクール
  • 発表場所: 広島
  • 年月日: 20110722-23
• [学会発表] (2011)
  • 著者名/発表者名: 西口泰裕・中田栄司・森井孝
  • 学会等名: 生体関連化学部会若手の会23回サマースクール
  • 発表場所: 広島
  • 年月日: 20110722-23
• [学会発表] RNA高精度検出用蛍光プローブ (2011)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: グローバルCOE「地球温暖化時代のエネルギー科学拠点」産学連携シンポジウム
  • 発表場所: 京都テルサ
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] 細胞内pH計測用自己集合型蛍光プローブ (2011)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: グローバルCOE「地球温暖化時代のエネルギー科学拠点」産学連携シンポジウム
  • 発表場所: 京都テルサ
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Development of the attachment technology of functional proteins on DNA origami (2011)
  • 著者名/発表者名: Ngo T. A., Nakata E., Liew F. F., Nishiguchi Y., Morii T.
  • 学会等名: 11th iCeMS International Symposium
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2011-12-06
• [学会発表] 高い配列認識能をもつPNA蛍光センサーによるRNA検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松本桂彦・中田栄司・森井孝
  • 学会等名: 生体関連化学部会第26回若手フォーラム
  • 発表場所: 筑波大学
  • 年月日: 2011-09-11
• [学会発表] SNARFを基本骨格とした蛍光プローブの設計戦略 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 日本化学会第91春季年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-03-28
• [学会発表] 新しい蛍光制御機構に基づく酵素応答性蛍光プローブの開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司
  • 学会等名: 「医工連携をめざした生体光計測」フォーラム
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2011-03-04
• [学会発表] 細胞内pH計測により適合した新規SNARF誘導体の設計 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第12回生命化学研究会
  • 発表場所: 福井県芦原温泉清風荘
  • 年月日: 20100108-09
• [学会発表] Development of novel cell-permeable SNARF derivative as an intracellular fluorescent pH indicator (2010)
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, 他
  • 学会等名: Pasific Chem 2010
  • 発表場所: Hawai
  • 年月日: 2010-12-20
• [学会発表] ダイナミックドラッグ創生へのアプローチ-ボロントレースドラッグ仕様BODIPY含有抗酸化物質のメディシナルケミストリー (2010)
  • 著者名/発表者名: 堀均, 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第14回バイオ治療法研究会学術集会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2010-12-11
• [学会発表] SNARFを基本骨格とした蛍光プローブの合理的設計戦略 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第4回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-25
• [学会発表] がん細胞内pHを検出するための蛍光性pHインジケーターの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] Design of boron tracedrug phenolic BODIPY-containing antioxidants as autopsy/virtopsy imaging agents (2010)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Hori, Eiji Nakata and Yoshihiro Uto
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] 新しい蛍光制御機構に基づく酵素応答性蛍光プローブの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司
  • 学会等名: 第10回エンジニアリングフェスティバル
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2010-09-17
• [学会発表] 蛍光プローブの合理的設計を目指したSNARF誘導体の自己集合化能についての検討 (2010)
  • 著者名/発表者名: 那住善治郎, 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学若手の会サマースクール
  • 発表場所: 愛知
  • 年月日: 2010-07-16
• [学会発表] 新しい蛍光制御機能に基づく酵素応答性蛍光プローブの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司
  • 学会等名: 第9回国際バイオEXPO
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-07-01
• [学会発表] 新しい蛍光制御機構に基づく酵素応答性蛍光プローブの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司
  • 学会等名: 第1回徳島大学研究者との集い
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-06-22
• [学会発表] 外部刺激応答型蛍光プローブの開発と低酸素細胞の選択的可視化への応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第16回国際癌治療増感研究会
  • 発表場所: 岐阜
  • 年月日: 2010-06-19
• [学会発表] 新規な細胞膜透過性SNARF誘導体による細胞内pHの効果的な計測 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会第5回年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-05-19
• [学会発表] 細胞内pHの計測に適した改良型SNARFの設計とその評価 (2010)
  • 著者名/発表者名: 行待芳浩, 中田栄司, 他
  • 学会等名: 日本薬学会第130年会
  • 発表場所: 岡山県桃太郎アリーナ
  • 年月日: 2010-03-29
• [学会発表] 細胞内pH計測に適した新規SNARF誘導体の設計とその機能評価 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会
  • 発表場所: 近畿大学本部キャンパス
  • 年月日: 2010-03-26
• [学会発表] Bioreductively-Activated Fluorescent pH Probe for Tumor Hypoxia Imaging (2009)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第7回がんとハイポキシア研究会
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス本部構内百周年時計台記念館
  • 年月日: 20091205-06
• [学会発表] Design of a Bioreductively-Activated Fluorescent pH Probe for Tumor Hypoxia Imaging (2009)
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, et. al.
  • 学会等名: 2^<nd> Switzerland-Japan Biomolecular Chemistry Symposium 2009
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20090911-12
• [学会発表] 合理的にデザインされた蛍光プローブの開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 分子化学研究会
  • 発表場所: 大阪府箕面市みのお山荘
  • 年月日: 2009-10-17
• [学会発表] 効果的な細胞内pHの計測を目指した改良型SNARFの設計とその評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 行待芳浩, 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第24回生体機能関連化学若手フォーラム
  • 発表場所: 九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
  • 年月日: 2009-09-16
• [学会発表] がん低酸素環境を標的とした蛍光性pHプローブの開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司他
  • 学会等名: 第24回生体機能関連化学シンポジウム第12回バイオテクノロジーシンポジウム
  • 発表場所: 九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
  • 年月日: 2009-09-15
• [学会発表] 細胞内pHの計測を志向した改良型SNARFの設計とその評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 行待芳浩, 中田栄司, 他
  • 学会等名: 第24回生体機能関連化学シンポジウム第12回バイオテクノロジーシンポジウム
  • 発表場所: 九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
  • 年月日: 2009-09-15
• [学会発表] 癌低酸素環境で選択的に機能する蛍光性pHプローブの開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中田栄司, 他
  • 学会等名: 生体機能関連若手の会サマースクール2009
  • 発表場所: 関西セミナーハウス
  • 年月日: 2009-07-13
• [図書] レクチンチップ"バイオチップ実用化ハンドブック" (2010)
  • 著者名/発表者名: 浜地格, 中田栄司
  • 総ページ数: 187-195
  • 出版者: 株式会社NTS
• [図書] Recent progress in the construction methodology of fluorescent biosensors based on biomolecules
  • 著者名/発表者名: Eiji Nakata, Fong Fong Liew, Shun Nakano and Takashi Morii
  • 出版者: Environment and Biosecurity
• [備考] 京都大学・エネルギー理工学研究所・生物機能科学研究分野・森井研究室
  • URL: http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/material/a-12_j.html
• [産業財産権] (2011)
  • 発明者名: 森井孝,中田栄司,松本桂彦
  • 権利者名: 京都大学
  • 産業財産権番号: 特許、特願2011-244709
  • 出願年月日: 2011-11-08
• [産業財産権] ナノ集合体 (2010)
  • 発明者名: 中田栄司,掘均,宇都義浩・行待芳浩
  • 権利者名: 徳島大学
  • 産業財産権番号: 特許、特願2010-129211
  • 出願年月日: 2010-06-04
• [産業財産権] 蛍光プローブ (2010)
  • 発明者名: 中田栄司,掘均,宇都義浩
  • 権利者名: 徳島大学
  • 産業財産権番号: 特許、特願2010-27884
  • 出願年月日: 2010-02-10