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2010 年度 実績報告書

III型ポリケタイド合成酵素のX線結晶構造解析を基盤とする触媒機能の制御

研究課題

研究課題/領域番号 21710235
研究機関東京大学

研究代表者

森田 洋行  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助教 (20416663)

キーワードポリフェノール / ポリケタイド合成酵素 / ベンザルアセトン / カルコン
研究概要

ダイオウ由来ベンザルアセトン合成酵素(BAS)に、L-型あるいはD-型のフェニルアラニンおよびトリプトファンとのCoAエステルをプローブとして作用さると、いずれにおいてもアミノアシルCoAに1分子のマロニルCoAを縮合の後、分子内ラクタム化を進行してテトラミン酸を生成することを見いだした。また、今回得られた4種のテトラミン酸2量体(単量体から自発的に2量化)についてマウス白血細胞を用いて細胞毒性試験を行った結果、D-型のフェニルアラニンから誘導されたテトラミン酸2量体のみが細胞毒性活性を示すことを明らかにした。2.クルクミノイド合成酵素(CUS)のX線結晶構造解析に2.5Aの分解能で成功した。その結果、CUSの活性中心キャビティにはCUS活性を示すために必要な特異なポケットが存在すること、および触媒残基Cys近傍に求核的水分子が存在することを見いだし、結晶構造に基づいたCUSの触媒機構仮説を報告した。3.PKS1は、カルバモイル基を有する安息香酸とのCoAエステルとマロニルCoAから6-5-6縮合環構造を有する非天然型新規アルカロイドを生成する。今回、結晶構造解析と推定酵素反応中間体とのドッキングシミュレーションの結果に基づき変異導入を行った結果、開始基質に3分子のマロニルを縮合の後、シッフ塩基の形成を介して、酵素的にC-N結合形成と閉環反応が2回進行して生成した6-7-6縮合環構造を有する非天然型新規アルカロイドの創出に成功した。窒素原子を適切な位置に配置した開始基質を用いることにより、より複雑な骨格を有する非天然型アルカロイド骨格を創出できる可能性を示す結果である。さらなる酵素反応機構の解明と酵素触媒機能の拡張および非天然型アルカロイドの創出に取り組んでいきたい。

  • 研究成果

    (26件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (18件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Cytotoxic tetramic acid derivative produced by a plant type-III polyketide synthase2011

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Wakimoto, Takahiro Mori, Hiroyuki Morita, Ikuro Abe
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc.

      巻: (印刷中)(掲載確定)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular cloning, modeling and site-directed mutagenesis of type III polyketide synthase form Sargassum binderi (Phaeophyta)2011

    • 著者名/発表者名
      Hariyanti Baharum, Hiroyuki Morita, Akifumi Tomitsuka, Fong-Chin Lee, Kim-Yong Ng, Raha Abdul Rahim, Ikuro Abe, Chai-Ling Ho
    • 雑誌名

      Marine Biotechnology

      巻: (印刷中)(掲載確定)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 二次代謝酵素の機能制御と生合成工学2011

    • 著者名/発表者名
      森田洋行、阿部郁朗
    • 雑誌名

      化学工業

      巻: Vol.62 ページ: 14-20

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression, Purification and Crystallization of A Plant Type III Polyketide Synthase that Produces Curcuminoid2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyofumi Wanibuchi, Hiroyuki Morita, Hiroshi Noguchi, Ikuro Abe
    • 雑誌名

      Bioorg.Med.Chem.Lett.

      巻: VOL.21 ページ: 2083-2086

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the one-pot formation of the diarylheptanoid scaffold by curcuminoid synthase2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Morita, Kiyofumi Wanibuchi, Hirohiko Nii, Ryohei Kato, Shigetoshi Sugio
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      巻: VOL.107 ページ: 19778-19783

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure-based engineering of benzalacetone synthase2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Shimokawa, Hiroyuki Morita, Ikuro Abe
    • 雑誌名

      Bioorg.Med.Chem.Lett.

      巻: VOL.20 ページ: 5099-5103

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression, Purification and Crystallization of A Plant Type III Polyketide Synthase that Produces Curcuminoid2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Morita, Kiyofumi Wanibuchi, Ryohei Kato, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.Sect F Struct.Biol.Cryst.Commun.

      巻: VOL.67 ページ: 948-950

    • 査読あり
  • [学会発表] A Structure-based Mechanisms for Plant Polyketide Biosynthesis2011

    • 著者名/発表者名
      森田洋行
    • 学会等名
      JSPS-DGHE JOINT RESERCH PORJECT
    • 発表場所
      Bandung、Indonesia
    • 年月日
      2011-01-18
  • [学会発表] Structure-based mechanism for benzalacetone synthase from Rheum palmatum2010

    • 著者名/発表者名
      森田洋行、下川良彦、阿部郁朗
    • 学会等名
      PACIFICHEM2010
    • 発表場所
      Hawaii、USA
    • 年月日
      2010-12-17
  • [学会発表] Enzymatic formation of unnatural novel chalcone, stilbene, and benzophenone scaffolds by plant type III polyketide synthase2010

    • 著者名/発表者名
      鰐渕清史、Shepo-Shi Shi、森田洋行、野口博司、阿部郁朗
    • 学会等名
      PACIFICHEM2010
    • 発表場所
      Hawaii、USA
    • 年月日
      2010-12-17
  • [学会発表] Cloning and characterization of novel type III polyketide synthases from calamondin orange (Citrus microcarpaBunge)2010

    • 著者名/発表者名
      金城桂史、森田洋行、野口博司、阿部郁朗
    • 学会等名
      PACIFICHEM2010
    • 発表場所
      Hawaii、USA
    • 年月日
      2010-12-17
  • [学会発表] Enzymatic synthesis of unnatural novel alkaloidal scaffolds by plant polyketide syntheses2010

    • 著者名/発表者名
      山下誠、森田洋行、Shepo Shi、野口博司、阿部郁朗
    • 学会等名
      PACIFICHEM2010
    • 発表場所
      Hawaii、USA
    • 年月日
      2010-12-17
  • [学会発表] 植物ポリケタイド合成酵素の構造と機能2010

    • 著者名/発表者名
      森田洋行
    • 学会等名
      第47回植物化学シンポジウム
    • 発表場所
      静岡県立大学(静岡県)
    • 年月日
      2010-11-08
  • [学会発表] Crystal structure analysis of the type III polyketide synthase that produces curcuminoid2010

    • 著者名/発表者名
      森田洋行、阿部郁朗
    • 学会等名
      第25回天然薬物検討会
    • 発表場所
      国立海洋生物博物館行政中心国際会議棟(台北、台湾)
    • 年月日
      2010-11-05
  • [学会発表] 植物ポリケタイド合成酵素の触媒機能の拡張と非天然型化合物の創出2010

    • 著者名/発表者名
      森田洋行
    • 学会等名
      第3回日本薬学会関東支部若手シンポジウム
    • 発表場所
      東京薬科大学(東京都)
    • 年月日
      2010-10-02
  • [学会発表] クマロイルCoA合成酵素の新規触媒機能と構造解析:チオエステルからアミドリガーゼ、ペプチド合成酵素への機能拡張2010

    • 著者名/発表者名
      鰐渕清史、森貴裕、庭野智子、張剛、脇本敏幸、森田洋行、阿部郁朗
    • 学会等名
      第52回天然有機化合物討論会
    • 発表場所
      グランシップ静岡(静岡県)
    • 年月日
      2010-09-29
  • [学会発表] 植物ポリフェノールの生合成に関する研究2010

    • 著者名/発表者名
      森田洋行
    • 学会等名
      第57回日本生薬学会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学(徳島県)
    • 年月日
      2010-09-26
  • [学会発表] 光学活性アミノ酸誘導体を基質とした植物ポリケタイド合成酵素の触媒機能拡張2010

    • 著者名/発表者名
      森貴裕、森田洋行、脇本敏幸、阿部郁朗
    • 学会等名
      第57回日本生薬学会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学(徳島県)
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] ポリケタイド合成酵素のX線結晶構造解析を基盤とする新規アルカロイド骨格合成反応機構の解明2010

    • 著者名/発表者名
      森田洋行、山下誠、野口博司、脇本敏幸、阿部郁朗
    • 学会等名
      第57回日本生薬学会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学(徳島県)
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] 四季柑由来キノリノンの骨格を構築する新規III型ポリケタイド合成酵素のクローニングと機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      金城桂史、森田洋行、野口博司、阿部郁朗
    • 学会等名
      第57回日本生薬学会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学(徳島県)
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] クマロイルCoA合成酵素の新規触媒機能の開拓2010

    • 著者名/発表者名
      鰐渕清史、森田洋行、阿部郁朗
    • 学会等名
      第57回日本生薬学会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学(徳島県)
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] クマロイルCoA合成酵素の新規触媒機能と構造解析:チオエステルからアミドリガーゼ、ペプチド合成酵素への機能拡張2010

    • 著者名/発表者名
      鰐渕清史、庭野智子、脇本敏幸、森田洋行、阿部郁朗
    • 学会等名
      第14回生体触媒化学シンポジウム
    • 発表場所
      グランシップ静岡(静岡県)
    • 年月日
      2010-09-24
  • [学会発表] III型ポリケタイド合成酵素を用いた非天然型新規アルカロイドの創出2010

    • 著者名/発表者名
      森貴裕、森田洋行、阿部郁朗
    • 学会等名
      第45回天然物化学談話会
    • 発表場所
      三谷温泉ホテル明山荘(愛知県)
    • 年月日
      2010-07-07
  • [学会発表] 結晶構造に基づく植物ポリケタイド合成酵素の反応機構の解明2010

    • 著者名/発表者名
      森田洋行、下川良彦、加藤良平、杉尾成俊、河野俊之、阿部郁朗
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • 年月日
      2010-06-18
  • [学会発表] 植物ポリケタイド合成酵素の機能制御と超天然型新規生体触媒の開発2010

    • 著者名/発表者名
      森田洋行
    • 学会等名
      第11回酵素応用シンポジウム
    • 発表場所
      メルパルクNAGOYA(愛知県)
    • 年月日
      2010-06-11
  • [産業財産権] 植物ポリケタイド合成酵素を用いた6-7-6縮合環構造を有する3環性非天然型アルカロイドの生産2010

    • 発明者名
      阿部郁朗、脇本敏幸、森田洋行、山下誠
    • 権利者名
      国立大学法人東京大学
    • 産業財産権番号
      特許、特願2010-212208
    • 出願年月日
      2010-09-22

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公開日: 2012-07-19  

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