タンパク質と水の動的相互作用を通した機能の解明

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21740307
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理・化学物理
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 寺本 央 北海道大学, 電子科学研究所, 助教 (90463728)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: タンパク質 / 水 / エネルギー論 / Lagrange協同構造 / Koopman演算子

研究概要

タンパク質の機能は、タンパク質が受ける外的刺激に対するその一連の応答と考えられる。その応答は、具体的には、一連の化学反応あるいはタンパク質の構造変化等で構成され、その一連の化学反応あるいはタンパク質の構造変化には周辺の水が重要な役割を担っている。本研究では、タンパク質と類似の性質を持つペプチドを対象に、周辺の水がペプチド分子の構造変化に与える影響の分類、および、その分子論的なメカニズムを、エネルギー論、Lagrange協同構造、Koopman演算子等の観点から解明した。

研究成果

• [雑誌論文] 高次元力学系における輸送現象の理解の広がり:法双曲不変多様体、安定多様体、不安定多様体とその崩壊 (2011)
  • 著者名/発表者名: 寺本央、戸田幹人、小松崎民樹
  • 雑誌名: 物性研究 巻: 97(3) ページ: 547
• [雑誌論文] Decomposability of Multivariate Interactions (2011)
  • 著者名/発表者名: Naoki Miyagawa, Hiroshi Teramoto Chun-Biu Li and Tamiki Komatsuzaki
  • 雑誌名: Complex Systems 巻: 20 ページ: 165
  • 査読あり
• [雑誌論文] Spatial Heterogeneity of Multivariate Dependence (2011)
  • 著者名/発表者名: Naoki Miyagawa, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li and Tamiki Komatsuzaki
  • 雑誌名: AIP Conference Proceedings 巻: 1389 ページ: 991
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Dynamical Switching of a Reaction Coordinate to Carry the System Through to a Different Product State at High Energies (2011)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Teramoto, Mikito Toda and Tamiki Komatsuzaki
  • 雑誌名: Phys. Rev. Lett. 巻: 134 ページ: 054101
  • 査読あり
• [雑誌論文] How does a choice of Markov partition affect the resultant symbolic dynamics? (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Teramoto and Tamiki Komatsuzaki
  • 雑誌名: Chaos 巻: 20 ページ: 037113
  • 査読あり
• [雑誌論文] 多自由度Hamilton系における安定/不安定多様体の可能な折り畳みパターンとそれらの力学系の性質との関係 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺本央、小松崎民樹
  • 雑誌名: 数理解析研究所講究録 巻: 1688 ページ: 26
• [学会発表] 法双曲不変多様体崩壊のシナリオ (2012)
  • 著者名/発表者名: 寺本央
  • 学会等名: ワークショップ「力学的決定性と統計性の中間領域を探るIV」
  • 発表場所: 関西セミナーハウス(京都市)
  • 年月日: 2012-03-30
• [学会発表] Analysis of dynamical systems with large degrees of freedom in terms of hyperbolic invariant manifolds and their breakdown (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Tetemoto
  • 学会等名: NEXT2012Nara Generalized entropies, and information geometry
  • 発表場所: 国立大学法人奈良女子大学記念会議室(奈良県)
  • 年月日: 2012-03-07
• [学会発表] 局所スペクトルによる大自由度力学系の動態解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 寺本央、戸田幹人、小松崎民樹
  • 学会等名: 応用数理若手の会単独研究会
  • 発表場所: 早稲田大学(西早稲田)
  • 年月日: 2011-12-26
• [学会発表] ペプチドと水の動力学的相互作用の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Teramoto and T. Komatsuzaki
  • 学会等名: 日本生物物理学会第48回年会
  • 発表場所: 東北大学(仙台)
  • 年月日: 2010-09-27