研究課題
DNA塩基配列の違いによるDNA-色素間の結合速度の比較検討DNAは野生型では主にB型構造をとるが、C-Gペアの増大によりA型構造へと変化する事が知られている。またA-Tペアを多数含むDNAは、構造多様性が高く、塩濃度やリガンドがA-Tペアを多く含むDNAに配位することにより、高次構造の変化が誘起されることがある。このDNAの構造の違いはDNA螺旋のピッチを変えるために、特に色素がメジャーまたはマイナーグルーブへ結合する過程が変調を受けると考えられる。従って、H2TMPyPと特定の塩基配列のオリゴDNAとの結合過程を測定することで、塩基配列の違いによるDNA-色素間の結合の違いが観測できると期待される。本年度は、A-Tペアのみで構成されたオリゴDNAとH2TMPyPの相互作用を考察したところ、初期的には、H2TMPyPがA-Tペアで構成されるオリゴDNAの2重螺旋のマイナーグルーブへと結合することが正のコットン効果を示すCDスペクトルから推察されたが、H2TMPyPの濃度増加に伴い著しいCDスペクトルの変化、具体的には、H2TMPyP間の相互作用に伴う正負のCDパターンへと変化していくという興味深い結果を得た。速度論的考察を行い、この正負のCDパターンへの変化は比較的遅く、このことからオリゴDNAの構造変化をも伴うような大規模な構造変化がH2TMPyPによって誘起された可能性が高いことが判明した。一方、G-Cペアを多数含む配列のオリゴDNAを用い、塩濃度変化にともなう、B-Z転移速度の直接観測を試みたところ、B-Z変化は非常に遅く、本研究のターゲットとして適切ではないことが判明した。
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