クロマチン免疫沈降法を利用した葉緑体転写制御機構の解析

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21770034
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 植物分子生物・生理学
• 研究機関: 千葉大学
• 研究代表者: 華岡 光正 千葉大学, 大学院・園芸学研究科, 特任准教授 (30508122)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• キーワード: 葉緑体 / 転写制御 / ChIP / 環境応答 / シロイヌナズナ / 色素体分化 / シグマ因子

研究概要

本研究では、クロマチン免疫沈降(ChIP)法を植物の葉緑体研究に導入・確立することで、葉緑体転写制御をin vivo でリアルタイムにモニターできる解析系の開発と利用を目指した。シロイヌナズナの葉緑体シグマ因子の機能分担について解析を行った結果、生育に必須なSIG1の標的遺伝子が発見されたとともに、ストレスに応答するSIG5の新しいターゲットも見いだされ、環境変化に応じてシグマ因子を使い分けている仕組みをより詳細に明らかにすることができた。

研究成果

• [雑誌論文] A tetrapyrrole-regulated ubiquitin ligase controls algal nuclear DNA replication. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yuki Kobayashi, Sousuke Imamura, Mitsumasa Hanaoka, Kan Tanaka
  • 雑誌名: Nature Cell Biology 13(4) ページ: 483-487
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chloroplast isolation and run-on transcription assay in Cyanidioschyzon merolae. (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsumasa Hanaoka, Takayuki Kawakami, Kan Tanaka
  • 雑誌名: Journal of Endocytobiosis and Cell Research 20 ページ: 45-52
  • 査読あり
• [雑誌論文] The basics of cultivation and molecular genetic analysis of the unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yuki Kobayashi, Mio Ohnuma, Tsuneyoshi Kuroiwa, Kan Tanaka, Mitsumasa Hanaoka
  • 雑誌名: Journal of Endocytobiosis and Cell Research 20 ページ: 53-61
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mg-protoporphyrin IX Signaling in Cyanidioschyzon merolae : Multiple pathways may involve the retrograde signaling in plant cells. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yu Kanesaki, Yuki Kobayashi, Mitsumasa Hanaoka, Kan Tanaka
  • 雑誌名: Plant Signaling and Behavior 4(12) ページ: 1190-1192
  • 査読あり
• [雑誌論文] 植物で明らかにされたリボソームRNA合成酵素の進化の道筋-植物特異的なTFIIB型基本転写因子pBrpの機能解析- (2009)
  • 著者名/発表者名: 今村壮輔、華岡光正、田中寛
  • 雑誌名: 化学と生物 Vol.47,No.11 ページ: 740-742
• [学会発表] ChIP on chip法を利用したシアノバクテリア強光応答転写制御の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 華岡光正、岩崎秀雄、高井直樹、近藤孝男、田中寛
  • 学会等名: 日本農芸化学会2011年度大会
  • 発表場所: 京都女子大学
  • 年月日: 2011-03-26
• [学会発表] タバコBY-2細胞におけるアミロプラスト分化制御メカニズムの解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 本橋典子、江波和彦、小沢友希、中邨真之、田中寛、華岡光正
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2011-03-22
• [学会発表] 単細胞紅藻Cyanidioschyzon merolaeにおける葉緑体ヒスチジンキナーゼの機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤大地、田中寛、華岡光正
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2011-03-22
• [学会発表] クロマチン免疫沈降法によるシロイヌナズナ葉緑体シグマ因子の機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 加藤麻衣子、石井健雄、東美由紀、田中寛、華岡光正
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] シロイヌナズナ細胞で誘導される色素体分化に伴った核遺伝子発現の制御機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 江波和彦、小沢友希、木山貴史、田中寛、華岡光正
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] Chromatin immunoprecipitation-based Analysis of Transcriptional Regulation in Arabidopsis thaliana Chloroplasts. (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsumasa Hanaoka, Maiko Kato, Miyuki Azuma, Kan Tanaka
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸国際会議場
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] タバコ培養細胞BY-2におけるアミロプラスト分化に際した遺伝子発現制御系の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 華岡光正、本橋典子、小沢友希、田中寛
  • 学会等名: 日本農芸化学会関東支部2010年度大会
  • 発表場所: 千葉大学
  • 年月日: 2010-10-09
• [学会発表] 光合成機能を守るコア制御ネットワーク (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中寛、華岡光正
  • 学会等名: 日本農芸化学会関東支部2010年度大会(招待講演)
  • 発表場所: 千葉大学
  • 年月日: 2010-10-09
• [学会発表] ChIP法を用いたシロイヌナズナ葉緑体シグマ因子の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 華岡光正、加藤麻衣子、東美由紀、田中寛
  • 学会等名: 第74回日本植物学会大会
  • 発表場所: 中部大学
  • 年月日: 2010-09-10
• [学会発表] シロイヌナズナ葉緑体シグマ因子SIG6の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 廣岡俊亮、華岡光正、田中寛
  • 学会等名: 第74回日本植物学会大会
  • 発表場所: 中部大学
  • 年月日: 2010-09-10
• [学会発表] The role of two-component system for light-dependent transcriptional regulation in Cyanidioschyzon merolae chloroplasts. (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsumasa Hanaoka, Takayuki Kawakami, Daichi Satoh, Sousuke Imamura, Kan Tanaka
  • 学会等名: The 11th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis
  • 発表場所: Troms, Norway.
  • 年月日: 2010-08-29
• [学会発表] アミロプラスト分化に際した色素体遺伝子発現の役割 (2010)
  • 著者名/発表者名: 華岡光正、本橋典子、小沢友希、田中寛
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2010-03-29
• [学会発表] クロマチン免疫沈降法を利用したシロイヌナズナ葉緑体転写制御系の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 華岡光正、加藤麻衣子、東美由紀、田中寛
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学
  • 年月日: 2010-03-20
• [学会発表] 「ChIP法を用いたシアノバクテリア転写制御研究の新展開」かずさDNA研究所研究会 (2009)
  • 著者名/発表者名: 華岡光正、岩崎秀雄、近藤孝男、田中寛
  • 学会等名: ラン藻の分子生物学2009(招待講演)
  • 発表場所: かずさアーク
  • 年月日: 2009-12-05
• [学会発表] アミロプラスト分化に際した遺伝子発現制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 華岡光正、本橋典子、小沢友希、田中寛
  • 学会等名: 第73回日本植物学会大会
  • 発表場所: 山形大学
  • 年月日: 2009-09-18
• [学会発表] RpaB-dependent transcriptional regulation during high light stress in cyanobacteria. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mitsumasa Hanaoka, Asako Seki, Yuki Akimoto, Kan Tanaka
  • 学会等名: The 5th German-Japan Binational Seminar "From Photoreaction to Biomass : Phototrophs in Ecosystems and Biotechnology"
  • 発表場所: Tsukuba, apan.
  • 年月日: 2009-06-04
• [図書] Coordination of nuclear and plastid gene expression in red algae and green plants.(In Red Algae in the Genomic Age, Joseph Seckbach and David Chapman (eds.)) (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsumasa Hanaoka, Kan Tanaka
  • 総ページ数: 171-190
  • 出版者: Springer, Berlin, Germany
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.h.chiba-u.jp/tenure/