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2009 年度 実績報告書

腐性ブドウ球菌に存在する唯一の接着因子UafAの構造機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 21770101
研究機関北海道大学

研究代表者

田中 良和  北海道大学, 創成研究機構, 特任助教 (20374225)

キーワード結晶構造解析 / 腐性ブドウ球菌 / 接着因子
研究概要

腐性ブドウ球菌は尿路感染症の主要な原因菌であり,若年女性の尿路感染症の15%程度が腐性ブドウ球菌により引き起こされている.『女性の60%以上が一生に1回以上尿路感染症を発症する』という統計を考慮すると,腐性ブドウ球菌に関する基礎研究は社会的要請の高いものであるといえる.病原性細菌が感染する際,ホスト細胞への接着は感染の成否を決定する重要な過程となる.ブドウ球菌属の細菌は,細胞表面に存在する接着因子蛋白質を用いてホスト細胞に定着するが,腐性ブドウ球菌には1種類の接着因子(uro-adherence factor A ; UafAと略)しか存在しない.これは,尿路という激しく尿が流動する過酷な環境下において,腐性ブドウ球菌がUafAのみを用いてホスト細胞に定着することを示唆しており,非常に興味深い.本研究では,X線結晶構造解析により,UafAによるリガンド認識機構を解明する.
今年度は,UafAのN2-N3-Bドメインの構造解析を行った.これまでの分解能が2.3A程度だったのに対し,N末端のフレキシブルループを削ることにより,1.5Aの分解能のデータ収集を行うことができた.得られた電子密度マップより,Bドメインの全体構造をトレースすることができた.更に,これまで明らかにした構造の重ねあわせから,N1, N3ドメインに対するBドメインの配置はフレキシブルであることがわかった.N3-B間のループの構造にも大きな構造変化が認められ,これらがリガンド認識に関与している可能性が示唆された.

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2009

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Deduced RNA binding mechanism of ThiI based on structural and binding analyses of a minimal RNA ligand2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Tanaka, S.Yamagata, Y.Kitago, Y.Yamada, S.Chimnaronk, M.Yao, I.Tanaka
    • 雑誌名

      RNA 15

      ページ: 1498-1506

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The interaction of hyperthermophilic TATA-box binding protein with single-stranded DNA is entropically favorable and exhibits a large negative heat capacity change at high salt conce ntration2009

    • 著者名/発表者名
      S.Nagatoishi, Y.Tanaka, M.Kudou, K.Tsumoto
    • 雑誌名

      Mol.BioSyst. 5

      ページ: 957-961

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Contributions of interfacial residues of human Interleukin15 to the specificity and affinity for its private alpha-receptor2009

    • 著者名/発表者名
      S.Sakamoto, J.M.Caaveiro, E.Sano, Y.Tanaka, M.Kudou, K.Tsumoto
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 389

      ページ: 880-894

    • 査読あり
  • [学会発表] tRNAチオ化修飾酵素ThiIのRNA認識機構の解析2009

    • 著者名/発表者名
      田中良和, 山形しおり, 北郷悠, 山田洋子, チムナロンサリン, 姚閔, 田中勲
    • 学会等名
      RNA学会
    • 発表場所
      新潟、新潟コンベンミョンセンター
    • 年月日
      2009-07-27
  • [学会発表] tRNAチオ化修飾酵素 ThiIのtRNA認識機構2009

    • 著者名/発表者名
      田中良和, 山形しおり, 北郷悠, 山田洋子, チムナロンサリン, 姚閔, 田中勲
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本、熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 年月日
      2009-05-22

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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