腐性ブドウ球菌に存在する唯一の接着因子UafAの構造機能解析

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21770101
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 田中 良和 北海道大学, 創成研究機構, 特任助教 (20374225)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 接着因子 / 結晶構造解析 / 腐性ブドウ球菌

研究概要

病原性細菌はホスト細胞に感染するための様々な接着因子を持つが,若年女性の尿路感染症の主要な原因菌の一つである腐性ブドウ球菌はUafAという1種類しか接着因子を持たない.本研究では, UafAの機能ドメインの結晶構造を1. 5Aの高分解能で決定した.他の生物由来の接着因子との構造比較から, Bドメインを用いた,新たなリガンド認識機構が提案された.

研究成果

• [雑誌論文] Crystal Structure of the Octameric Pore of Staphylococcalγ-hemolysin Reveals theβ-barrel Pore Formation Mechanism by Two Components (2011)
  • 著者名/発表者名: Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Yoshikazu Tanaka, Nagisa Hirano, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makoto Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, and Isao Tanaka
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 巻: 108 ページ: 17314-17319
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular basis of dihydrouridine formation on tRNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Futao Yu, Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Takeo Suzuki, Akiyoshi Nakamura, Nagisa Hirano, Tsutomu Suzuki, Min Yao, and Isao Tanaka
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 巻: 108 ページ: 19593-19598
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the functional region of Uro-adherence factor A(UafA) from Staphylococcus saprophyticus reveals participation of the B domain in ligand binding (2011)
  • 著者名/発表者名: Eriko Matsuoka, Yoshikazu Tanaka, Makoto Kuroda, Yuko Shouji, Toshiko Ohta, Isao Tanaka, and Min Yao
  • 雑誌名: Protein Science 巻: 20 ページ: 406-416
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and Mutational Analyses of the Receptor Binding Domain of Botulinum D/C Mosaic Neurotoxin : Insight into the Ganglioside Binding Mechanism (2011)
  • 著者名/発表者名: Nuemket Nipawan, Yoshikazu Tanaka, Kentaro Tsukamoto, Takao Tsuji, Keiji Nakamura, Shunji Kozaki, Min Yao, and Isao Tanaka
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 411 ページ: 433-439
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of dihydrouridine synthase from Thermus thermophilus and its complex with tRNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Futao Yu, Yoshikazu Tanaka, Shiho Yamamoto, Akiyoshi Nakamura, Shunsuke Kita, Nagisa Hirano, Isao Tanaka, and Min Yao
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F 巻: F67 ページ: 685-688
  • 査読あり
• [雑誌論文] 2-Methyl-2, 4-pentanediol induces spontaneous assembly of staphylococcal alpha-hemolysin into heptameric pore structure (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshikazu Tanaka, Nagisa Hirano, Jun Kaneko, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, and Isao Tanaka
  • 雑誌名: Potein Science 巻: 20 ページ: 448-456
  • 査読あり
• [学会発表] Crystal structure of pore-forming toxin from Staphylococcus aureus-An example of the utility of crystal structure analysis- (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makato Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, and Isao Tanaka
  • 学会等名: Japan-Australia Symposium on Plant Sciences for Agriculture(JAS2012)
  • 発表場所: 北海道大学(札幌市)
  • 年月日: 2012-01-20
• [学会発表] Crystal Structure of the Octameric Pore of Staphylococcal gamma-hemolysin (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Yuka Kawai, Nagisa Hirano, Jun Kaneko, Noriko Tomita, Makato Ohta, Yoshiyuki Kamio, Min Yao, and Isao Tanaka
  • 学会等名: The Eighth International Conference on Flow Dynamics(ICFD2011)
  • 発表場所: ホテルメトロポリタン仙台(仙台市)
  • 年月日: 2011-11-10
• [学会発表] 黄色ブドウ球菌由来巨大蛋白質Ebhの全体構造に関する研究 (2011)
  • 著者名/発表者名: 田中良和
  • 学会等名: 日本化学会東北支部化学系学協会東北大会
  • 発表場所: 東北大学(仙台市)
  • 年月日: 2011-09-17
• [学会発表] Crystal structure of dihydrouridine synthase in complex with RNA reveals its tRNA recognition and reaction mechanisms (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshikazu Tanaka, Futao Yu, Keitaro Yamashita, Akiyoshi Nakamura, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki, Min Yao, and Isao Tanaka
  • 学会等名: The 16th Annual Meeting of the RNA Society(Kyoto)
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
  • 年月日: 2011-06-17
• [学会発表] RNA binding mechanism of ThiI deduced from structural and binding analyses of a minimal RNA ligand (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshikazu Tanaka, Shiori Yamagata, Yu Kitago, Yoko Yamada, Sarin Chimnaronk, Min Yao and Isao Tanaka
  • 学会等名: Asian Crystallographic Association
  • 発表場所: Busan, Korea
  • 年月日: 20101031-1103
• [学会発表] 部分RNAの結晶構造解析から推察されたtRNAチオ化修飾酵素ThiIのtRNA認識機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中良和
  • 学会等名: 九州シンポジウム
  • 発表場所: 玄海ロイヤルホテル(宗像市)
  • 年月日: 20100909-11
• [備考]
  • URL: http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/